MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 46008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015942	GCC	2	6	161736	161741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198384
2502	NC_015942	CGC	2	6	161747	161752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198384
2503	NC_015942	GGC	2	6	161924	161929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198384
2504	NC_015942	CGC	2	6	161963	161968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198384
2505	NC_015942	AGA	2	6	161969	161974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198384
2506	NC_015942	CCT	2	6	161987	161992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198384
2507	NC_015942	CGG	2	6	161996	162001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198384
2508	NC_015942	TGG	2	6	162070	162075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198384
2509	NC_015942	CCG	2	6	162114	162119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198384
2510	NC_015942	ATC	2	6	162166	162171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198384
2511	NC_015942	GCC	2	6	162243	162248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2512	NC_015942	TGC	2	6	162249	162254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_015942	GCT	2	6	162333	162338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198385
2514	NC_015942	CAC	2	6	162426	162431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198385
2515	NC_015942	GAG	2	6	162505	162510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198385
2516	NC_015942	GCA	2	6	162539	162544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198385
2517	NC_015942	GGC	2	6	162553	162558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198385
2518	NC_015942	GCC	3	9	162601	162609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198385
2519	NC_015942	GCG	2	6	162696	162701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198385
2520	NC_015942	GTC	2	6	162742	162747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198385
2521	NC_015942	GGA	2	6	162915	162920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198385
2522	NC_015942	GGC	2	6	163033	163038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198385
2523	NC_015942	GGC	2	6	163126	163131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198385
2524	NC_015942	AGG	2	6	163350	163355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198385
2525	NC_015942	GTA	2	6	163432	163437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198385
2526	NC_015942	CCA	2	6	163452	163457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198385
2527	NC_015942	TGG	2	6	163634	163639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198385
2528	NC_015942	GCG	2	6	163669	163674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198385
2529	NC_015942	GGC	2	6	163885	163890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198385
2530	NC_015942	CGA	2	6	163920	163925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198385
2531	NC_015942	CGC	2	6	163968	163973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198385
2532	NC_015942	CGC	2	6	163982	163987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198385
2533	NC_015942	CAA	2	6	164083	164088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_015942	GCG	2	6	164188	164193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198386
2535	NC_015942	GCC	2	6	164223	164228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198386
2536	NC_015942	CCA	2	6	164275	164280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198386
2537	NC_015942	GCT	2	6	164351	164356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198386
2538	NC_015942	CGC	2	6	164465	164470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2539	NC_015942	ACT	2	6	164566	164571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198387
2540	NC_015942	CGA	2	6	164623	164628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198387
2541	NC_015942	CAG	2	6	164639	164644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198387
2542	NC_015942	TGC	2	6	164685	164690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198387
2543	NC_015942	TTC	2	6	164726	164731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198387
2544	NC_015942	CGC	2	6	164743	164748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198387
2545	NC_015942	TGA	2	6	164775	164780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198387
2546	NC_015942	GGA	2	6	164833	164838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198387
2547	NC_015942	CGT	2	6	164872	164877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198387
2548	NC_015942	ATT	2	6	164927	164932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198387
2549	NC_015942	CGT	2	6	164949	164954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198387
2550	NC_015942	CTG	2	6	164969	164974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198387
2551	NC_015942	TCG	2	6	164976	164981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198387
2552	NC_015942	GCG	2	6	165011	165016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198387
2553	NC_015942	GGC	2	6	165133	165138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198387
2554	NC_015942	TGT	2	6	165226	165231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198388
2555	NC_015942	AAT	2	6	165254	165259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198388
2556	NC_015942	GGT	2	6	165317	165322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198388
2557	NC_015942	TGG	2	6	165349	165354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198388
2558	NC_015942	TTG	2	6	165510	165515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198388
2559	NC_015942	TGT	2	6	165523	165528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198388
2560	NC_015942	AGC	2	6	165626	165631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_015942	GCC	2	6	166000	166005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198389
2562	NC_015942	CTT	2	6	166039	166044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198389
2563	NC_015942	GGA	2	6	166225	166230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198389
2564	NC_015942	GCC	2	6	166280	166285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198389
2565	NC_015942	CGC	2	6	166318	166323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198389
2566	NC_015942	CGC	2	6	166351	166356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198389
2567	NC_015942	GGT	2	6	166448	166453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198389
2568	NC_015942	GCC	2	6	166476	166481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198389
2569	NC_015942	TCA	2	6	166485	166490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198389
2570	NC_015942	CTC	3	9	166505	166513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198389
2571	NC_015942	GCC	2	6	166628	166633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198389
2572	NC_015942	AGG	2	6	166725	166730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198389
2573	NC_015942	GCA	2	6	166762	166767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198389
2574	NC_015942	GAA	2	6	166838	166843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198389
2575	NC_015942	ATG	2	6	166935	166940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198389
2576	NC_015942	GCC	2	6	166993	166998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198389
2577	NC_015942	GCG	2	6	167085	167090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198389
2578	NC_015942	CGC	2	6	167149	167154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198389
2579	NC_015942	AAC	2	6	167159	167164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198389
2580	NC_015942	TGG	2	6	167277	167282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198389
2581	NC_015942	GCC	2	6	167307	167312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198389
2582	NC_015942	GGC	2	6	167339	167344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198389
2583	NC_015942	CTC	2	6	167354	167359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198389
2584	NC_015942	GCA	2	6	167430	167435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198389
2585	NC_015942	ATC	2	6	167486	167491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198389
2586	NC_015942	CGC	2	6	167561	167566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198389
2587	NC_015942	GAG	2	6	167573	167578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198389
2588	NC_015942	GCA	2	6	167721	167726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_015942	TCT	2	6	167735	167740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2590	NC_015942	GTT	2	6	167798	167803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198390
2591	NC_015942	CCA	2	6	167841	167846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198390
2592	NC_015942	GCG	2	6	167869	167874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198390
2593	NC_015942	GGC	2	6	167971	167976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198391
2594	NC_015942	AAG	2	6	168005	168010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198391
2595	NC_015942	GCA	2	6	168145	168150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198391
2596	NC_015942	CGT	2	6	168279	168284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198392
2597	NC_015942	TCA	2	6	168308	168313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198392
2598	NC_015942	GGT	2	6	168451	168456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198392
2599	NC_015942	AGA	2	6	168500	168505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198393
2600	NC_015942	GTT	2	6	168514	168519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198393
2601	NC_015942	GTC	2	6	168532	168537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198393
2602	NC_015942	CTG	2	6	168541	168546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198393
2603	NC_015942	GCG	2	6	168652	168657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198393
2604	NC_015942	GGC	2	6	168766	168771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198393
2605	NC_015942	CGT	2	6	168793	168798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198393
2606	NC_015942	GGC	2	6	168846	168851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198393
2607	NC_015942	GCA	2	6	168867	168872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198393
2608	NC_015942	CAG	2	6	168885	168890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198393
2609	NC_015942	CGG	2	6	168934	168939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198393
2610	NC_015942	TGG	2	6	169025	169030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198393
2611	NC_015942	ATC	2	6	169202	169207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198393
2612	NC_015942	GAT	2	6	169239	169244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198393
2613	NC_015942	ACT	2	6	169250	169255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198393
2614	NC_015942	CTG	2	6	169345	169350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198393
2615	NC_015942	CAC	2	6	169374	169379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198393
2616	NC_015942	CAG	2	6	169387	169392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198393
2617	NC_015942	AGC	3	9	169409	169417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198393
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2619	NC_015942	CTG	2	6	169552	169557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198393
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