MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 41677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013205	CGC	2	6	430176	430181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510390
6002	NC_013205	CGC	3	9	430270	430278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510390
6003	NC_013205	GGA	2	6	430290	430295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510390
6004	NC_013205	CGC	2	6	430306	430311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510390
6005	NC_013205	GGC	2	6	430342	430347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510390
6006	NC_013205	GCG	2	6	430352	430357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510390
6007	NC_013205	GGA	2	6	430453	430458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510390
6008	NC_013205	GAG	2	6	430612	430617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510391
6009	NC_013205	GAC	2	6	430693	430698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510391
6010	NC_013205	TTC	2	6	430772	430777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510391
6011	NC_013205	CGA	2	6	430839	430844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510391
6012	NC_013205	CGC	2	6	430899	430904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510391
6013	NC_013205	GGA	2	6	431064	431069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510391
6014	NC_013205	TGC	2	6	431084	431089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510391
6015	NC_013205	TCG	2	6	431135	431140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510391
6016	NC_013205	CGA	2	6	431142	431147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510391
6017	NC_013205	TCG	2	6	431171	431176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510391
6018	NC_013205	CGA	2	6	431235	431240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510391
6019	NC_013205	GTG	2	6	431278	431283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510391
6020	NC_013205	TGC	2	6	431300	431305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510391
6021	NC_013205	CGT	2	6	431387	431392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510391
6022	NC_013205	TGC	2	6	431402	431407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510391
6023	NC_013205	TCA	2	6	431499	431504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510392
6024	NC_013205	GCG	3	9	431567	431575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510392
6025	NC_013205	ACG	2	6	431604	431609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510392
6026	NC_013205	CGA	2	6	431629	431634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510392
6027	NC_013205	GCC	2	6	431672	431677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510392
6028	NC_013205	CGA	2	6	431688	431693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510392
6029	NC_013205	TCT	2	6	431716	431721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510392
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6031	NC_013205	CGT	2	6	431788	431793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510392
6032	NC_013205	GGT	2	6	431836	431841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510392
6033	NC_013205	CTC	2	6	431867	431872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510392
6034	NC_013205	CGG	2	6	431895	431900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510392
6035	NC_013205	TCA	2	6	431953	431958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510392
6036	NC_013205	GTG	2	6	431977	431982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510392
6037	NC_013205	CGC	2	6	432010	432015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510392
6038	NC_013205	GTG	2	6	432220	432225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510393
6039	NC_013205	AGG	2	6	432299	432304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510393
6040	NC_013205	AAC	2	6	432424	432429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510393
6041	NC_013205	GAG	2	6	432430	432435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510393
6042	NC_013205	GAA	2	6	432574	432579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510394
6043	NC_013205	GAT	2	6	432591	432596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510394
6044	NC_013205	GTG	2	6	432658	432663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510394
6045	NC_013205	GAA	2	6	432669	432674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510394
6046	NC_013205	TCA	2	6	432689	432694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510394
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6048	NC_013205	CGA	2	6	432779	432784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510394
6049	NC_013205	ACG	2	6	432791	432796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510394
6050	NC_013205	ACG	3	9	432811	432819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510394
6051	NC_013205	GAT	2	6	432840	432845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510394
6052	NC_013205	GAA	2	6	432858	432863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510394
6053	NC_013205	CGC	2	6	432867	432872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510394
6054	NC_013205	CCG	2	6	432894	432899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510394
6055	NC_013205	GAG	2	6	432931	432936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510394
6056	NC_013205	GAA	2	6	432939	432944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510394
6057	NC_013205	GCC	2	6	432988	432993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510394
6058	NC_013205	ACG	2	6	433055	433060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510394
6059	NC_013205	GTC	2	6	433108	433113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510394
6060	NC_013205	AAG	2	6	433216	433221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510394
6061	NC_013205	CGT	2	6	433260	433265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510394
6062	NC_013205	GCT	2	6	433281	433286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510394
6063	NC_013205	CAA	2	6	433335	433340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510394
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6065	NC_013205	GAG	2	6	433450	433455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510394
6066	NC_013205	ACG	2	6	433477	433482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510394
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6071	NC_013205	GAG	2	6	433765	433770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510394
6072	NC_013205	CGA	2	6	433842	433847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510394
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6089	NC_013205	GCG	3	9	434824	434832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510395
6090	NC_013205	CGC	2	6	434833	434838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510395
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6099	NC_013205	AAC	2	6	435291	435296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510395
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6102	NC_013205	AAG	2	6	435471	435476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510395
6103	NC_013205	CGC	2	6	435780	435785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510396
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6106	NC_013205	GAG	2	6	435946	435951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510396
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6113	NC_013205	TCG	2	6	436520	436525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510397
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6237	NC_013205	CGT	2	6	445305	445310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510404
6238	NC_013205	GGT	2	6	445334	445339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510404
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