MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 41485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_015942	ACT	2	6	70419	70424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198301
1003	NC_015942	TGC	2	6	70469	70474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198301
1004	NC_015942	CAA	2	6	70479	70484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198301
1005	NC_015942	TAT	2	6	70487	70492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198301
1006	NC_015942	CAA	2	6	70520	70525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198301
1007	NC_015942	ATA	2	6	70602	70607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198301
1008	NC_015942	GGT	2	6	70635	70640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198301
1009	NC_015942	CAC	2	6	70700	70705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198301
1010	NC_015942	CAC	2	6	70718	70723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198301
1011	NC_015942	GTA	2	6	70755	70760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198301
1012	NC_015942	ATT	2	6	70881	70886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198301
1013	NC_015942	ATT	2	6	70903	70908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198301
1014	NC_015942	AGT	2	6	70927	70932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198301
1015	NC_015942	ATG	2	6	70979	70984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198301
1016	NC_015942	CAT	2	6	70995	71000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198301
1017	NC_015942	GGT	2	6	71001	71006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198301
1018	NC_015942	ACC	2	6	71115	71120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198301
1019	NC_015942	AGA	2	6	71130	71135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198301
1020	NC_015942	AGT	2	6	71174	71179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198301
1021	NC_015942	GAA	2	6	71214	71219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198301
1022	NC_015942	AAT	2	6	71284	71289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198301
1023	NC_015942	GAA	2	6	71456	71461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198302
1024	NC_015942	CAT	2	6	71523	71528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198302
1025	NC_015942	ACA	2	6	71571	71576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198302
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1027	NC_015942	CAA	2	6	71739	71744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198302
1028	NC_015942	AAG	2	6	71908	71913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198302
1029	NC_015942	TGC	2	6	71916	71921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198302
1030	NC_015942	TTA	2	6	72036	72041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198302
1031	NC_015942	TAA	2	6	72173	72178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198303
1032	NC_015942	CGA	2	6	72230	72235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198303
1033	NC_015942	ATA	2	6	72401	72406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198303
1034	NC_015942	TGC	2	6	72435	72440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198303
1035	NC_015942	TGT	2	6	72540	72545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198303
1036	NC_015942	AGA	2	6	72850	72855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198303
1037	NC_015942	ATA	2	6	72880	72885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198303
1038	NC_015942	GAT	2	6	72958	72963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198303
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1040	NC_015942	TGC	2	6	73134	73139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198304
1041	NC_015942	CTG	2	6	73196	73201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198304
1042	NC_015942	AGG	2	6	73398	73403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198304
1043	NC_015942	TAT	2	6	73412	73417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198304
1044	NC_015942	CCG	2	6	73615	73620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198304
1045	NC_015942	CTT	2	6	73643	73648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198304
1046	NC_015942	CAT	2	6	73653	73658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198304
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1051	NC_015942	ACA	2	6	74083	74088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198304
1052	NC_015942	CAT	3	9	74226	74234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198304
1053	NC_015942	TGC	2	6	74427	74432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198304
1054	NC_015942	ATA	2	6	74917	74922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198305
1055	NC_015942	ATG	2	6	74974	74979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198305
1056	NC_015942	CAT	2	6	74983	74988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198305
1057	NC_015942	CAG	2	6	75189	75194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198306
1058	NC_015942	CTG	2	6	75255	75260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198306
1059	NC_015942	CTG	2	6	75426	75431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198306
1060	NC_015942	CCA	2	6	75557	75562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198306
1061	NC_015942	GAT	2	6	75633	75638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198306
1062	NC_015942	GCC	2	6	75697	75702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198306
1063	NC_015942	CGC	2	6	75723	75728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198306
1064	NC_015942	CCG	2	6	75758	75763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198306
1065	NC_015942	ACC	2	6	75781	75786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198306
1066	NC_015942	CCA	2	6	75869	75874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198306
1067	NC_015942	GCC	2	6	76042	76047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198306
1068	NC_015942	CGG	2	6	76076	76081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198306
1069	NC_015942	TGC	2	6	76085	76090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198306
1070	NC_015942	CAG	2	6	76116	76121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198306
1071	NC_015942	TGC	2	6	76123	76128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198306
1072	NC_015942	GCC	3	9	76165	76173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198306
1073	NC_015942	CGG	2	6	76463	76468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198306
1074	NC_015942	CGG	2	6	76543	76548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198306
1075	NC_015942	TGA	2	6	76640	76645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198306
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1078	NC_015942	TTC	2	6	76857	76862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198306
1079	NC_015942	GCC	2	6	76873	76878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198306
1080	NC_015942	ATA	2	6	76920	76925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198306
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1082	NC_015942	ACC	2	6	76962	76967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198306
1083	NC_015942	CAC	2	6	76974	76979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198306
1084	NC_015942	CAC	2	6	77100	77105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198306
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1087	NC_015942	CAG	2	6	77307	77312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198306
1088	NC_015942	TCC	2	6	77329	77334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198306
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1090	NC_015942	GAT	2	6	77438	77443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198306
1091	NC_015942	CCG	2	6	77459	77464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198306
1092	NC_015942	CAG	2	6	77547	77552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198306
1093	NC_015942	CCA	2	6	77708	77713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198306
1094	NC_015942	GAG	2	6	77754	77759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198306
1095	NC_015942	TTC	2	6	77778	77783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198306
1096	NC_015942	TCT	2	6	77849	77854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198306
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1099	NC_015942	ATC	2	6	78018	78023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198306
1100	NC_015942	CAC	2	6	78133	78138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198306
1101	NC_015942	TTC	2	6	78189	78194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198306
1102	NC_015942	TCC	2	6	78223	78228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198306
1103	NC_015942	GGC	2	6	78229	78234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198306
1104	NC_015942	GCA	2	6	78323	78328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198306
1105	NC_015942	GAC	2	6	78351	78356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198306
1106	NC_015942	GCG	2	6	78437	78442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198306
1107	NC_015942	TAA	2	6	78450	78455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198306
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1109	NC_015942	AAT	2	6	78668	78673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198307
1110	NC_015942	GGA	2	6	78755	78760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198307
1111	NC_015942	CGC	2	6	79027	79032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198308
1112	NC_015942	TTC	2	6	79037	79042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198308
1113	NC_015942	GCT	2	6	79121	79126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198308
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1117	NC_015942	CTC	2	6	79633	79638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198308
1118	NC_015942	GCT	2	6	79685	79690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198308
1119	NC_015942	TCA	2	6	79706	79711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198308
1120	NC_015942	AGC	2	6	79721	79726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198308
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1122	NC_015942	ACT	2	6	79798	79803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198308
1123	NC_015942	CAT	2	6	79952	79957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198309
1124	NC_015942	TCA	2	6	80033	80038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198309
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1126	NC_015942	TCA	2	6	80357	80362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198310
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1240	NC_015942	TTC	2	6	89094	89099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198316
1241	NC_015942	ACC	2	6	89209	89214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198316
1242	NC_015942	GGA	2	6	89327	89332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198316
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1367	NC_015942	CAT	2	6	98945	98950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198324
1368	NC_015942	GAT	2	6	98990	98995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198324
1369	NC_015942	GGC	2	6	99008	99013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198324
1370	NC_015942	TGA	2	6	99190	99195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198324
1371	NC_015942	GCG	2	6	99207	99212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198324
1372	NC_015942	CTA	2	6	99230	99235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198324
1373	NC_015942	TGG	2	6	99283	99288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198324
1374	NC_015942	ATG	2	6	99396	99401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198324
1375	NC_015942	TGG	2	6	99436	99441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198324
1376	NC_015942	GCG	2	6	99478	99483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198324
1377	NC_015942	GTG	2	6	99484	99489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198324
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1379	NC_015942	CTT	2	6	99560	99565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198324
1380	NC_015942	CCA	2	6	99580	99585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198324
1381	NC_015942	GTG	2	6	99731	99736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198324
1382	NC_015942	GGT	2	6	99755	99760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198324
1383	NC_015942	TCA	2	6	100159	100164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198325
1384	NC_015942	TGA	2	6	100445	100450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198326
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1387	NC_015942	CAC	2	6	100516	100521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198326
1388	NC_015942	ATG	2	6	100604	100609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198326
1389	NC_015942	CTG	2	6	100641	100646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198326
1390	NC_015942	CTG	2	6	101092	101097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198327
1391	NC_015942	TCC	2	6	101318	101323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198327
1392	NC_015942	CAT	2	6	101400	101405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198327
1393	NC_015942	CAT	2	6	101475	101480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198327
1394	NC_015942	TGC	2	6	101504	101509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198327
1395	NC_015942	TAC	2	6	101570	101575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198327
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1398	NC_015942	GGT	2	6	101685	101690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198327
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1403	NC_015942	GGC	2	6	101979	101984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198327
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1485	NC_015942	GGC	2	6	107103	107108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198329
1486	NC_015942	CAG	2	6	107166	107171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198330
1487	NC_015942	CGG	2	6	107174	107179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198330
1488	NC_015942	GGC	2	6	107448	107453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198330
1489	NC_015942	GGC	2	6	107514	107519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198330
1490	NC_015942	TGT	2	6	107538	107543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198330
1491	NC_015942	CTG	3	9	107550	107558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198330
1492	NC_015942	TTC	2	6	107580	107585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198330
1493	NC_015942	CTG	5	15	107598	107612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198330
1494	NC_015942	GTT	2	6	107666	107671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198330
1495	NC_015942	CTG	2	6	107730	107735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198330
1496	NC_015942	GCC	2	6	107764	107769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198330
1497	NC_015942	GTT	2	6	107777	107782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198330
1498	NC_015942	TCA	2	6	107858	107863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198330
1499	NC_015942	GCT	2	6	107871	107876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198330
1500	NC_015942	TTG	2	6	107949	107954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198330

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