MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 7683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011981	GTC	2	6	43944	43949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102449
502	NC_011981	TTC	3	9	44040	44048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102449
503	NC_011981	CGG	2	6	44056	44061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102449
504	NC_011981	CGG	3	9	44110	44118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102449
505	NC_011981	ATC	2	6	44145	44150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102449
506	NC_011981	ATA	2	6	44211	44216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102449
507	NC_011981	GCT	2	6	44229	44234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102449
508	NC_011981	TTG	2	6	44275	44280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102449
509	NC_011981	CCA	2	6	44350	44355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102449
510	NC_011981	CGC	2	6	44393	44398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102449
511	NC_011981	GAA	2	6	44668	44673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102450
512	NC_011981	TAT	2	6	44724	44729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102450
513	NC_011981	TGG	2	6	44742	44747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102450
514	NC_011981	GAT	2	6	44824	44829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102450
515	NC_011981	GCA	2	6	45097	45102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102451
516	NC_011981	CGG	2	6	45148	45153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102451
517	NC_011981	TCG	2	6	45159	45164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102451
518	NC_011981	TGG	2	6	45201	45206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102451
519	NC_011981	AGG	2	6	45414	45419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102451
520	NC_011981	CAT	2	6	45667	45672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102451
521	NC_011981	GCC	2	6	45728	45733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102451
522	NC_011981	CAC	2	6	45736	45741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102451
523	NC_011981	GAG	2	6	45805	45810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102451
524	NC_011981	GAC	2	6	45857	45862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102451
525	NC_011981	GTG	2	6	46026	46031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102451
526	NC_011981	GCA	2	6	46154	46159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102452
527	NC_011981	CGG	2	6	46205	46210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102452
528	NC_011981	TCG	2	6	46216	46221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102452
529	NC_011981	TGG	2	6	46258	46263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102452
530	NC_011981	CGA	2	6	46406	46411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102452
531	NC_011981	CCA	2	6	46457	46462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102452
532	NC_011981	GAG	2	6	46470	46475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102452
533	NC_011981	TCT	2	6	46642	46647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102452
534	NC_011981	ACT	2	6	46674	46679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102452
535	NC_011981	ATG	2	6	46708	46713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102452
536	NC_011981	GAA	2	6	46728	46733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102452
537	NC_011981	CGA	2	6	46764	46769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102452
538	NC_011981	CGC	2	6	46793	46798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102452
539	NC_011981	GAT	2	6	46808	46813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102452
540	NC_011981	GAG	2	6	46862	46867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102452
541	NC_011981	ATT	2	6	46885	46890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102452
542	NC_011981	ATC	2	6	47073	47078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102452
543	NC_011981	AGT	2	6	47082	47087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102452
544	NC_011981	TTG	2	6	47107	47112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102452
545	NC_011981	CAG	2	6	47192	47197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102453
546	NC_011981	CAG	2	6	47218	47223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102453
547	NC_011981	TTC	2	6	47239	47244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102453
548	NC_011981	GCA	2	6	47328	47333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102453
549	NC_011981	CTG	2	6	47365	47370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102453
550	NC_011981	GCG	2	6	47377	47382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102453
551	NC_011981	ATC	2	6	47630	47635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102453
552	NC_011981	CGT	2	6	47726	47731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102453
553	NC_011981	CTT	2	6	47753	47758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102453
554	NC_011981	ATA	2	6	47885	47890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102453
555	NC_011981	GCC	2	6	47895	47900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102453
556	NC_011981	TGA	2	6	47962	47967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102453
557	NC_011981	CCA	2	6	47972	47977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102453
558	NC_011981	GTT	2	6	48142	48147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102453
559	NC_011981	AGG	2	6	48152	48157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102453
560	NC_011981	TTG	2	6	48213	48218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102453
561	NC_011981	TCG	2	6	48231	48236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102453
562	NC_011981	TCG	2	6	48345	48350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102453
563	NC_011981	GCG	2	6	48472	48477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102453
564	NC_011981	GAT	2	6	48503	48508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102453
565	NC_011981	CAC	2	6	48745	48750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102454
566	NC_011981	CGC	2	6	48822	48827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102454
567	NC_011981	CCA	2	6	48849	48854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102454
568	NC_011981	TCG	2	6	48857	48862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102454
569	NC_011981	ATC	2	6	48884	48889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102454
570	NC_011981	GTC	2	6	48964	48969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102454
571	NC_011981	TCT	2	6	49061	49066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102454
572	NC_011981	GTG	2	6	49083	49088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102454
573	NC_011981	CCT	2	6	49230	49235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102454
574	NC_011981	CAG	2	6	49419	49424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102454
575	NC_011981	CCA	2	6	49467	49472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102454
576	NC_011981	GCA	2	6	49592	49597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102454
577	NC_011981	GCG	2	6	49680	49685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102455
578	NC_011981	CGA	2	6	49702	49707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102455
579	NC_011981	CAT	2	6	49730	49735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102455
580	NC_011981	TGA	3	9	49756	49764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102455
581	NC_011981	GGT	2	6	49802	49807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102455
582	NC_011981	CCG	2	6	50020	50025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102455
583	NC_011981	CCG	2	6	50032	50037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102455
584	NC_011981	GCC	2	6	50115	50120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102455
585	NC_011981	AGA	2	6	50147	50152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102455
586	NC_011981	CCA	2	6	50163	50168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102455
587	NC_011981	CCG	2	6	50187	50192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102455
588	NC_011981	TGA	2	6	50202	50207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102455
589	NC_011981	TGA	2	6	50253	50258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102455
590	NC_011981	ATT	2	6	50279	50284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102455
591	NC_011981	GAA	2	6	50318	50323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102455
592	NC_011981	GCA	2	6	50395	50400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102455
593	NC_011981	TTG	2	6	50412	50417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102455
594	NC_011981	CAC	2	6	50456	50461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102455
595	NC_011981	CCA	2	6	50553	50558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102455
596	NC_011981	CAG	2	6	50583	50588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102455
597	NC_011981	GCG	2	6	50737	50742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102455
598	NC_011981	CCA	2	6	50821	50826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102455
599	NC_011981	CTT	2	6	50998	51003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102455
600	NC_011981	GCT	2	6	51043	51048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102455
601	NC_011981	CGA	2	6	51188	51193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102455
602	NC_011981	CTT	2	6	51319	51324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102455
603	NC_011981	GCA	2	6	51337	51342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102455
604	NC_011981	CGG	2	6	51389	51394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102455
605	NC_011981	GCG	2	6	51500	51505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102455
606	NC_011981	ACA	2	6	51508	51513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102455
607	NC_011981	CGG	2	6	51566	51571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102455
608	NC_011981	TTC	2	6	51680	51685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102455
609	NC_011981	GCA	2	6	51772	51777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102455
610	NC_011981	CGG	2	6	51835	51840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102455
611	NC_011981	CGT	2	6	51850	51855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102455
612	NC_011981	CGT	2	6	52272	52277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102456
613	NC_011981	ATC	2	6	52341	52346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102456
614	NC_011981	GCC	2	6	52352	52357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102456
615	NC_011981	CCA	2	6	52395	52400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102456
616	NC_011981	CGT	2	6	52448	52453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102456
617	NC_011981	TTG	2	6	52506	52511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102456
618	NC_011981	TGA	2	6	52576	52581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102457
619	NC_011981	CCG	2	6	52583	52588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102457
620	NC_011981	GGT	2	6	52615	52620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102457
621	NC_011981	ATC	2	6	52699	52704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102457
622	NC_011981	GAT	2	6	52816	52821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102457
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624	NC_011981	GTT	2	6	53391	53396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102458
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995	NC_011981	ATG	2	6	86171	86176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102490
996	NC_011981	ATG	2	6	86243	86248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102490
997	NC_011981	TCG	2	6	86267	86272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102490
998	NC_011981	GCT	2	6	86276	86281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102490
999	NC_011981	GGT	2	6	86309	86314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102490
1000	NC_011981	AGC	2	6	86345	86350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102490

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