MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 7683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_011981	AAC	2	6	616819	616824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102930
7502	NC_011981	GCC	2	6	616927	616932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102930
7503	NC_011981	CAA	2	6	617031	617036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102930
7504	NC_011981	GCC	2	6	617102	617107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102930
7505	NC_011981	GCT	2	6	617112	617117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102930
7506	NC_011981	ATG	2	6	617246	617251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102930
7507	NC_011981	CGA	2	6	617380	617385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102931
7508	NC_011981	CCT	2	6	617446	617451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102931
7509	NC_011981	TCA	2	6	617511	617516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102931
7510	NC_011981	CCA	2	6	617533	617538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102931
7511	NC_011981	TGA	2	6	617605	617610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102931
7512	NC_011981	CTT	2	6	617618	617623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102931
7513	NC_011981	TGG	2	6	617710	617715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102931
7514	NC_011981	CAC	2	6	617752	617757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102931
7515	NC_011981	CTC	2	6	617804	617809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102931
7516	NC_011981	GCC	2	6	617990	617995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102931
7517	NC_011981	CGG	2	6	618124	618129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102931
7518	NC_011981	GCG	2	6	618139	618144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102931
7519	NC_011981	CGA	2	6	618163	618168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102931
7520	NC_011981	GCG	2	6	618365	618370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102931
7521	NC_011981	TTC	2	6	618413	618418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102931
7522	NC_011981	GCG	2	6	618473	618478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102931
7523	NC_011981	CAG	2	6	618481	618486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102931
7524	NC_011981	CTT	2	6	618532	618537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102931
7525	NC_011981	GAG	2	6	618545	618550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102931
7526	NC_011981	ACC	2	6	618567	618572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102931
7527	NC_011981	ACC	2	6	618603	618608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102931
7528	NC_011981	GCA	2	6	618631	618636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102931
7529	NC_011981	TTG	2	6	618803	618808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102931
7530	NC_011981	GAT	2	6	619064	619069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102932
7531	NC_011981	GCA	2	6	619082	619087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102932
7532	NC_011981	CAG	2	6	619204	619209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102932
7533	NC_011981	CTG	3	9	619332	619340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102932
7534	NC_011981	GCC	2	6	619419	619424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102932
7535	NC_011981	GCA	2	6	619442	619447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102932
7536	NC_011981	GCA	2	6	619478	619483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102932
7537	NC_011981	ACG	2	6	619515	619520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102932
7538	NC_011981	GCA	2	6	619641	619646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102932
7539	NC_011981	TGA	2	6	619752	619757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102932
7540	NC_011981	ATG	2	6	619762	619767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102932
7541	NC_011981	GGC	2	6	620299	620304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102933
7542	NC_011981	GTG	2	6	620310	620315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102933
7543	NC_011981	GCT	2	6	620353	620358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102933
7544	NC_011981	ATG	2	6	620439	620444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102933
7545	NC_011981	TCG	2	6	620466	620471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102933
7546	NC_011981	GCC	2	6	620493	620498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102933
7547	NC_011981	TGG	2	6	620505	620510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102933
7548	NC_011981	CTA	2	6	620542	620547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102933
7549	NC_011981	GAA	2	6	620560	620565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102933
7550	NC_011981	TGC	2	6	620587	620592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102933
7551	NC_011981	CGA	2	6	620668	620673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102933
7552	NC_011981	TCT	2	6	620691	620696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102933
7553	NC_011981	CGG	2	6	620715	620720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102933
7554	NC_011981	GGC	2	6	620854	620859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102933
7555	NC_011981	CGG	2	6	620877	620882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102933
7556	NC_011981	CGG	2	6	620972	620977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102933
7557	NC_011981	CAT	2	6	621058	621063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102933
7558	NC_011981	ATG	2	6	621087	621092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102933
7559	NC_011981	TGG	2	6	621114	621119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102933
7560	NC_011981	CAT	2	6	621205	621210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102933
7561	NC_011981	CAA	2	6	621214	621219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102933
7562	NC_011981	GCG	2	6	621239	621244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102933
7563	NC_011981	GCT	2	6	621292	621297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102933
7564	NC_011981	CGG	2	6	621381	621386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102933
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7567	NC_011981	GCC	2	6	621572	621577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102933
7568	NC_011981	GCA	2	6	621595	621600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102933
7569	NC_011981	TAT	2	6	621659	621664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102933
7570	NC_011981	CAT	2	6	621691	621696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102933
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7572	NC_011981	TGC	2	6	622022	622027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102934
7573	NC_011981	CGG	2	6	622045	622050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102934
7574	NC_011981	GCC	3	9	622053	622061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102934
7575	NC_011981	TGC	2	6	622124	622129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102934
7576	NC_011981	TGG	2	6	622150	622155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102934
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7578	NC_011981	GCC	2	6	622276	622281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102934
7579	NC_011981	GCT	2	6	622371	622376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102934
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7581	NC_011981	CGT	2	6	622461	622466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102934
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7588	NC_011981	GCA	2	6	622964	622969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102935
7589	NC_011981	GCG	2	6	623044	623049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102935
7590	NC_011981	GGC	2	6	623102	623107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102935
7591	NC_011981	GCG	2	6	623116	623121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102935
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7599	NC_011981	GCA	2	6	623695	623700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102935
7600	NC_011981	AAG	2	6	623805	623810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102935
7601	NC_011981	TTG	2	6	623850	623855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102935
7602	NC_011981	GGC	2	6	623998	624003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102935
7603	NC_011981	CGG	2	6	624092	624097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102935
7604	NC_011981	TGC	2	6	624107	624112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102935
7605	NC_011981	CCG	2	6	624135	624140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102935
7606	NC_011981	GCG	2	6	624259	624264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102935
7607	NC_011981	ACG	2	6	624267	624272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102935
7608	NC_011981	CGA	2	6	624273	624278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102935
7609	NC_011981	TGG	2	6	624330	624335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102935
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7616	NC_011981	ACA	2	6	624631	624636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102936
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