MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 41485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015942	TCG	2	6	314118	314123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198528
4502	NC_015942	CCA	2	6	314140	314145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198528
4503	NC_015942	CGG	2	6	314206	314211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198528
4504	NC_015942	CCA	2	6	314245	314250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198528
4505	NC_015942	GAC	2	6	314260	314265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198528
4506	NC_015942	TTC	2	6	314408	314413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198528
4507	NC_015942	GGC	2	6	314419	314424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198528
4508	NC_015942	GGC	2	6	314449	314454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198528
4509	NC_015942	TTC	2	6	314471	314476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198528
4510	NC_015942	ACG	2	6	314526	314531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198528
4511	NC_015942	GGC	2	6	314717	314722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198528
4512	NC_015942	CGG	2	6	314821	314826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198528
4513	NC_015942	TTG	2	6	314829	314834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198528
4514	NC_015942	CTT	2	6	315059	315064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198528
4515	NC_015942	GAG	2	6	315092	315097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198528
4516	NC_015942	GAT	2	6	315146	315151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198528
4517	NC_015942	GCA	2	6	315178	315183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198528
4518	NC_015942	GCA	2	6	315275	315280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198528
4519	NC_015942	GCG	2	6	315482	315487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198528
4520	NC_015942	CGA	2	6	315521	315526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198528
4521	NC_015942	TGA	2	6	315550	315555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198528
4522	NC_015942	TTG	2	6	315748	315753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198529
4523	NC_015942	GTG	2	6	315794	315799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198529
4524	NC_015942	CAA	2	6	315855	315860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198529
4525	NC_015942	CGT	2	6	315885	315890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198529
4526	NC_015942	GCA	2	6	315938	315943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198529
4527	NC_015942	TCG	2	6	316019	316024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198529
4528	NC_015942	TGG	2	6	316040	316045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198529
4529	NC_015942	GGC	2	6	316063	316068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198529
4530	NC_015942	GCG	2	6	316072	316077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198529
4531	NC_015942	TGA	2	6	316083	316088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198529
4532	NC_015942	GGC	2	6	316111	316116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198529
4533	NC_015942	AGC	2	6	316117	316122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198529
4534	NC_015942	GCC	2	6	316152	316157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198529
4535	NC_015942	CGG	2	6	316163	316168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198529
4536	NC_015942	TGA	3	9	316176	316184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198529
4537	NC_015942	GCC	2	6	316661	316666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198530
4538	NC_015942	GCA	2	6	316770	316775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198530
4539	NC_015942	GCC	2	6	316784	316789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198530
4540	NC_015942	CGC	2	6	316828	316833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198530
4541	NC_015942	GCC	2	6	316904	316909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198530
4542	NC_015942	TGC	2	6	316977	316982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198530
4543	NC_015942	CTG	2	6	317024	317029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198530
4544	NC_015942	ACG	2	6	317064	317069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198530
4545	NC_015942	GCT	2	6	317164	317169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198530
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4547	NC_015942	GGC	2	6	317225	317230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198530
4548	NC_015942	GCG	2	6	317298	317303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198530
4549	NC_015942	CGA	2	6	317314	317319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198530
4550	NC_015942	GCC	2	6	317334	317339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198530
4551	NC_015942	CGG	2	6	317380	317385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198530
4552	NC_015942	CTA	2	6	317398	317403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198530
4553	NC_015942	TGG	2	6	317499	317504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198530
4554	NC_015942	TTC	2	6	317753	317758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198530
4555	NC_015942	CGA	2	6	318094	318099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198530
4556	NC_015942	AGC	2	6	318111	318116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198530
4557	NC_015942	CGC	2	6	318181	318186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198530
4558	NC_015942	CAC	2	6	318319	318324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198531
4559	NC_015942	ACC	2	6	318539	318544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198531
4560	NC_015942	ACC	2	6	318722	318727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198531
4561	NC_015942	TGA	2	6	318783	318788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198531
4562	NC_015942	CTA	2	6	319029	319034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198531
4563	NC_015942	CCT	2	6	319035	319040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198531
4564	NC_015942	TCG	2	6	319042	319047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198531
4565	NC_015942	TGC	2	6	319074	319079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198531
4566	NC_015942	GTG	2	6	319123	319128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198531
4567	NC_015942	CCG	2	6	319218	319223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198531
4568	NC_015942	CTG	3	9	319234	319242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198531
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4570	NC_015942	AAG	2	6	319386	319391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198532
4571	NC_015942	ATT	2	6	319403	319408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198532
4572	NC_015942	GAA	2	6	319442	319447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198532
4573	NC_015942	TGC	2	6	319491	319496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198532
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4576	NC_015942	TAT	2	6	319767	319772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198532
4577	NC_015942	GGC	2	6	319843	319848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198532
4578	NC_015942	TAA	2	6	320038	320043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198533
4579	NC_015942	TCG	2	6	320103	320108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198533
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4582	NC_015942	CTG	2	6	320318	320323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198533
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4585	NC_015942	GGC	2	6	320803	320808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198534
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4587	NC_015942	CAA	2	6	320922	320927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198534
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4589	NC_015942	CGG	2	6	320976	320981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198534
4590	NC_015942	GAT	2	6	320994	320999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198534
4591	NC_015942	TGC	2	6	321174	321179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198534
4592	NC_015942	CGA	2	6	321260	321265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198534
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4595	NC_015942	TCG	2	6	321355	321360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198534
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4597	NC_015942	TGT	2	6	321497	321502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198534
4598	NC_015942	CGA	2	6	321564	321569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198534
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4601	NC_015942	TGG	2	6	321750	321755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198535
4602	NC_015942	CAA	2	6	321811	321816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198535
4603	NC_015942	GGC	2	6	321862	321867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198535
4604	NC_015942	GCT	2	6	321886	321891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198535
4605	NC_015942	CGG	2	6	321931	321936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198535
4606	NC_015942	AAT	2	6	321983	321988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198535
4607	NC_015942	CTG	2	6	321995	322000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198535
4608	NC_015942	GGT	2	6	322015	322020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198535
4609	NC_015942	GCC	2	6	322038	322043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198535
4610	NC_015942	GTG	2	6	322079	322084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198535
4611	NC_015942	AAG	2	6	322094	322099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198535
4612	NC_015942	AGC	2	6	322149	322154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198535
4613	NC_015942	GTT	2	6	322183	322188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198535
4614	NC_015942	CCG	2	6	322230	322235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198535
4615	NC_015942	TTC	2	6	322247	322252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198535
4616	NC_015942	TGC	2	6	322308	322313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198535
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4618	NC_015942	TTC	2	6	322532	322537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198535
4619	NC_015942	TGC	2	6	322548	322553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198535
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4973	NC_015942	TGC	2	6	346674	346679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198554
4974	NC_015942	GCG	2	6	346752	346757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198554
4975	NC_015942	CCG	2	6	346778	346783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198554
4976	NC_015942	GTC	2	6	346869	346874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198554
4977	NC_015942	GCC	2	6	347141	347146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198554
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4998	NC_015942	GGC	2	6	348763	348768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198557
4999	NC_015942	GGT	2	6	348809	348814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198557
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