MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 41677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013205	CGC	2	6	244511	244516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510241
3502	NC_013205	GGC	2	6	244637	244642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510241
3503	NC_013205	ACG	2	6	244662	244667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510241
3504	NC_013205	TAC	2	6	244698	244703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510241
3505	NC_013205	ACG	2	6	244714	244719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510241
3506	NC_013205	GCG	2	6	244739	244744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510241
3507	NC_013205	TGT	2	6	245040	245045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510242
3508	NC_013205	TCA	2	6	245070	245075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510242
3509	NC_013205	TCG	2	6	245130	245135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510242
3510	NC_013205	CGC	3	9	245310	245318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510243
3511	NC_013205	TGG	2	6	245501	245506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510243
3512	NC_013205	GCC	2	6	245573	245578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510243
3513	NC_013205	CGT	2	6	245634	245639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510243
3514	NC_013205	TGG	2	6	245642	245647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510243
3515	NC_013205	CGG	2	6	245718	245723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510243
3516	NC_013205	CAT	2	6	245742	245747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510243
3517	NC_013205	CGG	2	6	245768	245773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510243
3518	NC_013205	TGG	2	6	245774	245779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510243
3519	NC_013205	TCG	3	9	245846	245854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510243
3520	NC_013205	GCA	2	6	245904	245909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510243
3521	NC_013205	GCG	2	6	246085	246090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510243
3522	NC_013205	GGA	2	6	246096	246101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510243
3523	NC_013205	GCG	2	6	246112	246117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510243
3524	NC_013205	CGG	2	6	246177	246182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510243
3525	NC_013205	GCG	2	6	246280	246285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510243
3526	NC_013205	GAT	2	6	246342	246347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510243
3527	NC_013205	GGA	2	6	246357	246362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510243
3528	NC_013205	GGC	2	6	246390	246395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510243
3529	NC_013205	CGA	2	6	246429	246434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510243
3530	NC_013205	CAT	2	6	246450	246455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510243
3531	NC_013205	AAG	2	6	246500	246505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510243
3532	NC_013205	GCG	2	6	246674	246679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510243
3533	NC_013205	TTC	2	6	246710	246715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510243
3534	NC_013205	CGT	2	6	246774	246779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510243
3535	NC_013205	GGC	2	6	246813	246818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510243
3536	NC_013205	CGA	2	6	247207	247212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510244
3537	NC_013205	TGC	2	6	247215	247220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510244
3538	NC_013205	GCC	2	6	247223	247228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510244
3539	NC_013205	GAA	2	6	247331	247336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510244
3540	NC_013205	CCG	2	6	247453	247458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510244
3541	NC_013205	GCG	2	6	247462	247467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510244
3542	NC_013205	GAG	2	6	247592	247597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510244
3543	NC_013205	CGG	2	6	247799	247804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510245
3544	NC_013205	CCG	2	6	247820	247825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510245
3545	NC_013205	CGA	2	6	247916	247921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510245
3546	NC_013205	CGC	3	9	247927	247935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510245
3547	NC_013205	ACG	2	6	247990	247995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510245
3548	NC_013205	ACC	2	6	248121	248126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510245
3549	NC_013205	GCG	2	6	248150	248155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510245
3550	NC_013205	GTG	2	6	248168	248173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510245
3551	NC_013205	TCG	2	6	248200	248205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510245
3552	NC_013205	ACG	2	6	248413	248418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510245
3553	NC_013205	GCC	2	6	248423	248428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510245
3554	NC_013205	CCG	2	6	248434	248439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510245
3555	NC_013205	GGC	2	6	248777	248782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510246
3556	NC_013205	TCT	2	6	249028	249033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510246
3557	NC_013205	GGA	2	6	249132	249137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510246
3558	NC_013205	GCG	2	6	249142	249147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510246
3559	NC_013205	CGG	2	6	249166	249171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510246
3560	NC_013205	CGG	2	6	249200	249205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510246
3561	NC_013205	GCG	2	6	249225	249230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510246
3562	NC_013205	GCC	2	6	249292	249297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510246
3563	NC_013205	GGA	2	6	249377	249382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510246
3564	NC_013205	GGC	3	9	249386	249394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510246
3565	NC_013205	GGT	2	6	249524	249529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510246
3566	NC_013205	CAG	2	6	249745	249750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510246
3567	NC_013205	GCT	2	6	249786	249791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510246
3568	NC_013205	CGA	2	6	249838	249843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510246
3569	NC_013205	GCC	2	6	249851	249856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510246
3570	NC_013205	GCT	2	6	249935	249940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510246
3571	NC_013205	GGC	2	6	250088	250093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510246
3572	NC_013205	CTT	3	9	250110	250118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510246
3573	NC_013205	TTG	2	6	250131	250136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510246
3574	NC_013205	ATG	2	6	250207	250212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510246
3575	NC_013205	CGG	3	9	250486	250494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510247
3576	NC_013205	CTT	2	6	250559	250564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510247
3577	NC_013205	TCG	2	6	250579	250584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510247
3578	NC_013205	GCG	2	6	250597	250602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510247
3579	NC_013205	CTT	4	12	250709	250720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510247
3580	NC_013205	GGC	2	6	250725	250730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510247
3581	NC_013205	ACG	2	6	250759	250764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510247
3582	NC_013205	CTT	2	6	250821	250826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510247
3583	NC_013205	TGA	2	6	250841	250846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510247
3584	NC_013205	CCG	2	6	250956	250961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510248
3585	NC_013205	GCA	2	6	251098	251103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510248
3586	NC_013205	ACA	2	6	251157	251162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510248
3587	NC_013205	CTC	2	6	251174	251179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510248
3588	NC_013205	CGT	2	6	251290	251295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510248
3589	NC_013205	CAG	2	6	251324	251329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510248
3590	NC_013205	CAA	2	6	251473	251478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510248
3591	NC_013205	TGG	2	6	251532	251537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510248
3592	NC_013205	TCT	2	6	251591	251596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510248
3593	NC_013205	CGG	2	6	251604	251609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510248
3594	NC_013205	GCG	2	6	251691	251696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510248
3595	NC_013205	AGC	2	6	251799	251804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510248
3596	NC_013205	CAG	2	6	251876	251881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510248
3597	NC_013205	GGA	2	6	251965	251970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510248
3598	NC_013205	CGA	2	6	251989	251994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510248
3599	NC_013205	CAG	2	6	252113	252118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510248
3600	NC_013205	CGA	2	6	252231	252236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510248
3601	NC_013205	GAT	2	6	252325	252330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510248
3602	NC_013205	GCG	2	6	252369	252374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510248
3603	NC_013205	CAC	2	6	252457	252462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510248
3604	NC_013205	GGC	2	6	252524	252529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510248
3605	NC_013205	CAT	2	6	252541	252546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510248
3606	NC_013205	GCA	2	6	252704	252709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510249
3607	NC_013205	CCG	2	6	252758	252763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510249
3608	NC_013205	CGA	2	6	252953	252958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510249
3609	NC_013205	ACG	2	6	252976	252981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510249
3610	NC_013205	CGC	2	6	253098	253103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510249
3611	NC_013205	CGG	2	6	253134	253139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510249
3612	NC_013205	CGA	2	6	253265	253270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510249
3613	NC_013205	GGC	2	6	253381	253386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510249
3614	NC_013205	CGG	2	6	253400	253405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510249
3615	NC_013205	CGG	2	6	253472	253477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510249
3616	NC_013205	TCC	2	6	253483	253488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510249
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3618	NC_013205	GCC	2	6	253560	253565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510249
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