MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 41485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015942	GCG	2	6	244117	244122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198466
3502	NC_015942	GCA	2	6	244247	244252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198466
3503	NC_015942	GAG	2	6	244256	244261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198466
3504	NC_015942	ATC	2	6	244395	244400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198466
3505	NC_015942	ACG	3	9	244408	244416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198466
3506	NC_015942	TTC	2	6	244426	244431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198466
3507	NC_015942	GGA	2	6	244530	244535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198466
3508	NC_015942	GAT	2	6	244595	244600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198466
3509	NC_015942	GCA	2	6	244636	244641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198466
3510	NC_015942	CCA	2	6	244694	244699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198466
3511	NC_015942	TGC	2	6	244767	244772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198466
3512	NC_015942	GGC	2	6	244773	244778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198466
3513	NC_015942	CTG	2	6	245177	245182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198467
3514	NC_015942	GCG	2	6	245188	245193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198467
3515	NC_015942	CGG	2	6	245215	245220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198467
3516	NC_015942	ATA	2	6	245249	245254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198467
3517	NC_015942	GGC	2	6	245333	245338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198467
3518	NC_015942	CCG	2	6	245407	245412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198467
3519	NC_015942	ATT	2	6	245444	245449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198467
3520	NC_015942	CCA	2	6	245458	245463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198467
3521	NC_015942	ATC	2	6	245484	245489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198467
3522	NC_015942	ATC	2	6	245759	245764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198468
3523	NC_015942	CGG	2	6	245773	245778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198468
3524	NC_015942	GTG	2	6	245784	245789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198468
3525	NC_015942	TAT	2	6	245850	245855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198468
3526	NC_015942	TTA	2	6	245858	245863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198468
3527	NC_015942	TGC	2	6	246381	246386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198469
3528	NC_015942	CTG	2	6	246485	246490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198469
3529	NC_015942	AGC	2	6	246510	246515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198469
3530	NC_015942	TGC	2	6	246598	246603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198469
3531	NC_015942	CCA	2	6	246632	246637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198469
3532	NC_015942	GCC	2	6	246674	246679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198469
3533	NC_015942	CCG	2	6	246702	246707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198469
3534	NC_015942	TTC	2	6	246731	246736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198469
3535	NC_015942	CGG	2	6	246747	246752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198469
3536	NC_015942	TTG	2	6	246758	246763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198469
3537	NC_015942	GAG	2	6	246770	246775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198469
3538	NC_015942	ATG	2	6	246819	246824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198469
3539	NC_015942	ATC	2	6	246848	246853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198469
3540	NC_015942	CTT	2	6	246937	246942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198469
3541	NC_015942	ATG	2	6	246975	246980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198469
3542	NC_015942	AGG	2	6	247088	247093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198470
3543	NC_015942	CGG	2	6	247122	247127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198470
3544	NC_015942	ATC	2	6	247172	247177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198470
3545	NC_015942	GCG	2	6	247268	247273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198470
3546	NC_015942	GTC	2	6	247288	247293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198470
3547	NC_015942	TCG	2	6	247439	247444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198470
3548	NC_015942	AGC	2	6	247471	247476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198470
3549	NC_015942	GCA	2	6	247566	247571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198470
3550	NC_015942	TGC	2	6	247634	247639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198470
3551	NC_015942	GAT	2	6	247687	247692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198470
3552	NC_015942	CGG	2	6	247769	247774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198470
3553	NC_015942	TCA	2	6	247775	247780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198470
3554	NC_015942	GCC	2	6	247817	247822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198470
3555	NC_015942	GTG	2	6	247849	247854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198470
3556	NC_015942	GGT	2	6	247891	247896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198470
3557	NC_015942	CTG	2	6	247924	247929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198470
3558	NC_015942	ATC	2	6	247930	247935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198470
3559	NC_015942	CAG	2	6	247960	247965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198470
3560	NC_015942	CAG	3	9	248014	248022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198470
3561	NC_015942	GCA	2	6	248067	248072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198470
3562	NC_015942	GCA	2	6	248100	248105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198470
3563	NC_015942	TTC	2	6	248227	248232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198470
3564	NC_015942	GGC	2	6	248317	248322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198470
3565	NC_015942	GAT	2	6	248446	248451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198470
3566	NC_015942	TCC	2	6	248531	248536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198470
3567	NC_015942	GCC	2	6	248696	248701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198470
3568	NC_015942	TGT	2	6	248744	248749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198470
3569	NC_015942	ATC	2	6	248774	248779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198470
3570	NC_015942	CAG	2	6	248923	248928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198471
3571	NC_015942	CCA	3	9	249189	249197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198471
3572	NC_015942	GTA	2	6	249242	249247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198471
3573	NC_015942	CCA	2	6	249277	249282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198471
3574	NC_015942	CGG	2	6	249400	249405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198471
3575	NC_015942	CCA	2	6	249496	249501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198471
3576	NC_015942	TGC	2	6	249551	249556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198471
3577	NC_015942	CCG	2	6	249621	249626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198471
3578	NC_015942	GCC	2	6	249735	249740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198471
3579	NC_015942	CCA	2	6	249822	249827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198471
3580	NC_015942	AAT	2	6	249884	249889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198471
3581	NC_015942	CGC	2	6	249919	249924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198471
3582	NC_015942	ATG	2	6	250005	250010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198471
3583	NC_015942	GCA	2	6	250167	250172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198471
3584	NC_015942	CAT	2	6	250187	250192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198471
3585	NC_015942	TCT	2	6	250213	250218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198471
3586	NC_015942	ACC	2	6	250226	250231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198471
3587	NC_015942	TTC	2	6	250464	250469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198472
3588	NC_015942	GTA	2	6	250718	250723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198472
3589	NC_015942	ACG	2	6	250906	250911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198472
3590	NC_015942	ACC	2	6	251108	251113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198472
3591	NC_015942	AGC	2	6	251229	251234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198472
3592	NC_015942	GTT	2	6	251348	251353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198472
3593	NC_015942	GAG	2	6	251364	251369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198472
3594	NC_015942	TTG	2	6	251428	251433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198472
3595	NC_015942	GGC	3	9	251463	251471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198472
3596	NC_015942	CGC	2	6	251480	251485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198472
3597	NC_015942	ATC	2	6	251505	251510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198472
3598	NC_015942	TGA	2	6	251525	251530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198472
3599	NC_015942	GAT	2	6	251613	251618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198473
3600	NC_015942	GAA	2	6	251626	251631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198473
3601	NC_015942	CAA	2	6	251695	251700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198473
3602	NC_015942	TAA	2	6	251767	251772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198473
3603	NC_015942	CGA	2	6	251831	251836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198473
3604	NC_015942	GTG	2	6	251919	251924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198473
3605	NC_015942	GAG	2	6	251944	251949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198473
3606	NC_015942	CGA	2	6	251958	251963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198473
3607	NC_015942	GTG	2	6	252053	252058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198473
3608	NC_015942	TTA	2	6	252284	252289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198473
3609	NC_015942	GTA	2	6	252292	252297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198473
3610	NC_015942	TGA	2	6	252312	252317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198473
3611	NC_015942	GTT	2	6	252327	252332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198473
3612	NC_015942	GAT	2	6	252382	252387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198473
3613	NC_015942	TCA	2	6	252398	252403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198473
3614	NC_015942	TTC	2	6	252481	252486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198473
3615	NC_015942	TGA	2	6	252558	252563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198473
3616	NC_015942	CCA	2	6	252641	252646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198473
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3618	NC_015942	TTG	2	6	252797	252802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198473
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