MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 41677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013205	CGA	2	6	43275	43280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510050
502	NC_013205	AGC	2	6	43291	43296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510050
503	NC_013205	TGA	2	6	43297	43302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510050
504	NC_013205	CGC	2	6	43404	43409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510050
505	NC_013205	CGT	2	6	43449	43454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510050
506	NC_013205	CAG	2	6	43461	43466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510050
507	NC_013205	CGA	2	6	43475	43480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510050
508	NC_013205	GCG	2	6	43577	43582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510050
509	NC_013205	TCA	3	9	43658	43666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510050
510	NC_013205	TGG	2	6	43667	43672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510050
511	NC_013205	TGA	2	6	43673	43678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510050
512	NC_013205	CGA	2	6	43754	43759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510050
513	NC_013205	AGA	2	6	43763	43768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510050
514	NC_013205	CCG	3	9	43817	43825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510050
515	NC_013205	GAT	3	9	43902	43910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510050
516	NC_013205	GCC	2	6	44011	44016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510050
517	NC_013205	CCA	2	6	44042	44047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510050
518	NC_013205	TCA	2	6	44119	44124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510051
519	NC_013205	GCT	2	6	44134	44139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510051
520	NC_013205	CAC	2	6	44162	44167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510051
521	NC_013205	CGA	2	6	44170	44175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510051
522	NC_013205	AGC	2	6	44244	44249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510051
523	NC_013205	GCC	2	6	44396	44401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510051
524	NC_013205	CGG	2	6	44516	44521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510051
525	NC_013205	ATG	2	6	44541	44546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510051
526	NC_013205	CGC	2	6	44761	44766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510051
527	NC_013205	CCG	2	6	44809	44814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510051
528	NC_013205	GGC	2	6	44865	44870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510051
529	NC_013205	GCG	2	6	44923	44928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510051
530	NC_013205	TGA	2	6	45022	45027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510051
531	NC_013205	GAT	2	6	45062	45067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510051
532	NC_013205	AAC	2	6	45072	45077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510051
533	NC_013205	GAG	2	6	45098	45103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510051
534	NC_013205	GCT	2	6	45169	45174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510051
535	NC_013205	CGG	2	6	45267	45272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510051
536	NC_013205	TCG	2	6	45294	45299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510051
537	NC_013205	GAC	2	6	45305	45310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510051
538	NC_013205	TCA	2	6	45466	45471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510051
539	NC_013205	GCG	2	6	45784	45789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510052
540	NC_013205	GTT	2	6	45803	45808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510052
541	NC_013205	CGC	2	6	45829	45834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510052
542	NC_013205	TGA	2	6	45907	45912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510052
543	NC_013205	GCC	2	6	46004	46009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510052
544	NC_013205	GAT	2	6	46022	46027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510052
545	NC_013205	CGC	2	6	46070	46075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510052
546	NC_013205	CTG	2	6	46142	46147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510052
547	NC_013205	CGG	2	6	46172	46177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510052
548	NC_013205	TTC	2	6	46224	46229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510052
549	NC_013205	AGA	2	6	46230	46235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510052
550	NC_013205	CTG	2	6	46283	46288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510052
551	NC_013205	TCG	2	6	46335	46340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510052
552	NC_013205	ATG	2	6	46341	46346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510052
553	NC_013205	TTG	2	6	46379	46384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510052
554	NC_013205	GAC	2	6	46487	46492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510052
555	NC_013205	CCT	2	6	46525	46530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510052
556	NC_013205	GGT	2	6	46549	46554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510052
557	NC_013205	TGT	2	6	46561	46566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510052
558	NC_013205	GCC	2	6	46574	46579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510052
559	NC_013205	TCG	2	6	46618	46623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510052
560	NC_013205	GGT	2	6	46625	46630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510052
561	NC_013205	TGC	2	6	46639	46644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510052
562	NC_013205	GTT	2	6	46646	46651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510052
563	NC_013205	CGA	2	6	46670	46675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510052
564	NC_013205	GTT	2	6	46676	46681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510052
565	NC_013205	ACG	2	6	46695	46700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510052
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568	NC_013205	GGT	2	6	47356	47361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510053
569	NC_013205	GCA	2	6	47391	47396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510053
570	NC_013205	GTG	2	6	47465	47470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510053
571	NC_013205	GGC	2	6	47488	47493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510053
572	NC_013205	GAG	2	6	47609	47614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510053
573	NC_013205	CGA	2	6	47722	47727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510054
574	NC_013205	GGC	2	6	48029	48034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510054
575	NC_013205	GGT	2	6	48040	48045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510054
576	NC_013205	GAA	2	6	48139	48144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510054
577	NC_013205	GGC	2	6	48172	48177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510054
578	NC_013205	GCT	2	6	48274	48279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510054
579	NC_013205	AGT	2	6	48282	48287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510054
580	NC_013205	GAC	2	6	48445	48450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510055
581	NC_013205	CGC	2	6	48477	48482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510055
582	NC_013205	AGA	2	6	48501	48506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510055
583	NC_013205	CAC	2	6	48550	48555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510055
584	NC_013205	CCT	2	6	48642	48647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510055
585	NC_013205	CTC	2	6	48667	48672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510055
586	NC_013205	TCG	2	6	48876	48881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510056
587	NC_013205	GAT	2	6	48992	48997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510056
588	NC_013205	CTG	2	6	49135	49140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510056
589	NC_013205	CGA	2	6	49158	49163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510056
590	NC_013205	GAC	2	6	49688	49693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510057
591	NC_013205	AGG	2	6	49733	49738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510057
592	NC_013205	GCG	2	6	49928	49933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510058
593	NC_013205	GCC	2	6	49955	49960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510058
594	NC_013205	CAC	2	6	50013	50018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510058
595	NC_013205	TCG	3	9	50038	50046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510058
596	NC_013205	CAC	2	6	50059	50064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510058
597	NC_013205	TCA	2	6	50072	50077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510058
598	NC_013205	CAC	2	6	50187	50192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510058
599	NC_013205	CAT	2	6	50295	50300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510058
600	NC_013205	TGG	2	6	50341	50346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510058
601	NC_013205	GCC	2	6	50362	50367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510058
602	NC_013205	TCG	2	6	50443	50448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510058
603	NC_013205	CCG	2	6	50509	50514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510058
604	NC_013205	CCA	3	9	50639	50647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510058
605	NC_013205	CGG	2	6	50703	50708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510058
606	NC_013205	CCA	2	6	50729	50734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510058
607	NC_013205	CGA	2	6	50825	50830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510058
608	NC_013205	CGA	2	6	50834	50839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510058
609	NC_013205	CTG	2	6	50883	50888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510058
610	NC_013205	CCT	2	6	50956	50961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510059
611	NC_013205	CGC	2	6	51012	51017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510059
612	NC_013205	CGC	2	6	51103	51108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510059
613	NC_013205	CGC	2	6	51251	51256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510059
614	NC_013205	CGC	2	6	51293	51298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510059
615	NC_013205	CCA	2	6	51389	51394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510059
616	NC_013205	CCA	2	6	51421	51426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510059
617	NC_013205	GCC	2	6	51486	51491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510059
618	NC_013205	CGG	3	9	51550	51558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510059
619	NC_013205	GCG	2	6	51610	51615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510059
620	NC_013205	GCG	2	6	51693	51698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510059
621	NC_013205	TCG	3	9	51712	51720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510059
622	NC_013205	GCG	2	6	51738	51743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510059
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624	NC_013205	GGC	2	6	51893	51898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510059
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997	NC_013205	CGG	2	6	77376	77381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510079
998	NC_013205	CGA	2	6	77390	77395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510079
999	NC_013205	CAG	2	6	77437	77442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510079
1000	NC_013205	GTT	2	6	77544	77549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510079

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