MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 7683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011981	GCG	2	6	288400	288405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102652
3502	NC_011981	GCT	2	6	288448	288453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102652
3503	NC_011981	GAT	2	6	288476	288481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102652
3504	NC_011981	GCC	2	6	288507	288512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102652
3505	NC_011981	GGA	2	6	288589	288594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102652
3506	NC_011981	CCG	2	6	288696	288701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102652
3507	NC_011981	ATC	2	6	288728	288733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102652
3508	NC_011981	GGC	2	6	288757	288762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102652
3509	NC_011981	GTC	2	6	288895	288900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102652
3510	NC_011981	CTG	2	6	288917	288922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102652
3511	NC_011981	GAT	2	6	288956	288961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102652
3512	NC_011981	TGC	2	6	289054	289059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102652
3513	NC_011981	ATC	2	6	289073	289078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102652
3514	NC_011981	AGA	2	6	289090	289095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102652
3515	NC_011981	GCC	2	6	289106	289111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102652
3516	NC_011981	TGC	2	6	289257	289262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102652
3517	NC_011981	CTG	2	6	289268	289273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102652
3518	NC_011981	TGC	2	6	289291	289296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102652
3519	NC_011981	GCA	2	6	289361	289366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102652
3520	NC_011981	CTG	2	6	289473	289478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102652
3521	NC_011981	GAT	2	6	289490	289495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102652
3522	NC_011981	GCA	2	6	289521	289526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102652
3523	NC_011981	GAC	2	6	289613	289618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102652
3524	NC_011981	CTG	2	6	289622	289627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102652
3525	NC_011981	TGC	2	6	289698	289703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102652
3526	NC_011981	GCG	3	9	289851	289859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102652
3527	NC_011981	CTT	2	6	289874	289879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102652
3528	NC_011981	GCG	2	6	289880	289885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102652
3529	NC_011981	GCG	2	6	289966	289971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102652
3530	NC_011981	ACC	2	6	290059	290064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102652
3531	NC_011981	CGG	2	6	290089	290094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102652
3532	NC_011981	GGC	2	6	290363	290368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102652
3533	NC_011981	TGC	2	6	290472	290477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102652
3534	NC_011981	TCG	2	6	290533	290538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102652
3535	NC_011981	GCC	2	6	290618	290623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102652
3536	NC_011981	GCG	2	6	290682	290687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102652
3537	NC_011981	GCT	2	6	290695	290700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102652
3538	NC_011981	TGT	2	6	290701	290706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102652
3539	NC_011981	GCC	2	6	290792	290797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102652
3540	NC_011981	GTC	2	6	290889	290894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102652
3541	NC_011981	CGC	2	6	290964	290969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102653
3542	NC_011981	GCC	2	6	290970	290975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102653
3543	NC_011981	GCT	2	6	291037	291042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102653
3544	NC_011981	GCA	2	6	291101	291106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102653
3545	NC_011981	GTC	2	6	291137	291142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102653
3546	NC_011981	GTG	2	6	291204	291209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102653
3547	NC_011981	GAG	2	6	291212	291217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102653
3548	NC_011981	CTG	2	6	291284	291289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102653
3549	NC_011981	GCC	3	9	291374	291382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102653
3550	NC_011981	GCA	2	6	291435	291440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102653
3551	NC_011981	TGA	2	6	291453	291458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102653
3552	NC_011981	GCG	2	6	291667	291672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102653
3553	NC_011981	TGC	2	6	291735	291740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102653
3554	NC_011981	TCG	2	6	291855	291860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102653
3555	NC_011981	CGG	2	6	291881	291886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102653
3556	NC_011981	GCG	2	6	291923	291928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102653
3557	NC_011981	ACG	2	6	291938	291943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102653
3558	NC_011981	GCT	2	6	291952	291957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102653
3559	NC_011981	GCT	3	9	292033	292041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102653
3560	NC_011981	TGC	2	6	292083	292088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102653
3561	NC_011981	ATC	2	6	292226	292231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102653
3562	NC_011981	CGA	2	6	292458	292463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102654
3563	NC_011981	CGA	2	6	292500	292505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102654
3564	NC_011981	GGT	2	6	292577	292582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102654
3565	NC_011981	TGC	2	6	292626	292631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102654
3566	NC_011981	GAA	2	6	292664	292669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102654
3567	NC_011981	GAC	2	6	292886	292891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102654
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3569	NC_011981	CGA	2	6	293976	293981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102655
3570	NC_011981	GCG	2	6	294003	294008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102655
3571	NC_011981	CTG	2	6	294012	294017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102655
3572	NC_011981	GTC	2	6	294062	294067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102655
3573	NC_011981	CCT	2	6	294215	294220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102655
3574	NC_011981	CCA	2	6	294227	294232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102655
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3577	NC_011981	ACG	2	6	294395	294400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102655
3578	NC_011981	CGG	2	6	294405	294410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102655
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3581	NC_011981	CGG	2	6	296076	296081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102657
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3584	NC_011981	TCA	2	6	296450	296455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102657
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3586	NC_011981	AAG	2	6	296638	296643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102657
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3588	NC_011981	TCG	2	6	296840	296845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102657
3589	NC_011981	TTC	2	6	296897	296902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102657
3590	NC_011981	TTC	2	6	296924	296929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102657
3591	NC_011981	GAA	2	6	296997	297002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102657
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3599	NC_011981	GAA	2	6	297286	297291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102657
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3601	NC_011981	ATC	2	6	297354	297359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102657
3602	NC_011981	AGC	2	6	297492	297497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102657
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3604	NC_011981	GCC	3	9	297574	297582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102657
3605	NC_011981	TGG	2	6	297630	297635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102657
3606	NC_011981	CAG	2	6	297769	297774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102657
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3612	NC_011981	GCC	2	6	297952	297957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102657
3613	NC_011981	CAG	2	6	297997	298002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102657
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3618	NC_011981	TTG	3	9	299286	299294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102658
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3855	NC_011981	GGC	2	6	316615	316620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102671
3856	NC_011981	TGA	2	6	316917	316922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102671
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3973	NC_011981	CGC	2	6	325306	325311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102677
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3977	NC_011981	CGC	2	6	325626	325631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102678
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