MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 41677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013205	CGA	2	6	399622	399627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510357
5502	NC_013205	CGT	2	6	399629	399634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510357
5503	NC_013205	ATG	2	6	399672	399677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510357
5504	NC_013205	AGA	2	6	399688	399693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510357
5505	NC_013205	TCG	2	6	399768	399773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510357
5506	NC_013205	AGT	2	6	399796	399801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510357
5507	NC_013205	CCA	2	6	399814	399819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510357
5508	NC_013205	CAC	2	6	399971	399976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510357
5509	NC_013205	CAT	2	6	400010	400015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510357
5510	NC_013205	GCC	2	6	400116	400121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510357
5511	NC_013205	CGA	2	6	400259	400264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510357
5512	NC_013205	TCG	2	6	400323	400328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510357
5513	NC_013205	GGA	2	6	400418	400423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510357
5514	NC_013205	GCC	2	6	400440	400445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510357
5515	NC_013205	GCC	2	6	400478	400483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510357
5516	NC_013205	GAA	2	6	400512	400517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510357
5517	NC_013205	GCC	2	6	400587	400592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510357
5518	NC_013205	GCC	2	6	400686	400691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510357
5519	NC_013205	CTG	2	6	400700	400705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510357
5520	NC_013205	CTG	2	6	400742	400747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510357
5521	NC_013205	CCG	2	6	400768	400773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510357
5522	NC_013205	GCT	2	6	400810	400815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510357
5523	NC_013205	GCC	2	6	400818	400823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510357
5524	NC_013205	AGC	2	6	400835	400840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510357
5525	NC_013205	GCC	2	6	400929	400934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510357
5526	NC_013205	CGC	2	6	401111	401116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510357
5527	NC_013205	CGC	2	6	401120	401125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510357
5528	NC_013205	CTG	2	6	401126	401131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510357
5529	NC_013205	CTG	2	6	401273	401278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510357
5530	NC_013205	ACG	2	6	401367	401372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510357
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5532	NC_013205	CCA	2	6	401531	401536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510357
5533	NC_013205	CAT	2	6	401642	401647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510357
5534	NC_013205	GGA	2	6	401656	401661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510357
5535	NC_013205	ACG	2	6	401784	401789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510357
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5537	NC_013205	GAT	2	6	401876	401881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510357
5538	NC_013205	GAT	2	6	401906	401911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510357
5539	NC_013205	TCG	2	6	401980	401985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510357
5540	NC_013205	AGA	2	6	401988	401993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510357
5541	NC_013205	ACG	2	6	402033	402038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510357
5542	NC_013205	GAC	2	6	402047	402052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510357
5543	NC_013205	TGA	2	6	402195	402200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510357
5544	NC_013205	ACG	2	6	402211	402216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510357
5545	NC_013205	CGT	2	6	402235	402240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510357
5546	NC_013205	GGC	2	6	402323	402328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510357
5547	NC_013205	CCG	3	9	402403	402411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510357
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5549	NC_013205	ACG	2	6	402501	402506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510357
5550	NC_013205	CGA	2	6	402509	402514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510357
5551	NC_013205	GCA	2	6	402565	402570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510357
5552	NC_013205	GAT	2	6	402608	402613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510357
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5554	NC_013205	CGT	2	6	402955	402960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510358
5555	NC_013205	CGA	2	6	403008	403013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510358
5556	NC_013205	CGC	2	6	403035	403040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510358
5557	NC_013205	CGC	2	6	403108	403113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510358
5558	NC_013205	TGG	2	6	403119	403124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510358
5559	NC_013205	CGA	2	6	403152	403157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510358
5560	NC_013205	TGG	2	6	403233	403238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510358
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5562	NC_013205	CGT	2	6	403258	403263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510358
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5601	NC_013205	TGT	2	6	405988	405993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510360
5602	NC_013205	CGG	2	6	406085	406090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510360
5603	NC_013205	ACA	2	6	406144	406149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510360
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5608	NC_013205	GGA	2	6	406280	406285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510360
5609	NC_013205	CGT	2	6	406286	406291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510360
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5612	NC_013205	CAT	2	6	406538	406543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510360
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5615	NC_013205	CGA	2	6	406669	406674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510360
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