MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 41677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013205	GTG	2	6	107749	107754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510104
1502	NC_013205	ACG	2	6	107767	107772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510104
1503	NC_013205	GGA	2	6	107832	107837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510104
1504	NC_013205	CCG	2	6	107844	107849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510104
1505	NC_013205	GAC	2	6	107932	107937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510104
1506	NC_013205	CGG	2	6	107940	107945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510104
1507	NC_013205	CGG	2	6	107963	107968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510104
1508	NC_013205	ATC	2	6	108068	108073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510104
1509	NC_013205	CGG	2	6	108074	108079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510104
1510	NC_013205	CAG	2	6	108112	108117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510104
1511	NC_013205	TGG	2	6	108175	108180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510104
1512	NC_013205	CAG	2	6	108181	108186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510104
1513	NC_013205	TGC	2	6	108236	108241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510104
1514	NC_013205	ACG	2	6	108247	108252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510104
1515	NC_013205	GTG	2	6	108346	108351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510104
1516	NC_013205	AGG	2	6	108410	108415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510104
1517	NC_013205	TGG	2	6	108434	108439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510104
1518	NC_013205	CTT	2	6	108519	108524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510104
1519	NC_013205	GGC	2	6	108687	108692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510105
1520	NC_013205	TGG	2	6	108736	108741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510105
1521	NC_013205	CGT	2	6	108848	108853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510105
1522	NC_013205	GGA	2	6	108905	108910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510105
1523	NC_013205	ACG	2	6	108991	108996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510105
1524	NC_013205	CGG	3	9	109082	109090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510105
1525	NC_013205	CAT	2	6	109151	109156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510105
1526	NC_013205	ACG	2	6	109165	109170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510105
1527	NC_013205	GTC	2	6	109338	109343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510105
1528	NC_013205	GAC	2	6	109344	109349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510105
1529	NC_013205	GTC	2	6	109413	109418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510105
1530	NC_013205	CGG	2	6	109421	109426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510105
1531	NC_013205	GCC	2	6	109557	109562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510105
1532	NC_013205	TGC	2	6	109570	109575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510105
1533	NC_013205	CTG	2	6	109715	109720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510106
1534	NC_013205	ACG	2	6	109767	109772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510106
1535	NC_013205	GGA	2	6	109796	109801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510106
1536	NC_013205	ACC	2	6	109809	109814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510106
1537	NC_013205	TCA	2	6	110015	110020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510107
1538	NC_013205	GCG	2	6	110053	110058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510107
1539	NC_013205	GTC	2	6	110089	110094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510107
1540	NC_013205	CAT	2	6	110127	110132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510107
1541	NC_013205	TCA	2	6	110198	110203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510107
1542	NC_013205	TGA	2	6	110213	110218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510107
1543	NC_013205	TCA	2	6	110279	110284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510107
1544	NC_013205	GTC	2	6	110521	110526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510108
1545	NC_013205	GCG	3	9	110562	110570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510108
1546	NC_013205	GAC	2	6	110659	110664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510108
1547	NC_013205	GCG	2	6	110669	110674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510108
1548	NC_013205	GGA	2	6	110694	110699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510108
1549	NC_013205	AGC	2	6	110944	110949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510109
1550	NC_013205	CAC	2	6	111401	111406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510110
1551	NC_013205	CAG	2	6	111416	111421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510110
1552	NC_013205	GAC	2	6	111437	111442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510110
1553	NC_013205	CGG	2	6	111556	111561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510110
1554	NC_013205	TGT	2	6	111613	111618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510110
1555	NC_013205	GGA	2	6	111688	111693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510110
1556	NC_013205	GGC	2	6	111725	111730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510110
1557	NC_013205	GAG	2	6	111755	111760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510110
1558	NC_013205	GCG	2	6	111766	111771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510110
1559	NC_013205	CGA	2	6	111772	111777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510110
1560	NC_013205	AGG	2	6	111798	111803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510110
1561	NC_013205	ACC	2	6	111834	111839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510110
1562	NC_013205	TCT	2	6	111870	111875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510110
1563	NC_013205	GCG	2	6	111879	111884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510110
1564	NC_013205	GCC	2	6	111966	111971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510110
1565	NC_013205	CCA	2	6	112045	112050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510110
1566	NC_013205	CGG	2	6	112066	112071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510110
1567	NC_013205	CCG	2	6	112198	112203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510110
1568	NC_013205	GCA	2	6	112253	112258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510110
1569	NC_013205	GGC	2	6	112259	112264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510110
1570	NC_013205	GCC	2	6	112300	112305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510110
1571	NC_013205	GCC	2	6	112345	112350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510110
1572	NC_013205	CGC	2	6	112397	112402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510110
1573	NC_013205	CGA	2	6	112444	112449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510110
1574	NC_013205	CGC	2	6	112511	112516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510110
1575	NC_013205	TCA	2	6	112555	112560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510110
1576	NC_013205	CGC	2	6	112620	112625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510110
1577	NC_013205	AGC	2	6	112752	112757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510110
1578	NC_013205	ACG	2	6	112764	112769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510110
1579	NC_013205	AGC	2	6	112851	112856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510110
1580	NC_013205	CTG	2	6	112921	112926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510110
1581	NC_013205	CAC	2	6	113078	113083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510110
1582	NC_013205	CGG	2	6	113212	113217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510110
1583	NC_013205	AGA	2	6	113239	113244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510110
1584	NC_013205	CGC	2	6	113360	113365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510110
1585	NC_013205	GCG	2	6	113391	113396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510110
1586	NC_013205	GCC	2	6	113415	113420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510110
1587	NC_013205	GAG	2	6	113606	113611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510111
1588	NC_013205	CGC	2	6	113629	113634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510111
1589	NC_013205	GGA	2	6	113645	113650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510111
1590	NC_013205	GCT	2	6	113679	113684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510111
1591	NC_013205	CGG	2	6	113710	113715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510111
1592	NC_013205	GAC	2	6	113724	113729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510111
1593	NC_013205	TAT	2	6	113772	113777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510111
1594	NC_013205	GAT	2	6	113807	113812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510111
1595	NC_013205	AGC	2	6	114004	114009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510111
1596	NC_013205	TGG	2	6	114010	114015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510111
1597	NC_013205	GGA	2	6	114144	114149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510111
1598	NC_013205	GCC	2	6	114153	114158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510111
1599	NC_013205	CGA	2	6	114161	114166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510111
1600	NC_013205	GAA	2	6	114174	114179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510111
1601	NC_013205	CTG	2	6	114189	114194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510111
1602	NC_013205	TGG	2	6	114344	114349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510112
1603	NC_013205	ATC	2	6	114378	114383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510112
1604	NC_013205	TTC	2	6	114393	114398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510112
1605	NC_013205	CTG	2	6	114434	114439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510112
1606	NC_013205	CCG	2	6	114609	114614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510113
1607	NC_013205	CCA	2	6	114636	114641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510113
1608	NC_013205	TCG	2	6	114650	114655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510113
1609	NC_013205	GAA	2	6	114664	114669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510113
1610	NC_013205	GCC	2	6	114730	114735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510113
1611	NC_013205	TGA	3	9	114747	114755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510113
1612	NC_013205	CTT	2	6	114820	114825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510113
1613	NC_013205	TCC	2	6	114914	114919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510113
1614	NC_013205	GAA	2	6	114930	114935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510113
1615	NC_013205	CGC	2	6	115059	115064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510113
1616	NC_013205	TTC	2	6	115069	115074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510113
1617	NC_013205	CCA	2	6	115101	115106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510113
1618	NC_013205	CGA	2	6	115420	115425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510114
1619	NC_013205	TCC	2	6	115458	115463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510114
1620	NC_013205	CGG	2	6	115523	115528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510114
1621	NC_013205	GAC	2	6	115538	115543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510114
1622	NC_013205	AGA	2	6	115594	115599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510114
1623	NC_013205	TTG	2	6	115815	115820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510114
1624	NC_013205	GCC	2	6	115968	115973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510114
1625	NC_013205	GAA	2	6	116067	116072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510114
1626	NC_013205	GCG	2	6	116097	116102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510114
1627	NC_013205	GCC	2	6	116141	116146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510114
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1631	NC_013205	GGT	2	6	116615	116620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510115
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1633	NC_013205	CGT	2	6	116798	116803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510115
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1637	NC_013205	GCG	2	6	117088	117093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510115
1638	NC_013205	GAC	2	6	117108	117113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510115
1639	NC_013205	TCT	2	6	117118	117123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510115
1640	NC_013205	GGA	2	6	117146	117151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510115
1641	NC_013205	GCT	2	6	117293	117298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510115
1642	NC_013205	GTG	2	6	117306	117311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510115
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1644	NC_013205	TGG	2	6	117328	117333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510115
1645	NC_013205	CGG	2	6	117427	117432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510115
1646	NC_013205	GCT	2	6	117533	117538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510115
1647	NC_013205	CCG	2	6	117589	117594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510115
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1650	NC_013205	CAT	2	6	117913	117918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510116
1651	NC_013205	GGT	2	6	118003	118008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510116
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1654	NC_013205	GCG	2	6	118101	118106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510116
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1662	NC_013205	GCA	2	6	118750	118755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510117
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1682	NC_013205	CCA	2	6	120078	120083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510120
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1688	NC_013205	ATC	2	6	120599	120604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510120
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1696	NC_013205	GCT	2	6	121374	121379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510120
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1700	NC_013205	GCT	2	6	121781	121786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510121
1701	NC_013205	CGA	2	6	121811	121816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510121
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1708	NC_013205	CGA	2	6	122050	122055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510122
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1712	NC_013205	CCG	2	6	122167	122172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510122
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1717	NC_013205	CTT	2	6	122470	122475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510122
1718	NC_013205	GCG	2	6	122494	122499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510122
1719	NC_013205	GCG	2	6	122955	122960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510123
1720	NC_013205	GAA	2	6	123095	123100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510123
1721	NC_013205	GTC	2	6	123200	123205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510123
1722	NC_013205	CGT	2	6	123292	123297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510123
1723	NC_013205	GCT	2	6	123322	123327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510123
1724	NC_013205	GAC	2	6	123412	123417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510123
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1726	NC_013205	AGC	2	6	123444	123449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510123
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1728	NC_013205	TGA	2	6	123495	123500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510123
1729	NC_013205	CTG	2	6	123545	123550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510123
1730	NC_013205	CGA	2	6	123622	123627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510123
1731	NC_013205	ATG	2	6	123701	123706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510123
1732	NC_013205	GAA	2	6	123788	123793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510123
1733	NC_013205	TAC	2	6	123839	123844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510123
1734	NC_013205	CGG	2	6	123937	123942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510123
1735	NC_013205	ACG	2	6	123974	123979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510123
1736	NC_013205	TCG	3	9	124007	124015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510123
1737	NC_013205	GTC	2	6	124039	124044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510123
1738	NC_013205	GCG	2	6	124081	124086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510124
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1741	NC_013205	GCG	2	6	124420	124425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510124
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1745	NC_013205	CGA	2	6	124553	124558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510124
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1855	NC_013205	CAT	2	6	133704	133709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510133
1856	NC_013205	CAT	2	6	133743	133748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510133
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1859	NC_013205	GTC	2	6	134118	134123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510134
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1973	NC_013205	TCG	2	6	142128	142133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510145
1974	NC_013205	GGC	2	6	142231	142236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510145
1975	NC_013205	GAC	2	6	142289	142294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510145
1976	NC_013205	GAG	2	6	142313	142318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510145
1977	NC_013205	GAA	2	6	142361	142366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510145
1978	NC_013205	GCG	2	6	142420	142425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510145
1979	NC_013205	CGG	2	6	142447	142452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510145
1980	NC_013205	TGC	2	6	142532	142537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510146
1981	NC_013205	GAT	2	6	142582	142587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510146
1982	NC_013205	AGA	2	6	142605	142610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510146
1983	NC_013205	CTT	2	6	142627	142632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510146
1984	NC_013205	ATG	2	6	142637	142642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510146
1985	NC_013205	GCG	2	6	142696	142701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510146
1986	NC_013205	ACC	2	6	142718	142723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510146
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1988	NC_013205	ACC	2	6	143495	143500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510147
1989	NC_013205	GCC	2	6	143504	143509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510147
1990	NC_013205	ACG	2	6	143544	143549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510147
1991	NC_013205	TTC	2	6	143552	143557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510147
1992	NC_013205	CGA	2	6	143569	143574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510147
1993	NC_013205	CAG	2	6	143591	143596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510147
1994	NC_013205	CAT	2	6	143641	143646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510147
1995	NC_013205	GAA	2	6	143668	143673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510147
1996	NC_013205	ACG	2	6	143688	143693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510147
1997	NC_013205	CAG	2	6	143759	143764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510147
1998	NC_013205	TTC	2	6	143900	143905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510147
1999	NC_013205	CTG	2	6	143930	143935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510147
2000	NC_013205	TAC	2	6	143939	143944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510147

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