MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 46008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015942	TGG	2	6	256500	256505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198476
4002	NC_015942	GTA	2	6	256525	256530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198476
4003	NC_015942	TGC	2	6	256590	256595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198476
4004	NC_015942	GGA	2	6	256657	256662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198476
4005	NC_015942	CAC	2	6	256692	256697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198476
4006	NC_015942	CAT	2	6	256779	256784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198476
4007	NC_015942	TTG	2	6	256838	256843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198476
4008	NC_015942	TTC	2	6	257099	257104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198476
4009	NC_015942	GAT	2	6	257107	257112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198476
4010	NC_015942	CGG	2	6	257133	257138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198476
4011	NC_015942	TTG	2	6	257147	257152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198476
4012	NC_015942	TTG	2	6	257177	257182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198476
4013	NC_015942	ATC	2	6	257297	257302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198476
4014	NC_015942	GAT	2	6	257332	257337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198476
4015	NC_015942	CAC	2	6	257510	257515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_015942	AGG	2	6	257554	257559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198477
4017	NC_015942	CAT	2	6	257602	257607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198477
4018	NC_015942	CGG	2	6	257735	257740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198477
4019	NC_015942	TTG	2	6	257759	257764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198477
4020	NC_015942	TCA	2	6	257799	257804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198477
4021	NC_015942	CGT	2	6	257825	257830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198477
4022	NC_015942	GAT	2	6	257983	257988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198477
4023	NC_015942	ATC	2	6	258077	258082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198477
4024	NC_015942	CAG	2	6	258128	258133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198477
4025	NC_015942	GCT	3	9	258415	258423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198477
4026	NC_015942	TTC	2	6	258440	258445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198477
4027	NC_015942	GCC	2	6	258448	258453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198477
4028	NC_015942	GGC	2	6	258524	258529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198477
4029	NC_015942	TTC	2	6	258566	258571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198477
4030	NC_015942	CTG	2	6	258635	258640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198477
4031	NC_015942	GAA	2	6	258659	258664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198477
4032	NC_015942	GGC	2	6	258680	258685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198477
4033	NC_015942	TTC	2	6	258722	258727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198477
4034	NC_015942	CGC	2	6	258787	258792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198477
4035	NC_015942	TGA	2	6	258898	258903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198477
4036	NC_015942	TTC	2	6	258938	258943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198477
4037	NC_015942	GGC	2	6	258944	258949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198477
4038	NC_015942	GGC	2	6	258953	258958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198477
4039	NC_015942	GCA	2	6	259145	259150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198478
4040	NC_015942	AGA	2	6	259184	259189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198478
4041	NC_015942	CCA	2	6	259229	259234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198478
4042	NC_015942	AAT	2	6	259250	259255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198478
4043	NC_015942	TGC	2	6	259312	259317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198478
4044	NC_015942	GCC	2	6	259359	259364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198478
4045	NC_015942	TGA	2	6	259424	259429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198478
4046	NC_015942	GAT	2	6	259431	259436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198478
4047	NC_015942	CAG	3	9	259473	259481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198478
4048	NC_015942	GAA	2	6	259482	259487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198478
4049	NC_015942	TGC	2	6	259520	259525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198478
4050	NC_015942	CTG	2	6	259575	259580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198478
4051	NC_015942	GGC	2	6	259647	259652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198478
4052	NC_015942	GGC	2	6	259715	259720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198478
4053	NC_015942	GCG	2	6	259743	259748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198478
4054	NC_015942	CAG	2	6	259755	259760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198478
4055	NC_015942	GGC	2	6	259799	259804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198478
4056	NC_015942	GGC	2	6	259812	259817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198478
4057	NC_015942	TCG	2	6	259963	259968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198478
4058	NC_015942	TCA	2	6	259990	259995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198478
4059	NC_015942	GCC	3	9	260037	260045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198478
4060	NC_015942	CGC	2	6	260066	260071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198478
4061	NC_015942	TTG	2	6	260083	260088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198478
4062	NC_015942	AGG	2	6	260108	260113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198478
4063	NC_015942	TTA	2	6	260355	260360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_015942	GCG	2	6	260385	260390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_015942	GGT	2	6	260404	260409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_015942	GAT	2	6	260525	260530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198479
4067	NC_015942	CAT	2	6	260545	260550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198479
4068	NC_015942	CCG	2	6	260625	260630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198479
4069	NC_015942	TCG	2	6	260712	260717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198479
4070	NC_015942	TTC	2	6	260730	260735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198479
4071	NC_015942	CGA	2	6	260803	260808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198479
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4073	NC_015942	GGT	2	6	260939	260944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198479
4074	NC_015942	GGC	2	6	260972	260977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198479
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4078	NC_015942	GCC	2	6	261149	261154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198479
4079	NC_015942	CAG	2	6	261230	261235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198479
4080	NC_015942	TGG	2	6	261361	261366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198479
4081	NC_015942	GAT	2	6	261467	261472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198479
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4083	NC_015942	GGC	2	6	261642	261647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198479
4084	NC_015942	GTG	2	6	261648	261653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198479
4085	NC_015942	ACG	2	6	261700	261705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198479
4086	NC_015942	TCG	2	6	261786	261791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_015942	AAC	2	6	261834	261839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_015942	CAC	2	6	261918	261923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4089	NC_015942	ATG	2	6	262030	262035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198480
4090	NC_015942	CTT	2	6	262150	262155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198480
4091	NC_015942	TCT	2	6	262181	262186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198480
4092	NC_015942	TCT	3	9	262200	262208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198480
4093	NC_015942	CGT	2	6	262257	262262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198480
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4100	NC_015942	GGC	2	6	262845	262850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198480
4101	NC_015942	GCG	2	6	262901	262906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198480
4102	NC_015942	GAG	2	6	262924	262929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198480
4103	NC_015942	GAT	2	6	263065	263070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198480
4104	NC_015942	GCC	2	6	263212	263217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198480
4105	NC_015942	CGA	2	6	263283	263288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198480
4106	NC_015942	TCG	2	6	263312	263317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198480
4107	NC_015942	GCC	2	6	263420	263425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198480
4108	NC_015942	GCG	2	6	263452	263457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198480
4109	NC_015942	TCC	2	6	263474	263479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198480
4110	NC_015942	GCG	2	6	263517	263522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198480
4111	NC_015942	GCG	2	6	263532	263537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198480
4112	NC_015942	GGC	2	6	263551	263556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198480
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4114	NC_015942	CGG	3	9	263844	263852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198480
4115	NC_015942	TGC	2	6	263921	263926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198480
4116	NC_015942	GTT	2	6	263993	263998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_015942	GCA	2	6	264087	264092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_015942	CCG	2	6	264097	264102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4119	NC_015942	CGT	2	6	264143	264148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_015942	GCG	2	6	264196	264201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_015942	GAG	3	9	264350	264358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_015942	GCT	2	6	264417	264422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198481
4123	NC_015942	GCT	2	6	264425	264430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198481
4124	NC_015942	ACC	2	6	264535	264540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198481
4125	NC_015942	TGG	2	6	264595	264600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198482
4126	NC_015942	AGT	2	6	264601	264606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198482
4127	NC_015942	GCT	2	6	264625	264630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198482
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4129	NC_015942	TGC	2	6	264748	264753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198482
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4242	NC_015942	ACT	2	6	271480	271485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4358	NC_015942	TGC	2	6	279137	279142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198491
4359	NC_015942	CTG	2	6	279153	279158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198491
4360	NC_015942	GGC	2	6	279224	279229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198491
4361	NC_015942	TGG	2	6	279382	279387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198491
4362	NC_015942	CAG	2	6	279396	279401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198491
4363	NC_015942	GTA	2	6	279643	279648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198491
4364	NC_015942	TGC	2	6	279715	279720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198491
4365	NC_015942	GTT	2	6	279722	279727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198491
4366	NC_015942	GGC	2	6	279797	279802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198491
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4368	NC_015942	TGG	3	9	279935	279943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198492
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4373	NC_015942	GCT	2	6	280344	280349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198492
4374	NC_015942	ATC	2	6	280367	280372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198492
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4382	NC_015942	TGG	2	6	280757	280762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198492
4383	NC_015942	CGA	2	6	280848	280853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198492
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4385	NC_015942	GAC	2	6	281091	281096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198492
4386	NC_015942	GCC	2	6	281119	281124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198492
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4388	NC_015942	CTG	2	6	281661	281666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198493
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4397	NC_015942	TGC	2	6	282176	282181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198494
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4399	NC_015942	CTG	2	6	282236	282241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198495
4400	NC_015942	TTC	2	6	282261	282266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198495
4401	NC_015942	CGG	2	6	282380	282385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198495
4402	NC_015942	CCA	2	6	282484	282489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198495
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4413	NC_015942	CTG	2	6	283242	283247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198495
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4419	NC_015942	CGG	2	6	283394	283399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198495
4420	NC_015942	TGA	2	6	283520	283525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198495
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4422	NC_015942	TCG	2	6	283603	283608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198495
4423	NC_015942	CGA	2	6	283631	283636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198495
4424	NC_015942	GGC	2	6	283641	283646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198495
4425	NC_015942	CGT	2	6	283787	283792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198495
4426	NC_015942	CAG	2	6	284043	284048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198495
4427	NC_015942	GCA	2	6	284157	284162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4428	NC_015942	CAG	2	6	284321	284326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198496
4429	NC_015942	CTT	2	6	284386	284391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198496
4430	NC_015942	CTG	2	6	284396	284401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198496
4431	NC_015942	GAG	2	6	284432	284437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198496
4432	NC_015942	CGC	2	6	284473	284478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198496
4433	NC_015942	GCG	2	6	284493	284498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198496
4434	NC_015942	CGA	2	6	284527	284532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198496
4435	NC_015942	TTC	2	6	284669	284674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4436	NC_015942	AAC	2	6	284749	284754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198497
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4438	NC_015942	CTG	2	6	284929	284934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198497
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4440	NC_015942	GGT	2	6	284951	284956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198497
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4442	NC_015942	CTG	2	6	285040	285045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198497
4443	NC_015942	CAA	2	6	285095	285100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198497
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4446	NC_015942	CGG	2	6	285248	285253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198497
4447	NC_015942	CTC	2	6	285258	285263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198497
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4453	NC_015942	CTG	2	6	285552	285557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198497
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4455	NC_015942	GTT	2	6	285650	285655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4456	NC_015942	TCT	2	6	285706	285711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4457	NC_015942	GTT	2	6	285741	285746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198498
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4460	NC_015942	GCG	2	6	285941	285946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198498
4461	NC_015942	GAA	2	6	285957	285962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198498
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4463	NC_015942	GCC	2	6	286000	286005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198498
4464	NC_015942	ATC	2	6	286030	286035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198498
4465	NC_015942	ATG	2	6	286049	286054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198498
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4467	NC_015942	GAT	2	6	286110	286115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198498
4468	NC_015942	CGC	3	9	286163	286171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198498
4469	NC_015942	CGA	2	6	286291	286296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198498
4470	NC_015942	CTG	2	6	286447	286452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4471	NC_015942	CGG	2	6	286544	286549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4472	NC_015942	CCG	2	6	286592	286597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4473	NC_015942	CAT	2	6	286602	286607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4474	NC_015942	GAA	2	6	286638	286643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4475	NC_015942	CCT	2	6	286696	286701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198499
4476	NC_015942	CAT	2	6	286723	286728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198499
4477	NC_015942	AGC	2	6	286740	286745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198499
4478	NC_015942	GCA	2	6	286912	286917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198499
4479	NC_015942	TCC	2	6	287045	287050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198499
4480	NC_015942	GTG	2	6	287155	287160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198499
4481	NC_015942	GAT	2	6	287285	287290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198500
4482	NC_015942	CGA	2	6	287339	287344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198500
4483	NC_015942	ATG	2	6	287415	287420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198500
4484	NC_015942	TGA	2	6	287439	287444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198500
4485	NC_015942	CAC	2	6	287449	287454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198500
4486	NC_015942	ATA	2	6	287495	287500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198500
4487	NC_015942	CTT	2	6	287598	287603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198500
4488	NC_015942	TTA	2	6	287687	287692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198500
4489	NC_015942	GTC	2	6	287710	287715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198500
4490	NC_015942	AAG	2	6	287749	287754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198500
4491	NC_015942	TTC	2	6	287757	287762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198500
4492	NC_015942	GGT	2	6	287837	287842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198500
4493	NC_015942	GGT	2	6	287857	287862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198500
4494	NC_015942	CCT	2	6	287880	287885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198500
4495	NC_015942	CTG	2	6	287888	287893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198500
4496	NC_015942	AAG	2	6	287921	287926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198500
4497	NC_015942	CCT	2	6	288042	288047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198500
4498	NC_015942	AGC	2	6	288088	288093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198500
4499	NC_015942	CGC	2	6	288105	288110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198500
4500	NC_015942	AGG	2	6	288153	288158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198500

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