MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 46008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015942	TGA	2	6	100445	100450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198326
1502	NC_015942	CAT	2	6	100458	100463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198326
1503	NC_015942	CCA	2	6	100508	100513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198326
1504	NC_015942	CAC	2	6	100516	100521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198326
1505	NC_015942	ATG	2	6	100604	100609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198326
1506	NC_015942	CTG	2	6	100641	100646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198326
1507	NC_015942	CTT	2	6	100703	100708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_015942	CGA	2	6	100736	100741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_015942	CAA	2	6	100864	100869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_015942	CAT	2	6	100909	100914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_015942	GGC	2	6	100931	100936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_015942	CGC	2	6	100945	100950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1513	NC_015942	GAA	2	6	101000	101005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_015942	CTT	2	6	101058	101063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_015942	CTG	2	6	101092	101097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198327
1516	NC_015942	TCC	2	6	101318	101323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198327
1517	NC_015942	CAT	2	6	101400	101405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198327
1518	NC_015942	CAT	2	6	101475	101480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198327
1519	NC_015942	TGC	2	6	101504	101509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198327
1520	NC_015942	TAC	2	6	101570	101575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198327
1521	NC_015942	AGC	2	6	101653	101658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198327
1522	NC_015942	GAT	2	6	101673	101678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198327
1523	NC_015942	GGT	2	6	101685	101690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198327
1524	NC_015942	GGC	2	6	101752	101757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198327
1525	NC_015942	AAC	2	6	101787	101792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198327
1526	NC_015942	CTG	2	6	101881	101886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198327
1527	NC_015942	CTT	2	6	101892	101897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198327
1528	NC_015942	GGC	2	6	101979	101984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198327
1529	NC_015942	CAA	2	6	101995	102000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198327
1530	NC_015942	TCA	2	6	102005	102010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198327
1531	NC_015942	TGG	3	9	102041	102049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198327
1532	NC_015942	TCG	2	6	102056	102061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198327
1533	NC_015942	GAT	2	6	102142	102147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198327
1534	NC_015942	GCA	2	6	102156	102161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198327
1535	NC_015942	GTT	2	6	102230	102235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198327
1536	NC_015942	GCG	2	6	102280	102285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198327
1537	NC_015942	CTT	2	6	102351	102356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198327
1538	NC_015942	CAC	2	6	102409	102414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198327
1539	NC_015942	GCC	2	6	102466	102471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198327
1540	NC_015942	GCA	2	6	102501	102506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198327
1541	NC_015942	TGC	2	6	102524	102529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198327
1542	NC_015942	TGC	2	6	102578	102583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198327
1543	NC_015942	GGA	2	6	102699	102704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198327
1544	NC_015942	CAA	2	6	102772	102777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198327
1545	NC_015942	GGC	2	6	102883	102888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198327
1546	NC_015942	GAA	2	6	102922	102927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198327
1547	NC_015942	AGA	2	6	102950	102955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198327
1548	NC_015942	GCT	2	6	103141	103146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198327
1549	NC_015942	GGA	2	6	103152	103157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198327
1550	NC_015942	AGA	3	9	103191	103199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198327
1551	NC_015942	CCG	2	6	103275	103280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198327
1552	NC_015942	CAT	2	6	103293	103298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198327
1553	NC_015942	CGT	2	6	103515	103520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198327
1554	NC_015942	ATG	2	6	103522	103527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198327
1555	NC_015942	TGA	2	6	103656	103661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198327
1556	NC_015942	GGT	2	6	103773	103778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198327
1557	NC_015942	GAT	2	6	103813	103818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198327
1558	NC_015942	AAT	2	6	103822	103827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198327
1559	NC_015942	ATT	2	6	104251	104256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198327
1560	NC_015942	GAT	2	6	104383	104388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198327
1561	NC_015942	TGA	2	6	104436	104441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198327
1562	NC_015942	GGA	2	6	104475	104480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198327
1563	NC_015942	TTG	2	6	104501	104506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198327
1564	NC_015942	TGG	3	9	104546	104554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198327
1565	NC_015942	ATT	2	6	104607	104612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198327
1566	NC_015942	TCG	2	6	104666	104671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198327
1567	NC_015942	ATC	2	6	104684	104689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198327
1568	NC_015942	ATC	2	6	104761	104766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198327
1569	NC_015942	TGT	2	6	104812	104817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198327
1570	NC_015942	GCG	2	6	104835	104840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198327
1571	NC_015942	GTT	2	6	104907	104912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198327
1572	NC_015942	ATA	2	6	105031	105036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_015942	GAT	2	6	105077	105082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198328
1574	NC_015942	TCC	2	6	105144	105149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198328
1575	NC_015942	CTC	2	6	105170	105175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198328
1576	NC_015942	CGG	2	6	105226	105231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198328
1577	NC_015942	GAT	3	9	105500	105508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198328
1578	NC_015942	GCC	2	6	105512	105517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198328
1579	NC_015942	GGC	2	6	105548	105553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198328
1580	NC_015942	GCC	2	6	105555	105560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198328
1581	NC_015942	TTC	2	6	105584	105589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198328
1582	NC_015942	GCC	2	6	105598	105603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198328
1583	NC_015942	GCC	2	6	105611	105616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198328
1584	NC_015942	GAT	2	6	105656	105661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198328
1585	NC_015942	CGC	2	6	105751	105756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198328
1586	NC_015942	GGC	2	6	105812	105817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198328
1587	NC_015942	GTC	2	6	105857	105862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198328
1588	NC_015942	CAT	2	6	105878	105883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198328
1589	NC_015942	CGA	2	6	105988	105993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198328
1590	NC_015942	TCT	2	6	106002	106007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198328
1591	NC_015942	GCC	2	6	106037	106042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198328
1592	NC_015942	TTC	2	6	106094	106099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198328
1593	NC_015942	TGC	2	6	106201	106206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198328
1594	NC_015942	CAC	3	9	106229	106237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198328
1595	NC_015942	GTG	2	6	106280	106285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198328
1596	NC_015942	CCT	2	6	106321	106326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198328
1597	NC_015942	CGA	2	6	106384	106389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198328
1598	NC_015942	CGG	2	6	106416	106421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198328
1599	NC_015942	CCA	2	6	106444	106449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198328
1600	NC_015942	GGA	2	6	106486	106491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198328
1601	NC_015942	CCA	2	6	106501	106506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198328
1602	NC_015942	CAG	2	6	106541	106546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198328
1603	NC_015942	TTC	2	6	106547	106552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198328
1604	NC_015942	CGC	2	6	106638	106643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198329
1605	NC_015942	GCT	2	6	106780	106785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198329
1606	NC_015942	ACG	2	6	106928	106933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198329
1607	NC_015942	GCC	2	6	106940	106945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198329
1608	NC_015942	GAT	2	6	106948	106953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198329
1609	NC_015942	CGG	2	6	107052	107057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198329
1610	NC_015942	CTG	2	6	107086	107091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198329
1611	NC_015942	GGC	2	6	107103	107108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198329
1612	NC_015942	CAG	2	6	107166	107171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198330
1613	NC_015942	CGG	2	6	107174	107179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198330
1614	NC_015942	GGC	2	6	107448	107453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198330
1615	NC_015942	GGC	2	6	107514	107519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198330
1616	NC_015942	TGT	2	6	107538	107543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198330
1617	NC_015942	CTG	3	9	107550	107558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198330
1618	NC_015942	TTC	2	6	107580	107585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198330
1619	NC_015942	CTG	5	15	107598	107612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198330
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1621	NC_015942	CTG	2	6	107730	107735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198330
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1980	NC_015942	CTG	2	6	130554	130559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198352
1981	NC_015942	CCG	2	6	130560	130565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198352
1982	NC_015942	CGC	2	6	130569	130574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198352
1983	NC_015942	GCG	2	6	130601	130606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198352
1984	NC_015942	TGG	2	6	130647	130652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198352
1985	NC_015942	GGC	2	6	130693	130698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198352
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1988	NC_015942	CTG	2	6	130837	130842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198352
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1999	NC_015942	CTG	2	6	131349	131354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198352
2000	NC_015942	CAG	2	6	131365	131370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198352

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