MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 46008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015942	GCG	2	6	390849	390854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198595
6002	NC_015942	GTG	2	6	390855	390860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198595
6003	NC_015942	TGC	2	6	390886	390891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198595
6004	NC_015942	TGC	2	6	390968	390973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198595
6005	NC_015942	AAG	2	6	391014	391019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198595
6006	NC_015942	ACG	2	6	391141	391146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198595
6007	NC_015942	CCG	2	6	391172	391177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198595
6008	NC_015942	CTA	2	6	391205	391210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198595
6009	NC_015942	CGA	2	6	391235	391240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198595
6010	NC_015942	GAA	2	6	391320	391325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198595
6011	NC_015942	GGC	2	6	391364	391369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198595
6012	NC_015942	CTG	3	9	391470	391478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198596
6013	NC_015942	TTG	2	6	391505	391510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198596
6014	NC_015942	AGC	2	6	391892	391897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198597
6015	NC_015942	CTG	2	6	391915	391920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198597
6016	NC_015942	GCA	2	6	391984	391989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198597
6017	NC_015942	GAC	2	6	391996	392001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198597
6018	NC_015942	CAA	2	6	392218	392223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198597
6019	NC_015942	GGT	2	6	392284	392289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198597
6020	NC_015942	CAC	2	6	392298	392303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198597
6021	NC_015942	TGA	2	6	392309	392314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198597
6022	NC_015942	GCC	2	6	392323	392328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198597
6023	NC_015942	TGG	2	6	392366	392371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198597
6024	NC_015942	TTC	2	6	392500	392505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198597
6025	NC_015942	ACC	2	6	392660	392665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198597
6026	NC_015942	CTT	2	6	392772	392777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198597
6027	NC_015942	GCC	2	6	392828	392833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198597
6028	NC_015942	CCG	2	6	392847	392852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198597
6029	NC_015942	AGC	2	6	392864	392869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198597
6030	NC_015942	GAC	2	6	392872	392877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198597
6031	NC_015942	GGT	2	6	392889	392894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198597
6032	NC_015942	TGA	2	6	392976	392981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198597
6033	NC_015942	TCT	2	6	393181	393186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198597
6034	NC_015942	GCC	2	6	393229	393234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198597
6035	NC_015942	CTG	2	6	393325	393330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198597
6036	NC_015942	CTT	2	6	393402	393407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198597
6037	NC_015942	GCA	2	6	393431	393436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198597
6038	NC_015942	CGC	2	6	393605	393610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198597
6039	NC_015942	GGA	2	6	393621	393626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198597
6040	NC_015942	CAA	2	6	393649	393654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198597
6041	NC_015942	ACG	2	6	393755	393760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198597
6042	NC_015942	TGC	2	6	393797	393802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198597
6043	NC_015942	GTT	2	6	393906	393911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198597
6044	NC_015942	TGT	2	6	393974	393979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198597
6045	NC_015942	ATT	2	6	393994	393999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198597
6046	NC_015942	AGC	2	6	394346	394351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198597
6047	NC_015942	GGA	2	6	394386	394391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198597
6048	NC_015942	CGA	2	6	394470	394475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198597
6049	NC_015942	TCC	2	6	394484	394489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198597
6050	NC_015942	CTT	2	6	394612	394617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198598
6051	NC_015942	GAC	2	6	394670	394675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198598
6052	NC_015942	CCG	2	6	394689	394694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198598
6053	NC_015942	GGT	3	9	394720	394728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198598
6054	NC_015942	GGA	2	6	394729	394734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198598
6055	NC_015942	GCA	2	6	394861	394866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198598
6056	NC_015942	GCC	2	6	394925	394930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198598
6057	NC_015942	AAC	2	6	395103	395108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198598
6058	NC_015942	CCG	2	6	395164	395169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198598
6059	NC_015942	CCG	2	6	395175	395180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198598
6060	NC_015942	CGC	2	6	395252	395257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6061	NC_015942	AAC	2	6	395407	395412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_015942	GGA	2	6	395558	395563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198599
6063	NC_015942	GAG	2	6	395785	395790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198600
6064	NC_015942	GAA	2	6	395998	396003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198600
6065	NC_015942	GCC	2	6	396031	396036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198600
6066	NC_015942	CTG	3	9	396341	396349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198601
6067	NC_015942	GCC	2	6	396353	396358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198601
6068	NC_015942	GCC	2	6	396433	396438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198601
6069	NC_015942	GCG	2	6	396525	396530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198601
6070	NC_015942	GCC	2	6	396702	396707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198601
6071	NC_015942	GTG	2	6	396904	396909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_015942	AAG	2	6	397019	397024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_015942	AAT	2	6	397077	397082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_015942	ATC	2	6	397122	397127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_015942	CGG	2	6	397196	397201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_015942	GGC	2	6	397225	397230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_015942	ATT	2	6	397305	397310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_015942	GCA	2	6	397328	397333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198602
6079	NC_015942	GGA	2	6	397513	397518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198602
6080	NC_015942	GCC	2	6	397605	397610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6081	NC_015942	TTC	2	6	397663	397668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_015942	TAC	2	6	397699	397704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_015942	TGA	2	6	397801	397806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_015942	CGC	2	6	397878	397883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198603
6085	NC_015942	ACT	2	6	397900	397905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198603
6086	NC_015942	AAT	2	6	397961	397966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198603
6087	NC_015942	ATA	2	6	397975	397980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198603
6088	NC_015942	GTT	2	6	398084	398089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198603
6089	NC_015942	ATT	2	6	398104	398109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198603
6090	NC_015942	ATC	2	6	398165	398170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198603
6091	NC_015942	ACA	2	6	398250	398255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198603
6092	NC_015942	TGA	2	6	398313	398318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198603
6093	NC_015942	TAA	2	6	398406	398411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198603
6094	NC_015942	TGA	2	6	398449	398454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198603
6095	NC_015942	TAT	2	6	398785	398790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198604
6096	NC_015942	TAT	2	6	398822	398827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198604
6097	NC_015942	TCG	2	6	398863	398868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198604
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6099	NC_015942	GAT	2	6	398943	398948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198604
6100	NC_015942	GGA	2	6	399038	399043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198604
6101	NC_015942	CTA	2	6	399154	399159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198604
6102	NC_015942	GTG	2	6	399370	399375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_015942	CGG	2	6	399455	399460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_015942	ATA	2	6	399524	399529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_015942	ACT	2	6	399549	399554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_015942	TGT	2	6	399577	399582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_015942	TCC	2	6	399725	399730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198605
6108	NC_015942	GTC	2	6	399751	399756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198605
6109	NC_015942	ACG	2	6	399803	399808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198605
6110	NC_015942	AGT	2	6	399872	399877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198605
6111	NC_015942	ATG	2	6	399881	399886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198605
6112	NC_015942	TCT	2	6	399919	399924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198606
6113	NC_015942	TGA	2	6	399932	399937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198606
6114	NC_015942	GCA	2	6	400070	400075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198606
6115	NC_015942	TTG	2	6	400126	400131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198606
6116	NC_015942	CAT	2	6	400212	400217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198606
6117	NC_015942	TGG	2	6	400479	400484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_015942	CAT	2	6	400665	400670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6120	NC_015942	ACG	2	6	401007	401012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198607
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6481	NC_015942	ACG	2	6	428258	428263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198644
6482	NC_015942	GCC	2	6	428327	428332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198644
6483	NC_015942	CGC	2	6	428335	428340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198644
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