MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 46008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015942	GGC	2	6	64387	64392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198294
1002	NC_015942	CAA	2	6	64434	64439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198294
1003	NC_015942	GCC	2	6	64547	64552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198294
1004	NC_015942	CGG	2	6	64593	64598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198294
1005	NC_015942	GAA	2	6	64828	64833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198294
1006	NC_015942	GCC	2	6	65119	65124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198294
1007	NC_015942	GCC	2	6	65141	65146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198294
1008	NC_015942	ACA	2	6	65183	65188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198294
1009	NC_015942	ATC	2	6	65224	65229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198294
1010	NC_015942	ACG	2	6	65306	65311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198294
1011	NC_015942	CAT	2	6	65370	65375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198294
1012	NC_015942	TCC	2	6	65393	65398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198294
1013	NC_015942	TGG	2	6	65478	65483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_015942	AGG	2	6	65496	65501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_015942	GTC	2	6	65571	65576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198295
1016	NC_015942	TGG	2	6	65657	65662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198295
1017	NC_015942	ATC	2	6	65692	65697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198295
1018	NC_015942	GTG	2	6	65711	65716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198295
1019	NC_015942	GCT	3	9	65733	65741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198295
1020	NC_015942	CCA	2	6	65891	65896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198295
1021	NC_015942	GGC	3	9	65979	65987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198295
1022	NC_015942	CGG	2	6	66022	66027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198295
1023	NC_015942	CTG	2	6	66124	66129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198295
1024	NC_015942	ATG	2	6	66146	66151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198295
1025	NC_015942	ATG	2	6	66157	66162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198295
1026	NC_015942	CGC	2	6	66168	66173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198295
1027	NC_015942	CAG	2	6	66214	66219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198295
1028	NC_015942	CCG	2	6	66278	66283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198295
1029	NC_015942	CAT	2	6	66291	66296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198295
1030	NC_015942	GGC	2	6	66312	66317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198295
1031	NC_015942	GCC	2	6	66334	66339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198295
1032	NC_015942	ATT	2	6	66400	66405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198295
1033	NC_015942	TGG	2	6	66467	66472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198295
1034	NC_015942	CAT	2	6	66588	66593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198295
1035	NC_015942	TGA	2	6	66659	66664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198295
1036	NC_015942	GCT	2	6	66669	66674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198295
1037	NC_015942	CGC	2	6	66726	66731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198295
1038	NC_015942	CGC	2	6	66955	66960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198296
1039	NC_015942	CAA	2	6	66982	66987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198296
1040	NC_015942	ACT	2	6	66988	66993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198296
1041	NC_015942	CCG	2	6	67011	67016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198296
1042	NC_015942	GCC	2	6	67241	67246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198296
1043	NC_015942	CGC	2	6	67270	67275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198296
1044	NC_015942	GGC	3	9	67366	67374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198296
1045	NC_015942	TCA	2	6	67521	67526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198296
1046	NC_015942	CGA	3	9	67594	67602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198296
1047	NC_015942	GCG	2	6	67777	67782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198297
1048	NC_015942	GAT	2	6	67842	67847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198297
1049	NC_015942	TGC	2	6	67852	67857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198297
1050	NC_015942	CGG	2	6	67975	67980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198297
1051	NC_015942	TTG	2	6	68051	68056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198298
1052	NC_015942	CTG	2	6	68066	68071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198298
1053	NC_015942	GTG	2	6	68156	68161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198298
1054	NC_015942	GTG	2	6	68184	68189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198298
1055	NC_015942	CCG	2	6	68222	68227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198298
1056	NC_015942	GCA	2	6	68261	68266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198298
1057	NC_015942	AAC	2	6	68336	68341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198298
1058	NC_015942	CGC	2	6	68373	68378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198298
1059	NC_015942	GCA	2	6	68452	68457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198298
1060	NC_015942	TCC	2	6	68476	68481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198298
1061	NC_015942	TGC	2	6	68502	68507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198298
1062	NC_015942	ATT	2	6	68596	68601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198299
1063	NC_015942	GAA	2	6	68671	68676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198299
1064	NC_015942	GTA	2	6	68816	68821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_015942	CGC	2	6	68853	68858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_015942	TCA	2	6	68965	68970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_015942	TGT	2	6	68980	68985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015942	GGC	2	6	69070	69075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_015942	AGA	2	6	69094	69099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015942	AAC	2	6	69113	69118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_015942	CAG	2	6	69258	69263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_015942	TGG	2	6	69292	69297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198300
1073	NC_015942	TGC	2	6	69373	69378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198300
1074	NC_015942	CTG	2	6	69384	69389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198300
1075	NC_015942	AGT	2	6	69432	69437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198300
1076	NC_015942	CGC	3	9	69443	69451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198300
1077	NC_015942	CGC	2	6	69689	69694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198300
1078	NC_015942	TGG	2	6	69709	69714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198300
1079	NC_015942	TAT	2	6	69971	69976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198301
1080	NC_015942	TTG	2	6	69988	69993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198301
1081	NC_015942	CCG	2	6	70024	70029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198301
1082	NC_015942	ACC	2	6	70074	70079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198301
1083	NC_015942	GTA	2	6	70125	70130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198301
1084	NC_015942	CTG	2	6	70167	70172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198301
1085	NC_015942	ATC	2	6	70240	70245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198301
1086	NC_015942	CCA	2	6	70306	70311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198301
1087	NC_015942	ACT	2	6	70419	70424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198301
1088	NC_015942	TGC	2	6	70469	70474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198301
1089	NC_015942	CAA	2	6	70479	70484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198301
1090	NC_015942	TAT	2	6	70487	70492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198301
1091	NC_015942	CAA	2	6	70520	70525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198301
1092	NC_015942	ATA	2	6	70602	70607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198301
1093	NC_015942	GGT	2	6	70635	70640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198301
1094	NC_015942	CAC	2	6	70700	70705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198301
1095	NC_015942	CAC	2	6	70718	70723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198301
1096	NC_015942	GTA	2	6	70755	70760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198301
1097	NC_015942	ATT	2	6	70881	70886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198301
1098	NC_015942	ATT	2	6	70903	70908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198301
1099	NC_015942	AGT	2	6	70927	70932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198301
1100	NC_015942	ATG	2	6	70979	70984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198301
1101	NC_015942	CAT	2	6	70995	71000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198301
1102	NC_015942	GGT	2	6	71001	71006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198301
1103	NC_015942	ACC	2	6	71115	71120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198301
1104	NC_015942	AGA	2	6	71130	71135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198301
1105	NC_015942	AGT	2	6	71174	71179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198301
1106	NC_015942	GAA	2	6	71214	71219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198301
1107	NC_015942	AAT	2	6	71284	71289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198301
1108	NC_015942	GAA	2	6	71456	71461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198302
1109	NC_015942	CAT	2	6	71523	71528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198302
1110	NC_015942	ACA	2	6	71571	71576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198302
1111	NC_015942	TTA	2	6	71651	71656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198302
1112	NC_015942	CAA	2	6	71739	71744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198302
1113	NC_015942	AAG	2	6	71908	71913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198302
1114	NC_015942	TGC	2	6	71916	71921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198302
1115	NC_015942	TTA	2	6	72036	72041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198302
1116	NC_015942	TAA	2	6	72173	72178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198303
1117	NC_015942	CGA	2	6	72230	72235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198303
1118	NC_015942	ATA	2	6	72401	72406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198303
1119	NC_015942	TGC	2	6	72435	72440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198303
1120	NC_015942	TGT	2	6	72540	72545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198303
1121	NC_015942	AGA	2	6	72850	72855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198303
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1123	NC_015942	GAT	2	6	72958	72963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198303
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1246	NC_015942	GCC	2	6	83015	83020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1491	NC_015942	CCA	2	6	99580	99585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198324
1492	NC_015942	GTG	2	6	99731	99736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198324
1493	NC_015942	GGT	2	6	99755	99760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198324
1494	NC_015942	TCC	2	6	99841	99846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1495	NC_015942	TCC	2	6	99931	99936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1496	NC_015942	TGC	2	6	100012	100017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1497	NC_015942	GTC	2	6	100071	100076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1498	NC_015942	TCA	2	6	100159	100164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198325
1499	NC_015942	GAT	2	6	100324	100329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1500	NC_015942	GCG	2	6	100352	100357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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