MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 41677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013205	CCG	2	6	281706	281711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510273
4002	NC_013205	CGC	2	6	281717	281722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510273
4003	NC_013205	CGG	2	6	281921	281926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510273
4004	NC_013205	CGC	2	6	281967	281972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510273
4005	NC_013205	GAG	2	6	282132	282137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510274
4006	NC_013205	ACG	2	6	282334	282339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510274
4007	NC_013205	ACG	2	6	282389	282394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510274
4008	NC_013205	GCG	2	6	282469	282474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510274
4009	NC_013205	CGG	2	6	282534	282539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510274
4010	NC_013205	CGC	2	6	282582	282587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510274
4011	NC_013205	GAG	2	6	282603	282608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510274
4012	NC_013205	GCG	2	6	282692	282697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510274
4013	NC_013205	CAT	2	6	282735	282740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510274
4014	NC_013205	GCC	2	6	282748	282753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510274
4015	NC_013205	CAG	2	6	282813	282818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510274
4016	NC_013205	TCA	2	6	282839	282844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510274
4017	NC_013205	TTC	2	6	282867	282872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510274
4018	NC_013205	CGC	2	6	282924	282929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510274
4019	NC_013205	GCA	2	6	282942	282947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510274
4020	NC_013205	CCA	2	6	282957	282962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510274
4021	NC_013205	GAG	2	6	282987	282992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510274
4022	NC_013205	CAC	2	6	283005	283010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510274
4023	NC_013205	TCG	2	6	283032	283037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510274
4024	NC_013205	CGC	2	6	283104	283109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510274
4025	NC_013205	GTA	2	6	283173	283178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510274
4026	NC_013205	GTC	2	6	283444	283449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510275
4027	NC_013205	GTC	2	6	283546	283551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510275
4028	NC_013205	CGC	2	6	283652	283657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510275
4029	NC_013205	TGG	2	6	283760	283765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510275
4030	NC_013205	TGA	2	6	283904	283909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510275
4031	NC_013205	TCG	2	6	283985	283990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510275
4032	NC_013205	AAG	2	6	284015	284020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510275
4033	NC_013205	TCC	2	6	284024	284029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510275
4034	NC_013205	TCG	2	6	284123	284128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510275
4035	NC_013205	GGC	2	6	284158	284163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510275
4036	NC_013205	CCG	2	6	284164	284169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510275
4037	NC_013205	AGA	2	6	284237	284242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510275
4038	NC_013205	CAG	2	6	284347	284352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510275
4039	NC_013205	CAA	2	6	284550	284555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510275
4040	NC_013205	GAA	2	6	284568	284573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510275
4041	NC_013205	AAG	2	6	284946	284951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510276
4042	NC_013205	GAA	2	6	284957	284962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510276
4043	NC_013205	GGC	4	12	284978	284989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510276
4044	NC_013205	CGT	2	6	284990	284995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510276
4045	NC_013205	GCG	2	6	285060	285065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510276
4046	NC_013205	CGC	2	6	285127	285132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510276
4047	NC_013205	GAT	2	6	285144	285149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510276
4048	NC_013205	GAA	2	6	285173	285178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510276
4049	NC_013205	ATC	2	6	285198	285203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510276
4050	NC_013205	CAG	2	6	285240	285245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510276
4051	NC_013205	CTC	2	6	285276	285281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510276
4052	NC_013205	CAA	2	6	285407	285412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510276
4053	NC_013205	GCA	2	6	285449	285454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510276
4054	NC_013205	AAG	2	6	285459	285464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510276
4055	NC_013205	GGC	2	6	285465	285470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510276
4056	NC_013205	GCA	2	6	285611	285616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510276
4057	NC_013205	GCA	2	6	285632	285637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510276
4058	NC_013205	AGC	3	9	285721	285729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510276
4059	NC_013205	TTA	2	6	285788	285793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510276
4060	NC_013205	TCA	2	6	285871	285876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510276
4061	NC_013205	AAG	2	6	285882	285887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510276
4062	NC_013205	CCG	2	6	285888	285893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510276
4063	NC_013205	AAC	2	6	285918	285923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510276
4064	NC_013205	TCA	2	6	285994	285999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510276
4065	NC_013205	AGC	2	6	286042	286047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510276
4066	NC_013205	TCG	2	6	286246	286251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510277
4067	NC_013205	ACC	2	6	286275	286280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510277
4068	NC_013205	GAT	2	6	286286	286291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510277
4069	NC_013205	AGC	2	6	286303	286308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510277
4070	NC_013205	GCG	2	6	286460	286465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510277
4071	NC_013205	GCG	2	6	286514	286519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510277
4072	NC_013205	GGT	2	6	286590	286595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510277
4073	NC_013205	CGT	2	6	286679	286684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510277
4074	NC_013205	GCA	2	6	286685	286690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510277
4075	NC_013205	GTG	2	6	286794	286799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510277
4076	NC_013205	GGC	2	6	286862	286867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510277
4077	NC_013205	AGG	2	6	286891	286896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510277
4078	NC_013205	CAT	2	6	286980	286985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510278
4079	NC_013205	AAC	2	6	287056	287061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510278
4080	NC_013205	TGC	2	6	287096	287101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510278
4081	NC_013205	CCT	2	6	287118	287123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510278
4082	NC_013205	CGG	2	6	287193	287198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510278
4083	NC_013205	GTT	2	6	287283	287288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510278
4084	NC_013205	CGT	2	6	287321	287326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510278
4085	NC_013205	TGT	2	6	287366	287371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510278
4086	NC_013205	AGG	2	6	287387	287392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510278
4087	NC_013205	CAT	2	6	287403	287408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510278
4088	NC_013205	AAC	2	6	287410	287415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510278
4089	NC_013205	TGG	2	6	287468	287473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510278
4090	NC_013205	CTC	2	6	287485	287490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510278
4091	NC_013205	TGA	2	6	287594	287599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510278
4092	NC_013205	TGC	2	6	287612	287617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510278
4093	NC_013205	TGC	2	6	287672	287677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510278
4094	NC_013205	GCC	2	6	287708	287713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510278
4095	NC_013205	GGC	2	6	287728	287733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510278
4096	NC_013205	GGC	2	6	287811	287816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510278
4097	NC_013205	CGG	2	6	287820	287825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510278
4098	NC_013205	TCG	2	6	287828	287833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510278
4099	NC_013205	GCG	2	6	287851	287856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510278
4100	NC_013205	CGG	2	6	287868	287873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510278
4101	NC_013205	GCG	2	6	287899	287904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510278
4102	NC_013205	CGG	2	6	287913	287918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510278
4103	NC_013205	CGG	2	6	287931	287936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510278
4104	NC_013205	GCA	2	6	287981	287986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510278
4105	NC_013205	TGG	2	6	288035	288040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510278
4106	NC_013205	TTG	2	6	288052	288057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510278
4107	NC_013205	GCG	2	6	288090	288095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510278
4108	NC_013205	ATG	2	6	288262	288267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510279
4109	NC_013205	GGT	2	6	288363	288368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510279
4110	NC_013205	CAT	2	6	288423	288428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510279
4111	NC_013205	CGA	2	6	288473	288478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510279
4112	NC_013205	CCG	2	6	288534	288539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510279
4113	NC_013205	GGT	2	6	288552	288557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510279
4114	NC_013205	GCG	2	6	288658	288663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510279
4115	NC_013205	GAG	2	6	288817	288822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510279
4116	NC_013205	GCA	2	6	288835	288840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510279
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4118	NC_013205	AGA	2	6	288936	288941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510279
4119	NC_013205	GTC	2	6	289021	289026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510279
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4477	NC_013205	TCG	2	6	329559	329564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510299
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4479	NC_013205	CGT	2	6	329693	329698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510299
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