MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 41485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015942	AGT	2	6	244	249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198244
2	NC_015942	GCG	2	6	292	297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198244
3	NC_015942	ACC	2	6	322	327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198244
4	NC_015942	CAG	2	6	331	336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198244
5	NC_015942	ATG	2	6	481	486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198244
6	NC_015942	GCA	2	6	646	651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198244
7	NC_015942	GGC	2	6	706	711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198244
8	NC_015942	TCA	2	6	809	814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198244
9	NC_015942	AGC	2	6	860	865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198244
10	NC_015942	CGA	2	6	894	899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198244
11	NC_015942	CGG	2	6	969	974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198244
12	NC_015942	ATT	2	6	982	987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198244
13	NC_015942	GAA	2	6	1123	1128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198244
14	NC_015942	GAA	2	6	1147	1152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198244
15	NC_015942	ATC	2	6	1219	1224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198244
16	NC_015942	ACA	2	6	1322	1327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198244
17	NC_015942	CGG	2	6	1479	1484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198244
18	NC_015942	ACC	2	6	1495	1500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198244
19	NC_015942	TCC	2	6	1502	1507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198244
20	NC_015942	GCC	2	6	1514	1519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198244
21	NC_015942	TGA	2	6	1878	1883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198245
22	NC_015942	TCG	2	6	2010	2015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198245
23	NC_015942	CCG	2	6	2040	2045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198245
24	NC_015942	CCG	2	6	2211	2216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198245
25	NC_015942	CAG	2	6	2242	2247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198245
26	NC_015942	ATG	2	6	2411	2416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198245
27	NC_015942	CAA	2	6	2431	2436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198245
28	NC_015942	TTC	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198245
29	NC_015942	CTG	2	6	2489	2494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198245
30	NC_015942	TGA	2	6	2503	2508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198245
31	NC_015942	CAA	2	6	2564	2569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198245
32	NC_015942	CAA	2	6	2678	2683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198245
33	NC_015942	ACC	2	6	2714	2719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198245
34	NC_015942	CAA	2	6	2734	2739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198245
35	NC_015942	GAA	2	6	2774	2779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198245
36	NC_015942	ACC	2	6	2855	2860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198245
37	NC_015942	CAG	2	6	2908	2913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198245
38	NC_015942	CAG	2	6	3045	3050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198246
39	NC_015942	GGA	2	6	3161	3166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198246
40	NC_015942	ATG	2	6	3250	3255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198246
41	NC_015942	TGC	2	6	3280	3285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198246
42	NC_015942	ACA	2	6	3319	3324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198246
43	NC_015942	TTG	2	6	3331	3336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198246
44	NC_015942	CGG	2	6	3343	3348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198246
45	NC_015942	CCG	2	6	3353	3358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198246
46	NC_015942	TTA	2	6	3380	3385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198246
47	NC_015942	ACT	2	6	3394	3399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198246
48	NC_015942	CGG	2	6	3423	3428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198246
49	NC_015942	GCC	2	6	3498	3503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198246
50	NC_015942	GAA	2	6	3507	3512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198246
51	NC_015942	CAG	2	6	3516	3521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198246
52	NC_015942	CGG	2	6	3522	3527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198246
53	NC_015942	GCG	2	6	3867	3872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198246
54	NC_015942	TGG	2	6	3897	3902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198246
55	NC_015942	CTG	2	6	3918	3923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198246
56	NC_015942	TGC	2	6	3938	3943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198246
57	NC_015942	CCG	3	9	3949	3957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198246
58	NC_015942	CGG	3	9	3967	3975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198246
59	NC_015942	GTG	2	6	3982	3987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198246
60	NC_015942	CAT	2	6	4030	4035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198246
61	NC_015942	GAT	2	6	4124	4129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198247
62	NC_015942	CAC	2	6	4142	4147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198247
63	NC_015942	GTG	2	6	4160	4165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198247
64	NC_015942	CGA	2	6	4177	4182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198247
65	NC_015942	CGG	2	6	4189	4194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198247
66	NC_015942	GTT	2	6	4211	4216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198247
67	NC_015942	GAT	2	6	4226	4231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198247
68	NC_015942	CTG	2	6	4299	4304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198247
69	NC_015942	TCA	2	6	4311	4316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198247
70	NC_015942	GGT	2	6	4334	4339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198247
71	NC_015942	TGA	2	6	4345	4350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198247
72	NC_015942	CGG	2	6	4369	4374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198247
73	NC_015942	ATG	2	6	4470	4475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198247
74	NC_015942	ATC	2	6	4529	4534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198247
75	NC_015942	CTG	2	6	4643	4648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198247
76	NC_015942	GAA	2	6	4667	4672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198247
77	NC_015942	GGT	2	6	4688	4693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198247
78	NC_015942	GCA	2	6	4722	4727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198247
79	NC_015942	TAT	2	6	4777	4782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198247
80	NC_015942	GCC	2	6	4790	4795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198247
81	NC_015942	CAA	2	6	4840	4845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198247
82	NC_015942	CAT	2	6	4933	4938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198247
83	NC_015942	GGT	3	9	4951	4959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198247
84	NC_015942	TTC	2	6	5026	5031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198247
85	NC_015942	TCC	2	6	5081	5086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198247
86	NC_015942	GCC	2	6	5144	5149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198247
87	NC_015942	TCG	2	6	5154	5159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198247
88	NC_015942	CGC	2	6	5207	5212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198247
89	NC_015942	TGG	2	6	5295	5300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198247
90	NC_015942	CCG	2	6	5310	5315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198247
91	NC_015942	TCG	2	6	5341	5346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198247
92	NC_015942	TCG	2	6	5417	5422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198247
93	NC_015942	CTG	3	9	5555	5563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198247
94	NC_015942	CTT	2	6	5566	5571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198247
95	NC_015942	TGG	2	6	5592	5597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198247
96	NC_015942	GAC	2	6	5672	5677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198247
97	NC_015942	GCC	2	6	5687	5692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198247
98	NC_015942	GCG	2	6	5735	5740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198247
99	NC_015942	ATG	2	6	5777	5782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198247
100	NC_015942	GCG	2	6	5824	5829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198247
101	NC_015942	GCC	2	6	5866	5871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198247
102	NC_015942	CGG	2	6	5886	5891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198247
103	NC_015942	GCC	2	6	5897	5902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198247
104	NC_015942	AAC	2	6	5919	5924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198247
105	NC_015942	CCG	2	6	5955	5960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198247
106	NC_015942	TGG	2	6	6006	6011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198247
107	NC_015942	CGC	2	6	6014	6019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198247
108	NC_015942	GGT	2	6	6071	6076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198247
109	NC_015942	ACC	2	6	6278	6283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198247
110	NC_015942	CGA	2	6	6340	6345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198247
111	NC_015942	CGC	2	6	6386	6391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198247
112	NC_015942	GAT	2	6	6482	6487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198248
113	NC_015942	CGT	2	6	6544	6549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198248
114	NC_015942	TGG	2	6	6588	6593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198248
115	NC_015942	TTC	2	6	6635	6640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198248
116	NC_015942	CAG	2	6	6644	6649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198248
117	NC_015942	GCA	2	6	6754	6759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198248
118	NC_015942	GGC	2	6	6830	6835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198248
119	NC_015942	GGA	2	6	6901	6906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198248
120	NC_015942	ACC	2	6	7041	7046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198248
121	NC_015942	TAT	2	6	7048	7053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198248
122	NC_015942	GAT	2	6	7097	7102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198248
123	NC_015942	GCT	2	6	7120	7125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198248
124	NC_015942	TGC	2	6	7207	7212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198248
125	NC_015942	TTC	2	6	7404	7409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198249
126	NC_015942	TTA	2	6	7505	7510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198249
127	NC_015942	ATG	2	6	7599	7604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198249
128	NC_015942	TGC	2	6	7632	7637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198249
129	NC_015942	GCC	2	6	7726	7731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198249
130	NC_015942	GGA	2	6	7732	7737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198249
131	NC_015942	GAA	2	6	7766	7771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198249
132	NC_015942	GTG	2	6	7822	7827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198249
133	NC_015942	GAT	2	6	7937	7942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198249
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253	NC_015942	CGG	2	6	16546	16551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198256
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255	NC_015942	GCA	2	6	16564	16569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198256
256	NC_015942	ACC	2	6	16761	16766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198256
257	NC_015942	TGA	2	6	16789	16794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198256
258	NC_015942	GCG	2	6	16802	16807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198256
259	NC_015942	TGA	3	9	16852	16860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198256
260	NC_015942	GCG	2	6	16971	16976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198256
261	NC_015942	GAT	2	6	17006	17011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198256
262	NC_015942	CGA	2	6	17086	17091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198256
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268	NC_015942	CCA	2	6	17706	17711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198257
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270	NC_015942	CAG	2	6	17862	17867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198257
271	NC_015942	GAT	2	6	17890	17895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198257
272	NC_015942	CGA	2	6	17967	17972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198257
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276	NC_015942	CGA	2	6	18192	18197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198257
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279	NC_015942	GCG	2	6	18371	18376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198257
280	NC_015942	TAA	2	6	18588	18593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198258
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284	NC_015942	ATT	2	6	18836	18841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198258
285	NC_015942	GAA	2	6	18854	18859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198258
286	NC_015942	GCG	2	6	18907	18912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198258
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288	NC_015942	ATC	2	6	19038	19043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198258
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361	NC_015942	CCG	2	6	23296	23301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198262
362	NC_015942	GCG	2	6	23309	23314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198262
363	NC_015942	TAT	2	6	23372	23377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198262
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366	NC_015942	GAG	2	6	23832	23837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198262
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373	NC_015942	CCT	2	6	24134	24139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198263
374	NC_015942	AGC	2	6	24166	24171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198263
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