MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 41485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015942	GTG	2	6	107965	107970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198330
1502	NC_015942	CCT	2	6	108049	108054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198331
1503	NC_015942	TGG	2	6	108070	108075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198331
1504	NC_015942	TGG	2	6	108087	108092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198331
1505	NC_015942	TGC	2	6	108137	108142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198331
1506	NC_015942	TGT	2	6	108181	108186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198331
1507	NC_015942	AGC	2	6	108204	108209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198331
1508	NC_015942	CAT	2	6	108229	108234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198331
1509	NC_015942	CGC	2	6	108235	108240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198331
1510	NC_015942	GCG	2	6	108258	108263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198331
1511	NC_015942	GCG	2	6	108360	108365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198331
1512	NC_015942	CTC	2	6	108486	108491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198332
1513	NC_015942	GAT	2	6	108500	108505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198332
1514	NC_015942	GTT	2	6	108542	108547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198332
1515	NC_015942	ACG	2	6	108556	108561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198332
1516	NC_015942	CAC	2	6	108564	108569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198332
1517	NC_015942	GCC	2	6	108642	108647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198332
1518	NC_015942	CCA	2	6	108670	108675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198332
1519	NC_015942	CTT	2	6	108788	108793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198332
1520	NC_015942	CGC	2	6	108796	108801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198332
1521	NC_015942	GCG	2	6	108869	108874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198332
1522	NC_015942	TGC	2	6	108926	108931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198332
1523	NC_015942	GAC	3	9	109056	109064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198333
1524	NC_015942	CTG	2	6	109307	109312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198333
1525	NC_015942	TGA	2	6	109416	109421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198334
1526	NC_015942	TGG	2	6	109444	109449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198334
1527	NC_015942	CGG	3	9	109570	109578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198334
1528	NC_015942	TGC	2	6	109626	109631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198334
1529	NC_015942	GTG	2	6	109787	109792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198334
1530	NC_015942	CTT	2	6	109912	109917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198334
1531	NC_015942	GCC	2	6	109958	109963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198334
1532	NC_015942	ATC	2	6	109976	109981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198334
1533	NC_015942	TTG	2	6	110187	110192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198335
1534	NC_015942	GGC	2	6	110197	110202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198335
1535	NC_015942	TTC	2	6	110210	110215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198335
1536	NC_015942	CTT	2	6	110241	110246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198335
1537	NC_015942	CGC	2	6	110247	110252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198335
1538	NC_015942	GCA	2	6	110259	110264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198335
1539	NC_015942	GTG	2	6	110267	110272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198335
1540	NC_015942	GGC	2	6	110284	110289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198335
1541	NC_015942	GCC	2	6	110326	110331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198335
1542	NC_015942	ATT	2	6	110362	110367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198335
1543	NC_015942	GGC	2	6	110392	110397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198335
1544	NC_015942	GGC	2	6	110407	110412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198335
1545	NC_015942	GGC	2	6	110416	110421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198335
1546	NC_015942	GCC	2	6	110591	110596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198335
1547	NC_015942	CAC	2	6	110683	110688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198335
1548	NC_015942	AGG	2	6	110699	110704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198335
1549	NC_015942	ACA	2	6	110715	110720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198335
1550	NC_015942	CTG	2	6	110734	110739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198335
1551	NC_015942	CGA	2	6	110757	110762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198335
1552	NC_015942	TGG	2	6	110865	110870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198335
1553	NC_015942	AGC	2	6	110903	110908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198335
1554	NC_015942	CGC	2	6	111197	111202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198336
1555	NC_015942	GTG	2	6	111288	111293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198336
1556	NC_015942	GCG	2	6	111307	111312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198336
1557	NC_015942	CGG	2	6	111313	111318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198336
1558	NC_015942	GGT	2	6	111345	111350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198336
1559	NC_015942	GCT	2	6	111395	111400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198336
1560	NC_015942	TTG	2	6	111414	111419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198336
1561	NC_015942	GCA	2	6	111452	111457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198336
1562	NC_015942	ATG	2	6	111472	111477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198336
1563	NC_015942	GCG	2	6	111576	111581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198336
1564	NC_015942	CCG	2	6	111622	111627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198336
1565	NC_015942	TTG	2	6	111729	111734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198336
1566	NC_015942	GAT	2	6	111760	111765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198337
1567	NC_015942	GCC	2	6	111877	111882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198337
1568	NC_015942	CTG	2	6	111896	111901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198337
1569	NC_015942	ACC	2	6	112020	112025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198337
1570	NC_015942	GTG	2	6	112539	112544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198338
1571	NC_015942	ACC	2	6	112590	112595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198338
1572	NC_015942	AGA	2	6	112627	112632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198338
1573	NC_015942	CGT	2	6	112790	112795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198338
1574	NC_015942	TCG	2	6	112820	112825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198338
1575	NC_015942	CGT	2	6	112943	112948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198338
1576	NC_015942	CGT	2	6	112984	112989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198338
1577	NC_015942	CGG	2	6	113044	113049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198338
1578	NC_015942	CTT	2	6	113197	113202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198339
1579	NC_015942	GAT	2	6	113280	113285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198339
1580	NC_015942	GGC	2	6	113291	113296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198339
1581	NC_015942	GAT	2	6	113322	113327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198339
1582	NC_015942	CGG	2	6	113453	113458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198339
1583	NC_015942	TGG	2	6	113512	113517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198339
1584	NC_015942	GGC	2	6	113524	113529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198339
1585	NC_015942	GCG	2	6	113580	113585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198339
1586	NC_015942	TGC	2	6	113588	113593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198339
1587	NC_015942	CCA	2	6	113646	113651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198339
1588	NC_015942	CTG	2	6	113755	113760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198339
1589	NC_015942	ATT	2	6	113821	113826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198339
1590	NC_015942	TCT	2	6	113976	113981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198339
1591	NC_015942	GAT	2	6	114093	114098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198339
1592	NC_015942	GCC	2	6	114267	114272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198339
1593	NC_015942	GAT	2	6	114426	114431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198339
1594	NC_015942	GCC	2	6	114439	114444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198339
1595	NC_015942	CGT	2	6	114477	114482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198339
1596	NC_015942	CAC	2	6	114607	114612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198339
1597	NC_015942	GCA	2	6	114638	114643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198339
1598	NC_015942	GCG	2	6	114656	114661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198339
1599	NC_015942	AGC	2	6	114662	114667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198339
1600	NC_015942	GAT	2	6	114691	114696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198339
1601	NC_015942	CTT	2	6	115244	115249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198340
1602	NC_015942	TTA	2	6	115295	115300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198340
1603	NC_015942	ATT	2	6	115303	115308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198341
1604	NC_015942	GTT	2	6	115316	115321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198341
1605	NC_015942	GCG	2	6	115346	115351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198341
1606	NC_015942	CTG	3	9	115415	115423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198341
1607	NC_015942	ATC	2	6	115451	115456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198341
1608	NC_015942	GGC	2	6	115484	115489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198341
1609	NC_015942	GCG	2	6	115534	115539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198341
1610	NC_015942	CGC	2	6	115614	115619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198341
1611	NC_015942	TGG	2	6	115641	115646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198341
1612	NC_015942	GGA	2	6	115660	115665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198341
1613	NC_015942	GAA	2	6	115673	115678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198341
1614	NC_015942	AGC	2	6	115690	115695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198341
1615	NC_015942	AAG	2	6	115775	115780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198341
1616	NC_015942	GGT	2	6	115804	115809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198341
1617	NC_015942	TAT	2	6	115904	115909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198341
1618	NC_015942	TGG	2	6	116001	116006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198341
1619	NC_015942	CAC	2	6	116094	116099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198341
1620	NC_015942	GCC	2	6	116412	116417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198342
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1734	NC_015942	ATG	2	6	125201	125206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198350
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1980	NC_015942	TGC	2	6	141242	141247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198359
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1999	NC_015942	TCA	2	6	142948	142953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198361
2000	NC_015942	TCG	2	6	142999	143004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198361

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