MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 41485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015942	CAG	2	6	33968	33973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198267
502	NC_015942	CCG	2	6	34045	34050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198267
503	NC_015942	GAT	2	6	34129	34134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198267
504	NC_015942	CGG	2	6	34327	34332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198267
505	NC_015942	GCC	2	6	34353	34358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198267
506	NC_015942	TCA	2	6	34476	34481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198267
507	NC_015942	GGC	2	6	34661	34666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198267
508	NC_015942	ACC	2	6	34668	34673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198267
509	NC_015942	GTG	2	6	34702	34707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198267
510	NC_015942	AGG	2	6	34765	34770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198267
511	NC_015942	CAA	2	6	34784	34789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198267
512	NC_015942	GAA	2	6	34802	34807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198267
513	NC_015942	TCA	2	6	34843	34848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198267
514	NC_015942	CAT	2	6	34852	34857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198267
515	NC_015942	GCA	2	6	34861	34866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198267
516	NC_015942	TGC	2	6	34931	34936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198267
517	NC_015942	GCG	2	6	34975	34980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198267
518	NC_015942	GAT	2	6	35000	35005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198267
519	NC_015942	AGT	2	6	35067	35072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198267
520	NC_015942	AAC	2	6	35073	35078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198267
521	NC_015942	GAC	2	6	35085	35090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198267
522	NC_015942	TTC	2	6	35285	35290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198267
523	NC_015942	GAC	2	6	35297	35302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198267
524	NC_015942	CGA	2	6	35584	35589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198267
525	NC_015942	TGA	2	6	35695	35700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198267
526	NC_015942	TGC	2	6	35710	35715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198267
527	NC_015942	AGC	2	6	35772	35777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198267
528	NC_015942	ATC	2	6	35885	35890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198267
529	NC_015942	CAA	2	6	36050	36055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198267
530	NC_015942	CAG	2	6	36080	36085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198267
531	NC_015942	AAC	2	6	36095	36100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198267
532	NC_015942	CCA	2	6	36239	36244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198267
533	NC_015942	ATA	2	6	36313	36318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198267
534	NC_015942	CAG	2	6	36431	36436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198267
535	NC_015942	ATA	2	6	36437	36442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198267
536	NC_015942	CGC	2	6	36463	36468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198267
537	NC_015942	TGC	2	6	36477	36482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198267
538	NC_015942	CCG	2	6	36511	36516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198267
539	NC_015942	TCA	2	6	36528	36533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198267
540	NC_015942	CTG	3	9	36537	36545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198267
541	NC_015942	CGT	2	6	36601	36606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198267
542	NC_015942	ACA	2	6	36642	36647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198267
543	NC_015942	CTC	2	6	36860	36865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198267
544	NC_015942	CAG	2	6	36923	36928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198267
545	NC_015942	GGC	2	6	36977	36982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198267
546	NC_015942	CAA	2	6	37037	37042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198267
547	NC_015942	GCA	2	6	37051	37056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198267
548	NC_015942	TTG	2	6	37277	37282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198267
549	NC_015942	GCT	2	6	37333	37338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198267
550	NC_015942	GCG	2	6	37389	37394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198267
551	NC_015942	TGT	2	6	37473	37478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198267
552	NC_015942	GTT	2	6	37483	37488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198267
553	NC_015942	AAC	2	6	37497	37502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198267
554	NC_015942	CCG	2	6	37739	37744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198268
555	NC_015942	TTC	2	6	37748	37753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198268
556	NC_015942	TCT	2	6	37773	37778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198268
557	NC_015942	GCT	2	6	37797	37802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198268
558	NC_015942	CTG	2	6	37822	37827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198268
559	NC_015942	TTG	2	6	37998	38003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198269
560	NC_015942	ATG	2	6	38031	38036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198269
561	NC_015942	TTC	2	6	38058	38063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198269
562	NC_015942	TAT	2	6	38486	38491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198270
563	NC_015942	AAG	2	6	38536	38541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198270
564	NC_015942	TGG	2	6	38635	38640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198270
565	NC_015942	CCG	2	6	38711	38716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198270
566	NC_015942	GCC	2	6	38725	38730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198270
567	NC_015942	CAG	2	6	38842	38847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198270
568	NC_015942	GCA	2	6	38916	38921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198270
569	NC_015942	CGC	2	6	39122	39127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198270
570	NC_015942	AAG	2	6	39185	39190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198270
571	NC_015942	GGC	2	6	39198	39203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198270
572	NC_015942	GTG	2	6	39238	39243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198270
573	NC_015942	CGG	3	9	39287	39295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198270
574	NC_015942	CTG	2	6	39343	39348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198270
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577	NC_015942	CAG	2	6	39445	39450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198270
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579	NC_015942	AGG	2	6	39464	39469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198270
580	NC_015942	CGG	2	6	39487	39492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198270
581	NC_015942	TGG	2	6	39494	39499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198270
582	NC_015942	GTG	2	6	39505	39510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198270
583	NC_015942	GTC	2	6	39538	39543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198270
584	NC_015942	GCC	2	6	39580	39585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198270
585	NC_015942	GCA	2	6	39720	39725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198270
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587	NC_015942	CCG	2	6	39827	39832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198270
588	NC_015942	GCC	2	6	39901	39906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198270
589	NC_015942	GCG	2	6	39930	39935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198270
590	NC_015942	TCG	2	6	39979	39984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198270
591	NC_015942	CAG	2	6	40187	40192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198270
592	NC_015942	TGC	2	6	40388	40393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198270
593	NC_015942	GAT	2	6	40426	40431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198270
594	NC_015942	AGG	2	6	40448	40453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198270
595	NC_015942	CAG	2	6	40479	40484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198270
596	NC_015942	GGC	2	6	40536	40541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198270
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598	NC_015942	ATG	2	6	40649	40654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198270
599	NC_015942	TGC	2	6	40727	40732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198270
600	NC_015942	CCG	2	6	40875	40880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198270
601	NC_015942	GCT	2	6	40911	40916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198270
602	NC_015942	TGC	2	6	40926	40931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198270
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604	NC_015942	TGG	2	6	41024	41029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198270
605	NC_015942	AGC	2	6	41065	41070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198270
606	NC_015942	CTG	2	6	41188	41193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198270
607	NC_015942	TCA	2	6	41247	41252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198270
608	NC_015942	CCG	2	6	41310	41315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198270
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610	NC_015942	TGC	2	6	41450	41455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198270
611	NC_015942	TCG	2	6	41459	41464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198270
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613	NC_015942	ACC	2	6	41552	41557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198270
614	NC_015942	GGA	2	6	41619	41624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198270
615	NC_015942	GGT	2	6	41883	41888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198270
616	NC_015942	CGG	2	6	41942	41947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198270
617	NC_015942	AAG	2	6	41992	41997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198270
618	NC_015942	GGT	2	6	42044	42049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198270
619	NC_015942	TCT	2	6	42210	42215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198270
620	NC_015942	CTC	2	6	42270	42275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198270
621	NC_015942	TGG	3	9	42413	42421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198270
622	NC_015942	TCC	2	6	42476	42481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198270
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997	NC_015942	ACC	2	6	70074	70079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198301
998	NC_015942	GTA	2	6	70125	70130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198301
999	NC_015942	CTG	2	6	70167	70172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198301
1000	NC_015942	ATC	2	6	70240	70245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198301

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