MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 41485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015942	CGC	2	6	348998	349003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198557
5002	NC_015942	GGC	2	6	349028	349033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198557
5003	NC_015942	TGC	2	6	349105	349110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198557
5004	NC_015942	TTG	2	6	349143	349148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198557
5005	NC_015942	CTG	2	6	349221	349226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198557
5006	NC_015942	CAA	2	6	349467	349472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198558
5007	NC_015942	CAG	2	6	349636	349641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198558
5008	NC_015942	TCG	2	6	349871	349876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198558
5009	NC_015942	CGG	2	6	349923	349928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198559
5010	NC_015942	GGC	2	6	349934	349939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198559
5011	NC_015942	CGC	2	6	349953	349958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198559
5012	NC_015942	CTG	2	6	349994	349999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198559
5013	NC_015942	AGC	2	6	350157	350162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198559
5014	NC_015942	TCT	2	6	350188	350193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198559
5015	NC_015942	CGG	2	6	350217	350222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198559
5016	NC_015942	CAG	2	6	350387	350392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198559
5017	NC_015942	CGG	2	6	350433	350438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198559
5018	NC_015942	TCA	2	6	350547	350552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198559
5019	NC_015942	GTC	2	6	350562	350567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198559
5020	NC_015942	TCG	2	6	350690	350695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198559
5021	NC_015942	ATG	2	6	350742	350747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198559
5022	NC_015942	GTT	2	6	350794	350799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198559
5023	NC_015942	GAT	2	6	350804	350809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198559
5024	NC_015942	AGC	2	6	351186	351191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198559
5025	NC_015942	CTT	2	6	351223	351228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198559
5026	NC_015942	TTG	2	6	351362	351367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198560
5027	NC_015942	GCT	2	6	351382	351387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198560
5028	NC_015942	ATA	2	6	351395	351400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198560
5029	NC_015942	GGC	2	6	351441	351446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198560
5030	NC_015942	ATG	2	6	351470	351475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198560
5031	NC_015942	AGG	2	6	351611	351616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198560
5032	NC_015942	AAC	2	6	351659	351664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198560
5033	NC_015942	GCT	2	6	351669	351674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198560
5034	NC_015942	TTA	2	6	351716	351721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198560
5035	NC_015942	TGA	2	6	351821	351826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198560
5036	NC_015942	CAG	2	6	351871	351876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198560
5037	NC_015942	CAC	2	6	351979	351984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198560
5038	NC_015942	TGT	2	6	352004	352009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198560
5039	NC_015942	GTG	2	6	352084	352089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198560
5040	NC_015942	GGC	2	6	352173	352178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198560
5041	NC_015942	CGG	2	6	352304	352309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198560
5042	NC_015942	GGC	2	6	352365	352370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198560
5043	NC_015942	GTA	2	6	352480	352485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198561
5044	NC_015942	AGC	2	6	352543	352548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198561
5045	NC_015942	CAC	2	6	352577	352582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198561
5046	NC_015942	GCA	2	6	352642	352647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198561
5047	NC_015942	GCG	2	6	352681	352686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198561
5048	NC_015942	CTG	2	6	352746	352751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198561
5049	NC_015942	CAT	2	6	352764	352769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198561
5050	NC_015942	GAG	2	6	352806	352811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198561
5051	NC_015942	GCA	2	6	352815	352820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198561
5052	NC_015942	GGT	2	6	352871	352876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198561
5053	NC_015942	CAC	2	6	353051	353056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198561
5054	NC_015942	TGG	2	6	353122	353127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198561
5055	NC_015942	GCC	2	6	353202	353207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198561
5056	NC_015942	GAA	2	6	353235	353240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198561
5057	NC_015942	GCA	2	6	353282	353287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198561
5058	NC_015942	GTG	2	6	353310	353315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198561
5059	NC_015942	CTG	2	6	353436	353441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198561
5060	NC_015942	CGG	2	6	353459	353464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198561
5061	NC_015942	GCC	2	6	353529	353534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198561
5062	NC_015942	CAG	2	6	353561	353566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198561
5063	NC_015942	TTC	2	6	353698	353703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198561
5064	NC_015942	TTA	2	6	353965	353970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198562
5065	NC_015942	CTG	2	6	353992	353997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198562
5066	NC_015942	TGC	2	6	354121	354126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198562
5067	NC_015942	CCA	2	6	354253	354258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198562
5068	NC_015942	ATC	2	6	354316	354321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198562
5069	NC_015942	CGG	2	6	354325	354330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198562
5070	NC_015942	CGC	2	6	354610	354615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198563
5071	NC_015942	CGC	2	6	354639	354644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198563
5072	NC_015942	CTT	2	6	354723	354728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198563
5073	NC_015942	GTC	2	6	354809	354814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198563
5074	NC_015942	CGT	2	6	354847	354852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198563
5075	NC_015942	CTG	2	6	354934	354939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198563
5076	NC_015942	ATT	2	6	354951	354956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198563
5077	NC_015942	GCG	2	6	355132	355137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198563
5078	NC_015942	GCC	2	6	355210	355215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198563
5079	NC_015942	TCG	2	6	355271	355276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198563
5080	NC_015942	ATG	2	6	355316	355321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198563
5081	NC_015942	ATG	2	6	355331	355336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198563
5082	NC_015942	ACG	2	6	355658	355663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198563
5083	NC_015942	GGC	2	6	355704	355709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198563
5084	NC_015942	GAC	2	6	355804	355809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198563
5085	NC_015942	GAT	2	6	355881	355886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198563
5086	NC_015942	GGC	2	6	355887	355892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198563
5087	NC_015942	ACT	2	6	356028	356033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198564
5088	NC_015942	CAC	2	6	356132	356137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198564
5089	NC_015942	GCC	2	6	356145	356150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198564
5090	NC_015942	TTC	2	6	356152	356157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198564
5091	NC_015942	CTT	2	6	356398	356403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198564
5092	NC_015942	AGC	2	6	356416	356421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198564
5093	NC_015942	GTA	2	6	356462	356467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198564
5094	NC_015942	CAC	2	6	356931	356936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198565
5095	NC_015942	ACC	2	6	356989	356994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198565
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5097	NC_015942	CGC	2	6	357027	357032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198565
5098	NC_015942	CTG	2	6	357125	357130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198565
5099	NC_015942	TGA	2	6	357171	357176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198565
5100	NC_015942	AAG	2	6	357205	357210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198565
5101	NC_015942	GAT	2	6	357213	357218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198565
5102	NC_015942	TTG	2	6	357422	357427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198566
5103	NC_015942	ATG	2	6	357587	357592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198566
5104	NC_015942	CCA	2	6	357745	357750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198566
5105	NC_015942	CGG	2	6	358037	358042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198566
5106	NC_015942	CCA	2	6	358078	358083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198566
5107	NC_015942	GCC	2	6	358129	358134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198566
5108	NC_015942	TCA	2	6	358147	358152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198566
5109	NC_015942	ATG	2	6	358239	358244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198566
5110	NC_015942	TGA	2	6	358267	358272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198566
5111	NC_015942	CAG	2	6	358289	358294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198566
5112	NC_015942	CGC	2	6	358366	358371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198566
5113	NC_015942	TTG	2	6	358440	358445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198566
5114	NC_015942	TCC	2	6	358547	358552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198566
5115	NC_015942	GCG	2	6	358604	358609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198566
5116	NC_015942	CAG	2	6	358610	358615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198566
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5118	NC_015942	TGG	2	6	358768	358773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198566
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5237	NC_015942	GTC	2	6	369679	369684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198581
5238	NC_015942	GAT	2	6	370108	370113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198582
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5473	NC_015942	GCA	2	6	388768	388773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198595
5474	NC_015942	CCG	2	6	388774	388779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198595
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5499	NC_015942	AGC	2	6	389965	389970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198595
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