MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 41485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_015942	TAA	2	6	3169299	3169304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201295
41003	NC_015942	ATG	2	6	3169363	3169368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201295
41004	NC_015942	TGG	2	6	3169386	3169391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201295
41005	NC_015942	CAT	2	6	3169412	3169417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201295
41006	NC_015942	AAT	2	6	3169485	3169490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201295
41007	NC_015942	AAG	2	6	3169557	3169562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201295
41008	NC_015942	GTA	2	6	3169652	3169657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201295
41009	NC_015942	AGA	2	6	3169729	3169734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201295
41010	NC_015942	GCA	2	6	3169780	3169785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201295
41011	NC_015942	CCA	2	6	3169786	3169791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201295
41012	NC_015942	GCT	2	6	3169882	3169887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201295
41013	NC_015942	CCA	2	6	3170268	3170273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201295
41014	NC_015942	CAG	2	6	3170300	3170305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201295
41015	NC_015942	GGT	2	6	3170325	3170330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201295
41016	NC_015942	TGC	2	6	3170404	3170409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201295
41017	NC_015942	AAG	2	6	3170439	3170444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201295
41018	NC_015942	CCA	2	6	3170453	3170458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201295
41019	NC_015942	GCA	2	6	3170465	3170470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201295
41020	NC_015942	ATC	2	6	3170601	3170606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201296
41021	NC_015942	TCG	2	6	3170664	3170669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201296
41022	NC_015942	CAG	2	6	3170897	3170902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201296
41023	NC_015942	GGC	2	6	3171063	3171068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201296
41024	NC_015942	TCG	2	6	3171123	3171128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201296
41025	NC_015942	CGT	2	6	3171301	3171306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201296
41026	NC_015942	CTG	2	6	3171379	3171384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201296
41027	NC_015942	AGC	2	6	3171410	3171415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201296
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41029	NC_015942	AGC	2	6	3171525	3171530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201296
41030	NC_015942	ACC	2	6	3171600	3171605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201296
41031	NC_015942	TTG	2	6	3171615	3171620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201296
41032	NC_015942	TCA	2	6	3171759	3171764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201296
41033	NC_015942	ATG	3	9	3171864	3171872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201296
41034	NC_015942	CGC	2	6	3171957	3171962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201296
41035	NC_015942	CGC	2	6	3171989	3171994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201296
41036	NC_015942	CAG	2	6	3172223	3172228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201296
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41038	NC_015942	TCA	2	6	3172296	3172301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201296
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41041	NC_015942	TCG	2	6	3172542	3172547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201296
41042	NC_015942	ATG	2	6	3172638	3172643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201296
41043	NC_015942	GGA	2	6	3172656	3172661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201296
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41049	NC_015942	CCA	2	6	3173301	3173306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201296
41050	NC_015942	CCA	2	6	3173350	3173355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201296
41051	NC_015942	GAA	2	6	3173423	3173428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201296
41052	NC_015942	CTT	2	6	3173455	3173460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201296
41053	NC_015942	CGG	2	6	3173691	3173696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201296
41054	NC_015942	GGC	2	6	3173717	3173722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201296
41055	NC_015942	TTG	2	6	3173759	3173764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201296
41056	NC_015942	TGC	2	6	3173818	3173823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201296
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41059	NC_015942	TCG	2	6	3174354	3174359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201297
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41064	NC_015942	GAT	2	6	3174653	3174658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201297
41065	NC_015942	GCA	2	6	3174661	3174666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201297
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41067	NC_015942	CGA	2	6	3174859	3174864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201297
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41071	NC_015942	GCA	2	6	3175167	3175172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201298
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41099	NC_015942	CGG	2	6	3178054	3178059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201304
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41102	NC_015942	CCG	2	6	3178190	3178195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201305
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41113	NC_015942	GCG	2	6	3179594	3179599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201308
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41453	NC_015942	CGC	2	6	3204135	3204140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201334
41454	NC_015942	CAG	2	6	3204160	3204165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201334
41455	NC_015942	TAT	2	6	3204243	3204248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201334
41456	NC_015942	TGT	2	6	3204366	3204371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201334
41457	NC_015942	CCT	2	6	3204385	3204390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201334
41458	NC_015942	ACG	2	6	3204504	3204509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201335
41459	NC_015942	GAT	2	6	3204519	3204524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201335
41460	NC_015942	TCA	2	6	3204566	3204571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201335
41461	NC_015942	ATA	2	6	3204617	3204622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201335
41462	NC_015942	CGC	3	9	3204648	3204656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201336
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41465	NC_015942	TCC	2	6	3204854	3204859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201336
41466	NC_015942	CCT	2	6	3204880	3204885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201336
41467	NC_015942	GAA	2	6	3204936	3204941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201336
41468	NC_015942	GTA	2	6	3204947	3204952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201336
41469	NC_015942	TCT	2	6	3205002	3205007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201336
41470	NC_015942	GTA	2	6	3205023	3205028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201336
41471	NC_015942	TTC	2	6	3205070	3205075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201336
41472	NC_015942	GAC	2	6	3205082	3205087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201336
41473	NC_015942	TCC	2	6	3205152	3205157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201336
41474	NC_015942	TCC	2	6	3205161	3205166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201336
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41476	NC_015942	GAT	2	6	3205283	3205288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201336
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41480	NC_015942	CAA	2	6	3206081	3206086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201336
41481	NC_015942	CCG	2	6	3206149	3206154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201336
41482	NC_015942	TCC	2	6	3206286	3206291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201336
41483	NC_015942	CCA	2	6	3206326	3206331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201336
41484	NC_015942	CCG	2	6	3206539	3206544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201336
41485	NC_015942	GGC	2	6	3206636	3206641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201336

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