MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 46008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015942	CAA	2	6	223160	223165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198444
3502	NC_015942	GAT	2	6	223239	223244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198444
3503	NC_015942	ATG	2	6	223335	223340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198444
3504	NC_015942	GAG	2	6	223425	223430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198444
3505	NC_015942	CCG	2	6	223431	223436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198444
3506	NC_015942	GCA	3	9	223471	223479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198444
3507	NC_015942	GAT	2	6	223496	223501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198444
3508	NC_015942	CTG	2	6	223596	223601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198444
3509	NC_015942	CCG	2	6	223617	223622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198444
3510	NC_015942	CCA	2	6	223712	223717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198444
3511	NC_015942	TCG	2	6	223759	223764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198444
3512	NC_015942	CAC	2	6	223821	223826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198445
3513	NC_015942	GCT	2	6	223829	223834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198445
3514	NC_015942	GCG	2	6	223920	223925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198445
3515	NC_015942	GAT	2	6	224198	224203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198445
3516	NC_015942	TCA	2	6	224242	224247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198445
3517	NC_015942	GGC	2	6	224284	224289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198445
3518	NC_015942	CGT	2	6	224465	224470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_015942	GAT	2	6	224672	224677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_015942	GCG	2	6	224681	224686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_015942	CCA	2	6	224697	224702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3522	NC_015942	TCA	2	6	224838	224843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_015942	TGA	2	6	224985	224990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_015942	AAC	2	6	225067	225072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_015942	CAT	2	6	225145	225150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_015942	TTA	2	6	225175	225180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_015942	CGG	2	6	225271	225276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_015942	CTG	2	6	225499	225504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198446
3529	NC_015942	AGC	2	6	225510	225515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198446
3530	NC_015942	GAG	2	6	225521	225526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198446
3531	NC_015942	GCG	2	6	225574	225579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198446
3532	NC_015942	TGA	2	6	225593	225598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198446
3533	NC_015942	CAT	2	6	225625	225630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198446
3534	NC_015942	ATG	2	6	225643	225648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198446
3535	NC_015942	GGC	2	6	225696	225701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198446
3536	NC_015942	GTG	2	6	225761	225766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198446
3537	NC_015942	GGT	2	6	225835	225840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198446
3538	NC_015942	TGA	2	6	225875	225880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198446
3539	NC_015942	TAT	2	6	225984	225989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198446
3540	NC_015942	CAT	2	6	226024	226029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198446
3541	NC_015942	TAT	2	6	226060	226065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198446
3542	NC_015942	GTC	2	6	226180	226185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198446
3543	NC_015942	CTA	2	6	226244	226249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198446
3544	NC_015942	CCG	2	6	226544	226549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_015942	GCG	2	6	226552	226557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_015942	GAG	2	6	226606	226611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_015942	GTA	2	6	226676	226681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198447
3548	NC_015942	ATG	2	6	226745	226750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198447
3549	NC_015942	TCA	2	6	226756	226761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198447
3550	NC_015942	GGC	2	6	226848	226853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198447
3551	NC_015942	CAG	2	6	227069	227074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198447
3552	NC_015942	CGG	2	6	227178	227183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198448
3553	NC_015942	CTG	2	6	227195	227200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198448
3554	NC_015942	TGA	3	9	227203	227211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198448
3555	NC_015942	GTC	2	6	227261	227266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198448
3556	NC_015942	CGC	2	6	227269	227274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198448
3557	NC_015942	ATC	2	6	227408	227413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198448
3558	NC_015942	CGA	2	6	227470	227475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198448
3559	NC_015942	GCC	2	6	227497	227502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198448
3560	NC_015942	GAG	2	6	227633	227638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198448
3561	NC_015942	CTG	2	6	227720	227725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198448
3562	NC_015942	ACG	3	9	227742	227750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198448
3563	NC_015942	GCC	2	6	227796	227801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198448
3564	NC_015942	TCG	2	6	227802	227807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198448
3565	NC_015942	CGG	2	6	227875	227880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198448
3566	NC_015942	AGG	2	6	227899	227904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198448
3567	NC_015942	TCA	2	6	227966	227971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198449
3568	NC_015942	GCT	4	12	227979	227990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198449
3569	NC_015942	GGC	2	6	228042	228047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198449
3570	NC_015942	CTG	2	6	228217	228222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198449
3571	NC_015942	GGC	2	6	228366	228371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198449
3572	NC_015942	TGC	2	6	228377	228382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198449
3573	NC_015942	GCG	3	9	228464	228472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198449
3574	NC_015942	ACG	2	6	228475	228480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198449
3575	NC_015942	GCG	2	6	228513	228518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198449
3576	NC_015942	TGG	2	6	228587	228592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198449
3577	NC_015942	CGC	2	6	228614	228619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198449
3578	NC_015942	GAG	2	6	228658	228663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198449
3579	NC_015942	GTG	2	6	228671	228676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198449
3580	NC_015942	CCA	2	6	228714	228719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198449
3581	NC_015942	GCG	2	6	228740	228745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198449
3582	NC_015942	CAG	2	6	228805	228810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198449
3583	NC_015942	GTG	2	6	228817	228822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198449
3584	NC_015942	CGG	2	6	228953	228958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198449
3585	NC_015942	GCG	2	6	228959	228964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198449
3586	NC_015942	GCG	2	6	229052	229057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198449
3587	NC_015942	TCG	2	6	229079	229084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198449
3588	NC_015942	GGC	2	6	229138	229143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198449
3589	NC_015942	CGG	2	6	229243	229248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198450
3590	NC_015942	GCC	3	9	229389	229397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198450
3591	NC_015942	CTG	2	6	229399	229404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198450
3592	NC_015942	CTG	2	6	229427	229432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198450
3593	NC_015942	CCA	2	6	229439	229444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198450
3594	NC_015942	GAA	2	6	229445	229450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198450
3595	NC_015942	CCG	2	6	229456	229461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198450
3596	NC_015942	AAC	2	6	229618	229623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_015942	AGG	2	6	229655	229660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_015942	CGG	2	6	229699	229704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198451
3599	NC_015942	ATC	2	6	229953	229958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198451
3600	NC_015942	AAG	2	6	229971	229976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198451
3601	NC_015942	TCC	2	6	230119	230124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198451
3602	NC_015942	CCA	2	6	230168	230173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198451
3603	NC_015942	CTG	2	6	230217	230222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198451
3604	NC_015942	CGG	3	9	230229	230237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198451
3605	NC_015942	TGC	2	6	230245	230250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198451
3606	NC_015942	TGC	2	6	230258	230263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198451
3607	NC_015942	ACC	2	6	230277	230282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198451
3608	NC_015942	AGA	2	6	230518	230523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198451
3609	NC_015942	TCG	2	6	230578	230583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198451
3610	NC_015942	TGC	2	6	230704	230709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198451
3611	NC_015942	GTG	2	6	230829	230834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198451
3612	NC_015942	CGC	2	6	230911	230916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198451
3613	NC_015942	GGC	2	6	230963	230968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198451
3614	NC_015942	GCC	2	6	231009	231014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198451
3615	NC_015942	TCC	3	9	231075	231083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198452
3616	NC_015942	TGC	2	6	231084	231089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198452
3617	NC_015942	GCC	2	6	231136	231141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198452
3618	NC_015942	CTG	2	6	231225	231230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198452
3619	NC_015942	GCG	2	6	231337	231342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198453
3620	NC_015942	TGC	2	6	231497	231502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198453
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3622	NC_015942	TGC	2	6	231567	231572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198453
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3741	NC_015942	GCA	2	6	239738	239743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198463
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3770	NC_015942	ACT	2	6	242384	242389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198464
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3979	NC_015942	GCC	3	9	255264	255272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198474
3980	NC_015942	ATC	2	6	255328	255333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198474
3981	NC_015942	TGA	2	6	255374	255379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198474
3982	NC_015942	GGC	2	6	255390	255395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198474
3983	NC_015942	GCG	2	6	255436	255441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198474
3984	NC_015942	GTG	2	6	255442	255447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198474
3985	NC_015942	CGA	2	6	255512	255517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198474
3986	NC_015942	TGT	2	6	255545	255550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198474
3987	NC_015942	CGG	2	6	255578	255583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198474
3988	NC_015942	GAC	2	6	255651	255656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198474
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3991	NC_015942	TCC	2	6	255752	255757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3998	NC_015942	TAG	2	6	256278	256283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198476
3999	NC_015942	GCC	2	6	256318	256323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198476
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