MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 46008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015942	GAA	2	6	191735	191740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198414
3002	NC_015942	CAT	2	6	191762	191767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198414
3003	NC_015942	GGC	2	6	191824	191829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198414
3004	NC_015942	TTG	2	6	191882	191887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198414
3005	NC_015942	CTG	2	6	191933	191938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198414
3006	NC_015942	TCG	2	6	191949	191954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198414
3007	NC_015942	TGG	2	6	191962	191967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198414
3008	NC_015942	GTA	2	6	192035	192040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198414
3009	NC_015942	GCC	2	6	192127	192132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198414
3010	NC_015942	GGT	2	6	192160	192165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198414
3011	NC_015942	GGC	2	6	192246	192251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198414
3012	NC_015942	GAC	2	6	192259	192264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198414
3013	NC_015942	TTC	2	6	192269	192274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198414
3014	NC_015942	GGA	2	6	192343	192348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198414
3015	NC_015942	GGA	2	6	192409	192414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198414
3016	NC_015942	GCT	2	6	192547	192552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_015942	CAG	2	6	192556	192561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_015942	GGC	2	6	192756	192761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_015942	ATC	2	6	192820	192825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198415
3020	NC_015942	GCC	2	6	192882	192887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198415
3021	NC_015942	TCG	2	6	192921	192926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198415
3022	NC_015942	CGA	2	6	193010	193015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198415
3023	NC_015942	GAC	2	6	193033	193038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198415
3024	NC_015942	AAG	2	6	193096	193101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_015942	GCG	2	6	193201	193206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198416
3026	NC_015942	CCG	2	6	193230	193235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198416
3027	NC_015942	GCC	3	9	193258	193266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198416
3028	NC_015942	GCA	2	6	193278	193283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198416
3029	NC_015942	TGA	2	6	193293	193298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198416
3030	NC_015942	CGC	2	6	193371	193376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198416
3031	NC_015942	GAT	2	6	193399	193404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198416
3032	NC_015942	ATC	2	6	193738	193743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198416
3033	NC_015942	CGA	2	6	193768	193773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198416
3034	NC_015942	CCA	2	6	193776	193781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198416
3035	NC_015942	GCG	2	6	193872	193877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198416
3036	NC_015942	CAC	2	6	193897	193902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198416
3037	NC_015942	GCC	2	6	193949	193954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198416
3038	NC_015942	CGG	2	6	194017	194022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198416
3039	NC_015942	GCT	2	6	194052	194057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198416
3040	NC_015942	GCT	2	6	194061	194066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198416
3041	NC_015942	CAG	2	6	194158	194163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198416
3042	NC_015942	TCG	2	6	194165	194170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198416
3043	NC_015942	CCA	2	6	194172	194177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198416
3044	NC_015942	CCA	2	6	194282	194287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198416
3045	NC_015942	CCG	2	6	194364	194369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198416
3046	NC_015942	ACA	2	6	194411	194416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198416
3047	NC_015942	CTG	2	6	194437	194442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198416
3048	NC_015942	GAT	2	6	194455	194460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198416
3049	NC_015942	CGC	2	6	194481	194486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198416
3050	NC_015942	CAG	2	6	194500	194505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198416
3051	NC_015942	AAG	2	6	194666	194671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_015942	CAG	2	6	194683	194688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_015942	ATG	2	6	194725	194730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_015942	AAT	2	6	194766	194771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198417
3055	NC_015942	TGT	2	6	194779	194784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198417
3056	NC_015942	TCG	2	6	194820	194825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198417
3057	NC_015942	CGC	2	6	194864	194869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198417
3058	NC_015942	CGC	2	6	194873	194878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198417
3059	NC_015942	CAG	2	6	194906	194911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198417
3060	NC_015942	TGA	2	6	194928	194933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198417
3061	NC_015942	GAA	2	6	195011	195016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198417
3062	NC_015942	AGC	2	6	195039	195044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198417
3063	NC_015942	GCC	3	9	195057	195065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198417
3064	NC_015942	TTG	2	6	195066	195071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198417
3065	NC_015942	GTA	2	6	195167	195172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198417
3066	NC_015942	CGG	2	6	195295	195300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198417
3067	NC_015942	GAC	2	6	195389	195394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198417
3068	NC_015942	GGC	2	6	195458	195463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198418
3069	NC_015942	CGC	2	6	195540	195545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198418
3070	NC_015942	ACC	2	6	195563	195568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198418
3071	NC_015942	CCG	2	6	195660	195665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198418
3072	NC_015942	TCA	2	6	195682	195687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198418
3073	NC_015942	ATG	2	6	195834	195839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198418
3074	NC_015942	ATG	2	6	195867	195872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198418
3075	NC_015942	GCT	2	6	195933	195938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198418
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3078	NC_015942	GGC	2	6	196380	196385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198419
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3080	NC_015942	GAT	2	6	196497	196502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198419
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3083	NC_015942	TGG	2	6	196676	196681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198419
3084	NC_015942	CTT	2	6	196700	196705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198419
3085	NC_015942	TCT	2	6	196759	196764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198419
3086	NC_015942	CAT	2	6	196920	196925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198419
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3088	NC_015942	GAC	2	6	196995	197000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198419
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3090	NC_015942	GGC	2	6	197025	197030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198419
3091	NC_015942	GGA	2	6	197045	197050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198419
3092	NC_015942	GGA	2	6	197090	197095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198419
3093	NC_015942	GCA	2	6	197113	197118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198419
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3099	NC_015942	GCC	2	6	197479	197484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198420
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3102	NC_015942	CGC	2	6	197655	197660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198420
3103	NC_015942	CGA	2	6	197666	197671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198420
3104	NC_015942	TGG	2	6	197684	197689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198420
3105	NC_015942	GGC	2	6	197697	197702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198420
3106	NC_015942	TTG	2	6	197758	197763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198420
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3109	NC_015942	CAT	2	6	197943	197948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198420
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3111	NC_015942	GCG	2	6	198022	198027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198420
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3113	NC_015942	TGA	2	6	198065	198070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198420
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3117	NC_015942	TAA	2	6	198245	198250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198420
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3119	NC_015942	AGC	2	6	198409	198414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198420
3120	NC_015942	GTG	2	6	198493	198498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198420
3121	NC_015942	CCG	2	6	198656	198661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198420
3122	NC_015942	GAC	2	6	198684	198689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198420
3123	NC_015942	CGA	2	6	198755	198760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198420
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3126	NC_015942	TTG	2	6	198903	198908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198421
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3131	NC_015942	CGA	2	6	199171	199176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198421
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3151	NC_015942	GCG	2	6	200523	200528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198422
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3189	NC_015942	GGA	2	6	202817	202822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198423
3190	NC_015942	ACA	2	6	203048	203053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3191	NC_015942	TGG	2	6	203084	203089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198424
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3210	NC_015942	TAG	2	6	204040	204045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3230	NC_015942	GTG	2	6	205135	205140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198426
3231	NC_015942	CCG	2	6	205163	205168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198426
3232	NC_015942	GGC	2	6	205252	205257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198426
3233	NC_015942	ATG	2	6	205268	205273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198426
3234	NC_015942	GAT	2	6	205379	205384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3235	NC_015942	CCG	2	6	205485	205490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198427
3236	NC_015942	GCG	2	6	205735	205740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198427
3237	NC_015942	GCC	2	6	205758	205763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198427
3238	NC_015942	GGA	2	6	206026	206031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198427
3239	NC_015942	GCC	2	6	206036	206041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198427
3240	NC_015942	TTG	2	6	206063	206068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198427
3241	NC_015942	CGC	2	6	206110	206115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198427
3242	NC_015942	TCT	2	6	206177	206182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198428
3243	NC_015942	ATG	2	6	206218	206223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198428
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3246	NC_015942	TGA	2	6	206369	206374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198428
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3253	NC_015942	GTT	2	6	206639	206644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198428
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3261	NC_015942	TAC	2	6	207237	207242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3262	NC_015942	CGG	2	6	207304	207309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3263	NC_015942	GTC	2	6	207500	207505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198429
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3265	NC_015942	CGG	2	6	207618	207623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198429
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3269	NC_015942	ATT	2	6	207893	207898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198429
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3277	NC_015942	TCA	2	6	208404	208409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198430
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3305	NC_015942	TCG	2	6	210079	210084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198431
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3352	NC_015942	CCA	2	6	213084	213089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198433
3353	NC_015942	ATG	2	6	213155	213160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198433
3354	NC_015942	CAA	2	6	213268	213273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198433
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3356	NC_015942	CCG	2	6	213294	213299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198433
3357	NC_015942	ACC	2	6	213326	213331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198433
3358	NC_015942	GCC	2	6	213343	213348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198433
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3362	NC_015942	CAT	2	6	213573	213578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198433
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3383	NC_015942	GTG	2	6	214823	214828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198434
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3476	NC_015942	GGC	2	6	221222	221227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3477	NC_015942	CTT	2	6	221323	221328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3478	NC_015942	CTG	2	6	221403	221408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3479	NC_015942	CTT	2	6	221489	221494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3480	NC_015942	TGA	2	6	221501	221506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3481	NC_015942	GCC	2	6	221516	221521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3482	NC_015942	CCA	2	6	221602	221607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198441
3483	NC_015942	CAT	2	6	221637	221642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198441
3484	NC_015942	CGG	3	9	221729	221737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198441
3485	NC_015942	CGG	2	6	221750	221755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198441
3486	NC_015942	TGG	2	6	222095	222100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3487	NC_015942	TGA	2	6	222258	222263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198442
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3490	NC_015942	GGC	2	6	222478	222483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198443
3491	NC_015942	TGC	2	6	222510	222515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198443
3492	NC_015942	TGC	2	6	222588	222593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198443
3493	NC_015942	CGA	2	6	222748	222753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198443
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3498	NC_015942	CAG	2	6	222984	222989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3499	NC_015942	CAT	2	6	223004	223009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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