MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 41677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013205	TGA	2	6	113	118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510021
2	NC_013205	ACG	2	6	140	145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510021
3	NC_013205	TCC	2	6	161	166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510021
4	NC_013205	TCG	2	6	317	322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510021
5	NC_013205	TGA	3	9	329	337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510021
6	NC_013205	GAC	2	6	379	384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510021
7	NC_013205	CCG	2	6	395	400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510021
8	NC_013205	GAA	2	6	436	441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510021
9	NC_013205	CGC	2	6	516	521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510021
10	NC_013205	GGC	2	6	577	582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510021
11	NC_013205	TCC	2	6	667	672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510021
12	NC_013205	GAC	2	6	766	771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510021
13	NC_013205	AGG	2	6	803	808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510021
14	NC_013205	TTC	2	6	811	816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510021
15	NC_013205	TCA	2	6	932	937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510021
16	NC_013205	GTG	2	6	1210	1215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510021
17	NC_013205	CGA	2	6	1239	1244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510021
18	NC_013205	AAG	2	6	1255	1260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510021
19	NC_013205	CGG	2	6	1353	1358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510021
20	NC_013205	ACG	2	6	1369	1374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510021
21	NC_013205	ATG	2	6	1408	1413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510021
22	NC_013205	GAC	2	6	1417	1422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510021
23	NC_013205	TCG	2	6	1828	1833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510022
24	NC_013205	GAA	2	6	1884	1889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510022
25	NC_013205	GAG	2	6	2058	2063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510022
26	NC_013205	GGC	2	6	2125	2130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510022
27	NC_013205	CGC	2	6	2150	2155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510022
28	NC_013205	GCA	2	6	2252	2257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510022
29	NC_013205	GGT	2	6	2291	2296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510022
30	NC_013205	GGT	2	6	2480	2485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510022
31	NC_013205	TTC	2	6	2503	2508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510022
32	NC_013205	CGC	2	6	2522	2527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510022
33	NC_013205	AGG	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510022
34	NC_013205	CGC	2	6	2717	2722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510022
35	NC_013205	GCG	2	6	2776	2781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510022
36	NC_013205	TGC	2	6	2791	2796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510022
37	NC_013205	ATG	2	6	2825	2830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510022
38	NC_013205	CGA	2	6	2989	2994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510023
39	NC_013205	GTG	2	6	3023	3028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510023
40	NC_013205	CCG	2	6	3047	3052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510023
41	NC_013205	TCG	2	6	3121	3126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510024
42	NC_013205	TGC	2	6	3166	3171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510024
43	NC_013205	GGA	2	6	3392	3397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510024
44	NC_013205	CCA	2	6	3479	3484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510024
45	NC_013205	GAC	3	9	3552	3560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510024
46	NC_013205	CGC	2	6	3650	3655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510024
47	NC_013205	GGA	2	6	3746	3751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510024
48	NC_013205	ACG	2	6	3813	3818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510024
49	NC_013205	GAC	2	6	3837	3842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510024
50	NC_013205	GCC	2	6	3879	3884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510024
51	NC_013205	CAG	2	6	3894	3899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510024
52	NC_013205	GAG	2	6	3948	3953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510024
53	NC_013205	TGC	3	9	3970	3978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510024
54	NC_013205	CGA	2	6	3980	3985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510024
55	NC_013205	CGA	2	6	4001	4006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510024
56	NC_013205	TCA	2	6	4057	4062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510024
57	NC_013205	GAA	2	6	4140	4145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510024
58	NC_013205	CTT	2	6	4228	4233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510025
59	NC_013205	CGA	2	6	4333	4338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510025
60	NC_013205	CAC	2	6	4353	4358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510025
61	NC_013205	GTG	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510025
62	NC_013205	ACA	2	6	4441	4446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510025
63	NC_013205	GGC	2	6	4545	4550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510025
64	NC_013205	CGG	2	6	4556	4561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510025
65	NC_013205	GGC	2	6	4581	4586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510025
66	NC_013205	GTG	2	6	4608	4613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510025
67	NC_013205	CGC	2	6	4690	4695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510025
68	NC_013205	ACG	2	6	4719	4724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510025
69	NC_013205	GAC	2	6	4778	4783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510025
70	NC_013205	CGG	2	6	4792	4797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510025
71	NC_013205	ACG	2	6	4900	4905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510025
72	NC_013205	GAC	2	6	4989	4994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510025
73	NC_013205	ACG	2	6	5023	5028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510025
74	NC_013205	GCA	2	6	5034	5039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510025
75	NC_013205	AAC	2	6	5058	5063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510025
76	NC_013205	CGG	2	6	5071	5076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510025
77	NC_013205	ACA	2	6	5167	5172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510025
78	NC_013205	CGA	2	6	5183	5188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510025
79	NC_013205	CCG	2	6	5206	5211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510025
80	NC_013205	TCG	2	6	5290	5295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510025
81	NC_013205	GAG	2	6	5331	5336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510025
82	NC_013205	GCG	2	6	5379	5384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510025
83	NC_013205	GGC	2	6	5396	5401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510025
84	NC_013205	GCA	2	6	5425	5430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510025
85	NC_013205	AGA	2	6	5431	5436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510025
86	NC_013205	TCG	2	6	5509	5514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510025
87	NC_013205	ATC	2	6	5592	5597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510025
88	NC_013205	GAG	2	6	5637	5642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510025
89	NC_013205	CAT	2	6	5651	5656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510025
90	NC_013205	CGA	2	6	5681	5686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510025
91	NC_013205	TCA	2	6	5722	5727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510025
92	NC_013205	ACG	2	6	5743	5748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510025
93	NC_013205	GCC	2	6	5834	5839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510025
94	NC_013205	GTG	2	6	5865	5870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510025
95	NC_013205	GAC	2	6	5987	5992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510025
96	NC_013205	GCT	2	6	6014	6019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510025
97	NC_013205	GGA	2	6	6032	6037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510025
98	NC_013205	CGG	2	6	6093	6098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510025
99	NC_013205	AGC	2	6	6214	6219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510026
100	NC_013205	TCG	2	6	6293	6298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510026
101	NC_013205	AAG	2	6	6397	6402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510026
102	NC_013205	TCG	2	6	6403	6408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510026
103	NC_013205	TCG	2	6	6413	6418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510026
104	NC_013205	CGC	2	6	6453	6458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510026
105	NC_013205	CAA	2	6	6621	6626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510026
106	NC_013205	ACG	2	6	6653	6658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510026
107	NC_013205	GAA	2	6	6664	6669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510026
108	NC_013205	CGT	2	6	6675	6680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510026
109	NC_013205	CGA	2	6	6743	6748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510026
110	NC_013205	CGC	2	6	6755	6760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510026
111	NC_013205	CGT	2	6	6786	6791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510026
112	NC_013205	CGA	2	6	6822	6827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510026
113	NC_013205	TGA	2	6	6830	6835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510026
114	NC_013205	TCA	2	6	6839	6844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510026
115	NC_013205	GCG	2	6	6866	6871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510026
116	NC_013205	GAG	2	6	6952	6957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510026
117	NC_013205	CGG	2	6	6963	6968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510026
118	NC_013205	GTG	2	6	6982	6987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510026
119	NC_013205	CAG	2	6	7003	7008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510026
120	NC_013205	AGA	3	9	7052	7060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510026
121	NC_013205	CGA	2	6	7083	7088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510026
122	NC_013205	CGT	2	6	7110	7115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510026
123	NC_013205	GGT	2	6	7146	7151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510026
124	NC_013205	AAC	2	6	7156	7161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510026
125	NC_013205	TCA	2	6	7199	7204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510026
126	NC_013205	ATC	2	6	7271	7276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510026
127	NC_013205	CGT	2	6	7284	7289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510026
128	NC_013205	CGC	2	6	7291	7296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510026
129	NC_013205	CGA	2	6	7413	7418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510026
130	NC_013205	GGA	2	6	7455	7460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510026
131	NC_013205	GCA	2	6	7545	7550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510026
132	NC_013205	CGA	2	6	7644	7649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510026
133	NC_013205	GCG	2	6	7650	7655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510026
134	NC_013205	ACG	2	6	7712	7717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510026
135	NC_013205	CGG	2	6	7788	7793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510026
136	NC_013205	TCA	2	6	7808	7813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510026
137	NC_013205	ACT	2	6	7865	7870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510026
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139	NC_013205	ACG	2	6	7916	7921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510026
140	NC_013205	GAT	2	6	8001	8006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510026
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142	NC_013205	CGC	2	6	8087	8092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510026
143	NC_013205	CGA	4	12	8145	8156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510026
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145	NC_013205	ATG	2	6	8197	8202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510026
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149	NC_013205	TCG	2	6	8348	8353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510026
150	NC_013205	GAA	2	6	8448	8453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510026
151	NC_013205	GAC	3	9	8488	8496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510026
152	NC_013205	TGA	2	6	8498	8503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510026
153	NC_013205	TCA	2	6	8585	8590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510026
154	NC_013205	CGA	2	6	8595	8600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510026
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158	NC_013205	ACG	2	6	8989	8994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510028
159	NC_013205	TGC	2	6	9049	9054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510028
160	NC_013205	TGC	2	6	9118	9123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510028
161	NC_013205	CCG	2	6	9237	9242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510028
162	NC_013205	CGG	2	6	9268	9273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510028
163	NC_013205	ACG	2	6	9354	9359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510028
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165	NC_013205	GGC	2	6	9434	9439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510028
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243	NC_013205	GAG	2	6	19898	19903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510034
244	NC_013205	CGA	2	6	19939	19944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510034
245	NC_013205	CTA	2	6	19969	19974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510034
246	NC_013205	ACT	2	6	20007	20012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510034
247	NC_013205	CGG	2	6	20094	20099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510034
248	NC_013205	AGC	2	6	20193	20198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510034
249	NC_013205	CCG	2	6	20245	20250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510034
250	NC_013205	GAA	2	6	20290	20295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510034
251	NC_013205	TCG	2	6	20345	20350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510034
252	NC_013205	CGG	2	6	20399	20404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510034
253	NC_013205	GAG	2	6	20405	20410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510034
254	NC_013205	GGC	2	6	20473	20478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510034
255	NC_013205	AGG	2	6	20499	20504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510034
256	NC_013205	GAC	2	6	20630	20635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510035
257	NC_013205	GAT	2	6	20644	20649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510035
258	NC_013205	AGG	2	6	20850	20855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510035
259	NC_013205	TGC	2	6	20886	20891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510035
260	NC_013205	GCG	2	6	21125	21130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510036
261	NC_013205	TGC	2	6	21271	21276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510036
262	NC_013205	CCG	2	6	21286	21291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510036
263	NC_013205	GCG	2	6	21350	21355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510036
264	NC_013205	CGG	2	6	21457	21462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510036
265	NC_013205	GAG	3	9	21606	21614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510036
266	NC_013205	CAG	2	6	21642	21647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510036
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268	NC_013205	CCG	2	6	21839	21844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510036
269	NC_013205	TCG	2	6	21859	21864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510036
270	NC_013205	GCG	2	6	21865	21870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510036
271	NC_013205	GAC	2	6	21884	21889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510036
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273	NC_013205	TCA	2	6	21952	21957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510036
274	NC_013205	ACG	2	6	22056	22061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510036
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278	NC_013205	GAT	2	6	22118	22123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510036
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281	NC_013205	CCT	2	6	22175	22180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510036
282	NC_013205	TGG	2	6	22207	22212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510036
283	NC_013205	CGA	2	6	22265	22270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510036
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285	NC_013205	TCA	2	6	22336	22341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510036
286	NC_013205	GCC	2	6	22395	22400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510036
287	NC_013205	GGC	2	6	22508	22513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510036
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289	NC_013205	GCG	2	6	22605	22610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510036
290	NC_013205	AGC	2	6	22810	22815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510036
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292	NC_013205	TAT	2	6	23597	23602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510037
293	NC_013205	CAA	2	6	23838	23843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510037
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370	NC_013205	CCA	2	6	31814	31819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510042
371	NC_013205	CGC	2	6	31871	31876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510042
372	NC_013205	GAT	2	6	32060	32065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510043
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374	NC_013205	GCC	2	6	32189	32194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510043
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376	NC_013205	CGA	2	6	32234	32239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510043
377	NC_013205	CGG	2	6	32296	32301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510043
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500	NC_013205	CCA	2	6	43247	43252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510050

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