MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 46008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015942	CGA	2	6	322663	322668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198535
5002	NC_015942	GTG	2	6	322683	322688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198535
5003	NC_015942	GCT	2	6	322702	322707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198535
5004	NC_015942	CGA	2	6	322798	322803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198535
5005	NC_015942	GCC	2	6	322847	322852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198535
5006	NC_015942	AAG	2	6	322917	322922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198535
5007	NC_015942	GTT	2	6	322987	322992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198535
5008	NC_015942	TCA	2	6	323022	323027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198535
5009	NC_015942	GAA	2	6	323063	323068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198535
5010	NC_015942	GGC	2	6	323115	323120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198535
5011	NC_015942	CGA	2	6	323140	323145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198535
5012	NC_015942	TGG	2	6	323214	323219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198535
5013	NC_015942	GCA	2	6	323296	323301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198535
5014	NC_015942	CGG	2	6	323346	323351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198535
5015	NC_015942	CAC	3	9	323407	323415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198535
5016	NC_015942	AGC	2	6	323802	323807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198535
5017	NC_015942	TGG	2	6	323811	323816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198535
5018	NC_015942	ATT	2	6	323834	323839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198535
5019	NC_015942	AGA	2	6	323922	323927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198535
5020	NC_015942	GCG	2	6	323968	323973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198535
5021	NC_015942	TGA	2	6	324132	324137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198535
5022	NC_015942	GCC	2	6	324293	324298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198535
5023	NC_015942	GAG	2	6	324419	324424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198535
5024	NC_015942	ATG	2	6	324450	324455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198535
5025	NC_015942	GAA	3	9	324488	324496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198535
5026	NC_015942	GAA	2	6	324562	324567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198535
5027	NC_015942	TTG	2	6	324581	324586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198535
5028	NC_015942	TGC	2	6	324600	324605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198535
5029	NC_015942	GGC	2	6	324618	324623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198535
5030	NC_015942	CGG	2	6	324726	324731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198535
5031	NC_015942	CTC	2	6	324938	324943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5032	NC_015942	TCT	2	6	324986	324991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198536
5033	NC_015942	GGC	2	6	325094	325099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198536
5034	NC_015942	GTC	2	6	325177	325182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_015942	TAC	2	6	325189	325194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_015942	CCG	2	6	325325	325330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198537
5037	NC_015942	TGC	2	6	325361	325366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198537
5038	NC_015942	TGG	2	6	325412	325417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198537
5039	NC_015942	GCA	2	6	325420	325425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198537
5040	NC_015942	GGC	2	6	325470	325475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198537
5041	NC_015942	TGG	2	6	325478	325483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198537
5042	NC_015942	GGT	2	6	325506	325511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198537
5043	NC_015942	TGA	2	6	325761	325766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198537
5044	NC_015942	CGA	2	6	325767	325772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198537
5045	NC_015942	GGC	2	6	325802	325807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198537
5046	NC_015942	ATC	2	6	325868	325873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198537
5047	NC_015942	CGA	2	6	325890	325895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198537
5048	NC_015942	GCA	2	6	325938	325943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198537
5049	NC_015942	CTG	2	6	325945	325950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198537
5050	NC_015942	GTT	2	6	326076	326081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198537
5051	NC_015942	CGC	2	6	326113	326118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198537
5052	NC_015942	CGG	2	6	326222	326227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198537
5053	NC_015942	GCA	2	6	326319	326324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198537
5054	NC_015942	GCA	2	6	326331	326336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198537
5055	NC_015942	AGC	2	6	326357	326362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198537
5056	NC_015942	GGA	2	6	326394	326399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198537
5057	NC_015942	CCG	2	6	326406	326411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198537
5058	NC_015942	CGA	2	6	326456	326461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198537
5059	NC_015942	CCT	2	6	326493	326498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198537
5060	NC_015942	GGA	2	6	326499	326504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198537
5061	NC_015942	TGG	2	6	326549	326554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198537
5062	NC_015942	CAG	2	6	326627	326632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198538
5063	NC_015942	CGG	2	6	326741	326746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198538
5064	NC_015942	GGC	2	6	326782	326787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198538
5065	NC_015942	ACA	2	6	326809	326814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198538
5066	NC_015942	CGA	2	6	326821	326826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198538
5067	NC_015942	CGA	2	6	326858	326863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198538
5068	NC_015942	CAG	2	6	326908	326913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198538
5069	NC_015942	GAC	2	6	326931	326936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198538
5070	NC_015942	GAT	2	6	327024	327029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198538
5071	NC_015942	TGG	2	6	327128	327133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198538
5072	NC_015942	GGT	2	6	327158	327163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198538
5073	NC_015942	CGG	2	6	327236	327241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198538
5074	NC_015942	TGG	2	6	327245	327250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198538
5075	NC_015942	TGA	2	6	327290	327295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198538
5076	NC_015942	CAG	2	6	327417	327422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198538
5077	NC_015942	GCC	2	6	327432	327437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198538
5078	NC_015942	AGC	2	6	327495	327500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198539
5079	NC_015942	TCA	3	9	327525	327533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198539
5080	NC_015942	GCA	2	6	327595	327600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198539
5081	NC_015942	GGC	2	6	327623	327628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198539
5082	NC_015942	ACC	2	6	327635	327640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198539
5083	NC_015942	GCC	2	6	327871	327876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198539
5084	NC_015942	ATA	2	6	327891	327896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198539
5085	NC_015942	CGC	2	6	327925	327930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198539
5086	NC_015942	CTG	2	6	327944	327949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198539
5087	NC_015942	CCA	2	6	327957	327962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198539
5088	NC_015942	GCT	2	6	328009	328014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198539
5089	NC_015942	TCC	2	6	328023	328028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198539
5090	NC_015942	GCA	2	6	328147	328152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198539
5091	NC_015942	TCA	2	6	328161	328166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198539
5092	NC_015942	GAT	2	6	328210	328215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198539
5093	NC_015942	TGA	2	6	328252	328257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198539
5094	NC_015942	GGC	2	6	328265	328270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198539
5095	NC_015942	GCC	2	6	328376	328381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198539
5096	NC_015942	TCT	2	6	328502	328507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198540
5097	NC_015942	CGG	2	6	328563	328568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198540
5098	NC_015942	TCC	2	6	328606	328611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198540
5099	NC_015942	CGC	2	6	328844	328849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198540
5100	NC_015942	TCA	2	6	329065	329070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198540
5101	NC_015942	CGG	2	6	329071	329076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198540
5102	NC_015942	CCA	2	6	329123	329128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198540
5103	NC_015942	GAT	2	6	329151	329156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198540
5104	NC_015942	CCA	2	6	329314	329319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198540
5105	NC_015942	GCC	2	6	329487	329492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198540
5106	NC_015942	GGC	2	6	329550	329555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198540
5107	NC_015942	GAT	2	6	329625	329630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198540
5108	NC_015942	TCG	2	6	329779	329784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198540
5109	NC_015942	TGC	2	6	329809	329814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198540
5110	NC_015942	GCG	2	6	329842	329847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198540
5111	NC_015942	GTC	2	6	329982	329987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198540
5112	NC_015942	CCA	2	6	330179	330184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198540
5113	NC_015942	GCA	2	6	330215	330220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198540
5114	NC_015942	CAG	2	6	330258	330263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198540
5115	NC_015942	GCG	2	6	330336	330341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198540
5116	NC_015942	TCG	2	6	330349	330354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198540
5117	NC_015942	GCG	2	6	330447	330452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198541
5118	NC_015942	ACC	2	6	330459	330464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198541
5119	NC_015942	CCG	2	6	330478	330483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198541
5120	NC_015942	ACC	2	6	330611	330616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198541
5121	NC_015942	GTT	2	6	330647	330652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198541
5122	NC_015942	CTG	2	6	330666	330671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198541
5123	NC_015942	GCG	2	6	330748	330753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198541
5124	NC_015942	CGT	2	6	330821	330826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198541
5125	NC_015942	GTT	2	6	330834	330839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198541
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5131	NC_015942	TCG	2	6	331180	331185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198541
5132	NC_015942	AGC	2	6	331189	331194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198541
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5158	NC_015942	GCA	2	6	333537	333542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5162	NC_015942	AGG	2	6	333670	333675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5173	NC_015942	GCG	2	6	334479	334484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198543
5174	NC_015942	TCA	2	6	334682	334687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198543
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5179	NC_015942	CCG	2	6	335204	335209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198543
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5183	NC_015942	CTG	2	6	335469	335474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198543
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5188	NC_015942	GTC	2	6	335918	335923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198544
5189	NC_015942	GGC	2	6	335989	335994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198544
5190	NC_015942	GCT	2	6	336016	336021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198544
5191	NC_015942	TGC	2	6	336036	336041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198544
5192	NC_015942	CTG	2	6	336071	336076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198544
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5194	NC_015942	GTC	2	6	336224	336229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198544
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5199	NC_015942	ACC	2	6	336397	336402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198545
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5201	NC_015942	ATC	2	6	336487	336492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198545
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5205	NC_015942	GCG	2	6	336724	336729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198545
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5221	NC_015942	GCT	2	6	337581	337586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198546
5222	NC_015942	CAG	2	6	337650	337655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198546
5223	NC_015942	GCG	2	6	337673	337678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198546
5224	NC_015942	GAA	2	6	337679	337684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198546
5225	NC_015942	GGC	2	6	337701	337706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198546
5226	NC_015942	TGA	2	6	337735	337740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198546
5227	NC_015942	GGC	2	6	337816	337821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198546
5228	NC_015942	GCC	2	6	337911	337916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198546
5229	NC_015942	ACC	2	6	337921	337926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198546
5230	NC_015942	GCT	2	6	337978	337983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198546
5231	NC_015942	GCT	2	6	338044	338049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198546
5232	NC_015942	GAT	3	9	338079	338087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5233	NC_015942	ATG	2	6	338155	338160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198547
5234	NC_015942	ATT	2	6	338164	338169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198547
5235	NC_015942	AGG	2	6	338183	338188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198547
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5237	NC_015942	CGC	2	6	338252	338257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198547
5238	NC_015942	CCG	2	6	338324	338329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198547
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5241	NC_015942	GGC	2	6	338489	338494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198547
5242	NC_015942	TGG	2	6	338579	338584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198547
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5356	NC_015942	GCC	2	6	346479	346484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198553
5357	NC_015942	GAA	2	6	346507	346512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198553
5358	NC_015942	GAA	2	6	346522	346527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198553
5359	NC_015942	CGC	2	6	346539	346544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198553
5360	NC_015942	TGG	2	6	346629	346634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198554
5361	NC_015942	TGC	2	6	346674	346679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198554
5362	NC_015942	GCG	2	6	346752	346757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198554
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5364	NC_015942	GTC	2	6	346869	346874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198554
5365	NC_015942	GCC	2	6	347141	347146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198554
5366	NC_015942	TGC	2	6	347227	347232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198554
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5372	NC_015942	CTG	2	6	347574	347579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198554
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5380	NC_015942	CGT	2	6	348458	348463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198556
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5383	NC_015942	TGC	2	6	348596	348601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198557
5384	NC_015942	TGG	2	6	348628	348633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198557
5385	NC_015942	TGG	2	6	348745	348750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198557
5386	NC_015942	GGC	2	6	348763	348768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198557
5387	NC_015942	GGT	2	6	348809	348814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198557
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5391	NC_015942	TGC	2	6	349105	349110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198557
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5393	NC_015942	CTG	2	6	349221	349226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198557
5394	NC_015942	GGA	2	6	349428	349433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5395	NC_015942	CAA	2	6	349467	349472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198558
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5402	NC_015942	CTG	2	6	349994	349999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198559
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5474	NC_015942	GGC	2	6	355704	355709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198563
5475	NC_015942	GAC	2	6	355804	355809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198563
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5477	NC_015942	GGC	2	6	355887	355892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198563
5478	NC_015942	ACT	2	6	356028	356033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198564
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5482	NC_015942	CTT	2	6	356398	356403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198564
5483	NC_015942	AGC	2	6	356416	356421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198564
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5499	NC_015942	TTC	2	6	357262	357267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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