MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 41677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013205	GGC	2	6	77552	77557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510079
1002	NC_013205	CGG	2	6	77562	77567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510079
1003	NC_013205	CGA	2	6	77592	77597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510079
1004	NC_013205	CCG	2	6	77678	77683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510079
1005	NC_013205	CGA	2	6	77718	77723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510079
1006	NC_013205	GTC	2	6	77731	77736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510079
1007	NC_013205	GGT	2	6	77742	77747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510079
1008	NC_013205	CCT	2	6	77762	77767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510079
1009	NC_013205	CGC	2	6	77792	77797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510079
1010	NC_013205	CCA	2	6	77826	77831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510079
1011	NC_013205	CGA	2	6	77997	78002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510079
1012	NC_013205	CTT	2	6	78012	78017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510079
1013	NC_013205	CAT	2	6	78019	78024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510079
1014	NC_013205	ACG	2	6	78077	78082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510079
1015	NC_013205	GAT	2	6	78114	78119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510079
1016	NC_013205	GGC	3	9	78128	78136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510079
1017	NC_013205	CGT	2	6	78358	78363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510080
1018	NC_013205	TCT	2	6	78403	78408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510080
1019	NC_013205	GGC	2	6	78410	78415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510080
1020	NC_013205	CGT	2	6	78425	78430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510080
1021	NC_013205	TCG	2	6	78529	78534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510080
1022	NC_013205	TCG	2	6	78562	78567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510080
1023	NC_013205	TGC	2	6	78622	78627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510080
1024	NC_013205	GCG	2	6	78709	78714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510080
1025	NC_013205	GGT	2	6	78716	78721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510080
1026	NC_013205	GGC	2	6	78761	78766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510080
1027	NC_013205	GCC	2	6	78796	78801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510080
1028	NC_013205	GAC	2	6	79184	79189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510081
1029	NC_013205	CGC	2	6	79240	79245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510081
1030	NC_013205	CGG	2	6	79335	79340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510081
1031	NC_013205	CTG	2	6	79409	79414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510081
1032	NC_013205	CTG	2	6	79430	79435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510081
1033	NC_013205	CAG	2	6	79463	79468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510081
1034	NC_013205	GAT	3	9	79469	79477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510081
1035	NC_013205	GAA	2	6	79532	79537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510081
1036	NC_013205	ATG	2	6	79584	79589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510081
1037	NC_013205	GGC	2	6	79619	79624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510081
1038	NC_013205	GCG	2	6	79710	79715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510081
1039	NC_013205	AGC	2	6	79731	79736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510081
1040	NC_013205	GAT	2	6	79739	79744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510081
1041	NC_013205	CAC	2	6	79790	79795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510081
1042	NC_013205	GCG	2	6	79796	79801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510081
1043	NC_013205	CGG	2	6	79919	79924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510081
1044	NC_013205	CGG	2	6	79945	79950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510081
1045	NC_013205	CCG	2	6	79974	79979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510081
1046	NC_013205	GAT	2	6	80009	80014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510081
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1049	NC_013205	ATG	2	6	80097	80102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510081
1050	NC_013205	GAT	2	6	80108	80113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510081
1051	NC_013205	TGA	2	6	80146	80151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510081
1052	NC_013205	CAG	2	6	80228	80233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510081
1053	NC_013205	GAC	2	6	80336	80341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510081
1054	NC_013205	GTG	2	6	80343	80348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510081
1055	NC_013205	TGA	2	6	80452	80457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510081
1056	NC_013205	TCC	2	6	80490	80495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510081
1057	NC_013205	CGC	2	6	80514	80519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510081
1058	NC_013205	GCG	2	6	80526	80531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510081
1059	NC_013205	AAT	2	6	80564	80569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258510081
1060	NC_013205	GTC	2	6	80624	80629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510082
1061	NC_013205	TGT	2	6	80638	80643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510082
1062	NC_013205	TGA	2	6	80656	80661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510082
1063	NC_013205	GAT	3	9	80669	80677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510082
1064	NC_013205	ACC	3	9	80788	80796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510082
1065	NC_013205	GCG	2	6	81128	81133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510083
1066	NC_013205	GCC	2	6	81146	81151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510083
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1069	NC_013205	AGG	2	6	81363	81368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510083
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1074	NC_013205	GTC	2	6	81663	81668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510083
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1083	NC_013205	TCG	2	6	82110	82115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510083
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1088	NC_013205	TGG	2	6	82522	82527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510083
1089	NC_013205	CGC	2	6	82532	82537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510083
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1092	NC_013205	GCC	2	6	82594	82599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510083
1093	NC_013205	GAA	2	6	82619	82624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510083
1094	NC_013205	GCG	2	6	82745	82750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510083
1095	NC_013205	GCG	2	6	83065	83070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510084
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1098	NC_013205	AGA	2	6	83294	83299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510084
1099	NC_013205	ATC	2	6	83417	83422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510084
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1102	NC_013205	CGC	2	6	83496	83501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510084
1103	NC_013205	GTC	2	6	83530	83535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510084
1104	NC_013205	GGC	2	6	83583	83588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510084
1105	NC_013205	GAA	2	6	83671	83676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510084
1106	NC_013205	GAG	2	6	83695	83700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510084
1107	NC_013205	TCG	2	6	83793	83798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510084
1108	NC_013205	CGC	2	6	83836	83841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510084
1109	NC_013205	CAC	2	6	83920	83925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510084
1110	NC_013205	CCG	2	6	83976	83981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510084
1111	NC_013205	ACG	2	6	84011	84016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510084
1112	NC_013205	CAC	2	6	84094	84099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510084
1113	NC_013205	GCC	2	6	84140	84145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510084
1114	NC_013205	CGC	2	6	84214	84219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510084
1115	NC_013205	CTC	2	6	84400	84405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510085
1116	NC_013205	CAA	2	6	84453	84458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510085
1117	NC_013205	GAA	3	9	84477	84485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510085
1118	NC_013205	TCA	2	6	84644	84649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510085
1119	NC_013205	CGT	2	6	84692	84697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510085
1120	NC_013205	CGA	2	6	84701	84706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510085
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1122	NC_013205	CAT	3	9	84873	84881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510085
1123	NC_013205	CGA	2	6	84969	84974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510085
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1126	NC_013205	CAT	2	6	85125	85130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510085
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1484	NC_013205	CGC	2	6	106636	106641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510102
1485	NC_013205	GCA	2	6	106755	106760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510103
1486	NC_013205	CGC	2	6	106765	106770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510103
1487	NC_013205	CGG	2	6	106799	106804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510103
1488	NC_013205	TCG	2	6	106889	106894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510103
1489	NC_013205	GGA	2	6	107001	107006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510103
1490	NC_013205	CGG	2	6	107019	107024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510103
1491	NC_013205	GAC	2	6	107026	107031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510103
1492	NC_013205	AGG	2	6	107048	107053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510103
1493	NC_013205	CGT	2	6	107073	107078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510103
1494	NC_013205	TCG	2	6	107108	107113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510103
1495	NC_013205	GCT	2	6	107133	107138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510103
1496	NC_013205	GAG	3	9	107224	107232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510103
1497	NC_013205	GAA	2	6	107398	107403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510104
1498	NC_013205	CGG	3	9	107498	107506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510104
1499	NC_013205	GCG	2	6	107542	107547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510104
1500	NC_013205	GTC	2	6	107575	107580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510104

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