MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 46008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015942	CCG	2	6	288182	288187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198500
4502	NC_015942	AGG	2	6	288212	288217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198500
4503	NC_015942	CCG	2	6	288223	288228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198500
4504	NC_015942	GCC	2	6	288252	288257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4505	NC_015942	GCC	2	6	288281	288286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198501
4506	NC_015942	TGG	2	6	288299	288304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198501
4507	NC_015942	TCA	2	6	288381	288386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198501
4508	NC_015942	CGG	2	6	288640	288645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198501
4509	NC_015942	AGG	2	6	288660	288665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198501
4510	NC_015942	GAT	2	6	288724	288729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198501
4511	NC_015942	ATC	2	6	288785	288790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198501
4512	NC_015942	GTG	2	6	288901	288906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198501
4513	NC_015942	CCT	2	6	288976	288981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198501
4514	NC_015942	CAG	2	6	289049	289054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198501
4515	NC_015942	GCG	2	6	289065	289070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198501
4516	NC_015942	CCT	2	6	289099	289104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198501
4517	NC_015942	CTG	2	6	289151	289156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198501
4518	NC_015942	ATG	2	6	289182	289187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198501
4519	NC_015942	TCC	2	6	289192	289197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198502
4520	NC_015942	GCT	2	6	289337	289342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198502
4521	NC_015942	GAT	2	6	289449	289454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198502
4522	NC_015942	CGG	2	6	289460	289465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198502
4523	NC_015942	GGT	2	6	289569	289574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198502
4524	NC_015942	GCA	2	6	289607	289612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198502
4525	NC_015942	CGC	3	9	289625	289633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198502
4526	NC_015942	CAC	2	6	289644	289649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198502
4527	NC_015942	GGT	2	6	289842	289847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198502
4528	NC_015942	ATG	3	9	289873	289881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198502
4529	NC_015942	TGC	2	6	289891	289896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198502
4530	NC_015942	TCC	2	6	289954	289959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198502
4531	NC_015942	CTT	2	6	289971	289976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198502
4532	NC_015942	CCA	2	6	290066	290071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198502
4533	NC_015942	TCA	2	6	290083	290088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198502
4534	NC_015942	CGG	2	6	290092	290097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198502
4535	NC_015942	GAT	2	6	290121	290126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198502
4536	NC_015942	CTG	2	6	290146	290151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198502
4537	NC_015942	GCC	2	6	290164	290169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198502
4538	NC_015942	TCA	2	6	290200	290205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198502
4539	NC_015942	TCC	2	6	290251	290256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198502
4540	NC_015942	GCG	2	6	290370	290375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198502
4541	NC_015942	TTC	2	6	290379	290384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198502
4542	NC_015942	CGT	2	6	290474	290479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198502
4543	NC_015942	TGC	2	6	290549	290554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198502
4544	NC_015942	CGA	2	6	290630	290635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198502
4545	NC_015942	TCG	2	6	290641	290646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198502
4546	NC_015942	GCC	2	6	290706	290711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198502
4547	NC_015942	TGT	2	6	290929	290934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198503
4548	NC_015942	GTC	2	6	291047	291052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198503
4549	NC_015942	TTC	2	6	291176	291181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198503
4550	NC_015942	ATT	2	6	291272	291277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198503
4551	NC_015942	CAG	2	6	291394	291399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198503
4552	NC_015942	GAT	2	6	291497	291502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198503
4553	NC_015942	TGG	2	6	291511	291516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198503
4554	NC_015942	AGG	2	6	291741	291746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198503
4555	NC_015942	AAT	2	6	291860	291865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198503
4556	NC_015942	ACC	2	6	291963	291968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198503
4557	NC_015942	GCG	2	6	291972	291977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198503
4558	NC_015942	TTC	2	6	291980	291985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198503
4559	NC_015942	CGA	2	6	292057	292062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198503
4560	NC_015942	TCG	2	6	292114	292119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198503
4561	NC_015942	ATC	2	6	292245	292250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198503
4562	NC_015942	CCG	2	6	292456	292461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198504
4563	NC_015942	CGC	3	9	292479	292487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198504
4564	NC_015942	GCT	2	6	292656	292661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198504
4565	NC_015942	GGA	2	6	292674	292679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198504
4566	NC_015942	GCG	2	6	292783	292788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198504
4567	NC_015942	GAC	2	6	293025	293030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198504
4568	NC_015942	ACC	3	9	293119	293127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198504
4569	NC_015942	GCT	2	6	293171	293176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198504
4570	NC_015942	CGA	2	6	293246	293251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198504
4571	NC_015942	GGT	2	6	293299	293304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198504
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4573	NC_015942	CAA	2	6	293468	293473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198505
4574	NC_015942	ACG	2	6	293580	293585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198506
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4579	NC_015942	GCA	2	6	293725	293730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198506
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4582	NC_015942	TCC	2	6	293963	293968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198506
4583	NC_015942	TCC	2	6	294012	294017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198506
4584	NC_015942	GCG	2	6	294115	294120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198506
4585	NC_015942	CGG	2	6	294127	294132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198506
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4587	NC_015942	CGG	2	6	294379	294384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198507
4588	NC_015942	GCG	2	6	294507	294512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198507
4589	NC_015942	CAT	2	6	294652	294657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198507
4590	NC_015942	GCC	2	6	294744	294749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198507
4591	NC_015942	GCC	2	6	294927	294932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198507
4592	NC_015942	CAG	2	6	295059	295064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198508
4593	NC_015942	CAT	2	6	295293	295298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198508
4594	NC_015942	CAG	2	6	295410	295415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198508
4595	NC_015942	GGA	2	6	295503	295508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198508
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4597	NC_015942	TGG	2	6	295594	295599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198508
4598	NC_015942	TAG	2	6	295948	295953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198508
4599	NC_015942	CTC	2	6	295993	295998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4600	NC_015942	CAG	2	6	296015	296020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198509
4601	NC_015942	GGC	2	6	296021	296026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198509
4602	NC_015942	GTG	2	6	296105	296110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198509
4603	NC_015942	GCG	2	6	296221	296226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198509
4604	NC_015942	ACC	2	6	296292	296297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198509
4605	NC_015942	GTC	2	6	296450	296455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198509
4606	NC_015942	TGG	2	6	296543	296548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198509
4607	NC_015942	AGT	2	6	296602	296607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198509
4608	NC_015942	TGT	2	6	296624	296629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198509
4609	NC_015942	GGA	2	6	296891	296896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198509
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4611	NC_015942	CGG	2	6	297058	297063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198509
4612	NC_015942	GCC	2	6	297089	297094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198509
4613	NC_015942	GCA	2	6	297150	297155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198509
4614	NC_015942	GAA	2	6	297175	297180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198509
4615	NC_015942	TGG	2	6	297220	297225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198509
4616	NC_015942	CCG	2	6	297268	297273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198509
4617	NC_015942	GCG	3	9	297450	297458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198509
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4619	NC_015942	TAC	2	6	297533	297538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198509
4620	NC_015942	CGG	2	6	297550	297555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198509
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4622	NC_015942	GTT	2	6	297613	297618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198509
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4632	NC_015942	ATG	3	9	298324	298332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4739	NC_015942	CCG	2	6	306074	306079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198520
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4857	NC_015942	GGT	2	6	313079	313084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198528
4858	NC_015942	TCG	2	6	313089	313094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198528
4859	NC_015942	CGG	2	6	313122	313127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198528
4860	NC_015942	GTC	2	6	313176	313181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198528
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4913	NC_015942	CGT	2	6	316545	316550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4956	NC_015942	AGT	2	6	319987	319992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4974	NC_015942	TCG	2	6	321355	321360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198534
4975	NC_015942	GAT	2	6	321397	321402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198534
4976	NC_015942	TGT	2	6	321497	321502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198534
4977	NC_015942	CGA	2	6	321564	321569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198534
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4979	NC_015942	GTG	2	6	321743	321748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198535
4980	NC_015942	TGG	2	6	321750	321755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198535
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4983	NC_015942	GCT	2	6	321886	321891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198535
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4997	NC_015942	TTC	2	6	322532	322537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198535
4998	NC_015942	TGC	2	6	322548	322553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198535
4999	NC_015942	TCG	3	9	322578	322586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198535
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