MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 4961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019738	CCAAA	2	10	1679	1688	60 %	0 %	0 %	40 %	428308378
2	NC_019738	TTCAC	2	10	2648	2657	20 %	40 %	0 %	40 %	428308380
3	NC_019738	CGCAC	2	10	2880	2889	20 %	0 %	20 %	60 %	428308380
4	NC_019738	CAAAG	2	10	3486	3495	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019738	ATTTA	2	10	4435	4444	40 %	60 %	0 %	0 %	428308381
6	NC_019738	TATTG	2	10	4851	4860	20 %	60 %	20 %	0 %	428308381
7	NC_019738	GACGG	2	10	9587	9596	20 %	0 %	60 %	20 %	428308385
8	NC_019738	GCGAT	2	10	11319	11328	20 %	20 %	40 %	20 %	428308385
9	NC_019738	GTACA	2	10	11480	11489	40 %	20 %	20 %	20 %	428308385
10	NC_019738	TATGT	2	10	13514	13523	20 %	60 %	20 %	0 %	428308387
11	NC_019738	AACCC	2	10	16971	16980	40 %	0 %	0 %	60 %	428308390
12	NC_019738	TTAGG	2	10	20666	20675	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019738	TTGAT	2	10	21211	21220	20 %	60 %	20 %	0 %	428308394
14	NC_019738	TTACC	2	10	23187	23196	20 %	40 %	0 %	40 %	428308396
15	NC_019738	TAGAT	2	10	23806	23815	40 %	40 %	20 %	0 %	428308397
16	NC_019738	CAATC	2	10	24310	24319	40 %	20 %	0 %	40 %	428308397
17	NC_019738	CTGTA	2	10	26988	26997	20 %	40 %	20 %	20 %	428308400
18	NC_019738	AATCA	2	10	28067	28076	60 %	20 %	0 %	20 %	428308401
19	NC_019738	GACTT	2	10	28488	28497	20 %	40 %	20 %	20 %	428308401
20	NC_019738	TGGAT	2	10	29344	29353	20 %	40 %	40 %	0 %	428308402
21	NC_019738	TCCGC	2	10	30896	30905	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_019738	TTCTA	2	10	33873	33882	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019738	CACGA	2	10	34592	34601	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_019738	ACGGC	2	10	34812	34821	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_019738	CTACG	2	10	39701	39710	20 %	20 %	20 %	40 %	428308406
26	NC_019738	GGAGT	2	10	41502	41511	20 %	20 %	60 %	0 %	428308408
27	NC_019738	CATTG	2	10	42630	42639	20 %	40 %	20 %	20 %	428308409
28	NC_019738	CGATA	2	10	45418	45427	40 %	20 %	20 %	20 %	428308412
29	NC_019738	GCTGA	2	10	46066	46075	20 %	20 %	40 %	20 %	428308413
30	NC_019738	ATGCT	2	10	46460	46469	20 %	40 %	20 %	20 %	428308413
31	NC_019738	ATCGA	2	10	50485	50494	40 %	20 %	20 %	20 %	428308416
32	NC_019738	CAAAT	2	10	52889	52898	60 %	20 %	0 %	20 %	428308419
33	NC_019738	CTTTA	2	10	53063	53072	20 %	60 %	0 %	20 %	428308419
34	NC_019738	TCCTC	2	10	55556	55565	0 %	40 %	0 %	60 %	428308422
35	NC_019738	ATTCA	2	10	55962	55971	40 %	40 %	0 %	20 %	428308422
36	NC_019738	CTCAG	2	10	56609	56618	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_019738	TTTTA	2	10	61398	61407	20 %	80 %	0 %	0 %	428308427
38	NC_019738	TGCAC	2	10	61876	61885	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_019738	GAAAA	2	10	66251	66260	80 %	0 %	20 %	0 %	428308430
40	NC_019738	GATTG	2	10	66450	66459	20 %	40 %	40 %	0 %	428308430
41	NC_019738	AGTTA	2	10	67479	67488	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019738	ATTAC	2	10	70696	70705	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_019738	ATACA	2	10	72064	72073	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_019738	CCATC	2	10	73745	73754	20 %	20 %	0 %	60 %	428308437
45	NC_019738	GATGT	2	10	74466	74475	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019738	CTTAA	2	10	75331	75340	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_019738	AGGGG	2	10	76745	76754	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019738	GGCGC	2	10	78936	78945	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
49	NC_019738	CAAGT	2	10	83368	83377	40 %	20 %	20 %	20 %	428308449
50	NC_019738	GACTT	2	10	86576	86585	20 %	40 %	20 %	20 %	428308451
51	NC_019738	AAACC	2	10	86617	86626	60 %	0 %	0 %	40 %	428308451
52	NC_019738	TCAAG	2	10	86763	86772	40 %	20 %	20 %	20 %	428308452
53	NC_019738	AACAG	2	10	87956	87965	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_019738	GTCAA	2	10	89134	89143	40 %	20 %	20 %	20 %	428308453
55	NC_019738	TGCTC	2	10	89512	89521	0 %	40 %	20 %	40 %	428308454
56	NC_019738	AGGAA	2	10	91198	91207	60 %	0 %	40 %	0 %	428308455
57	NC_019738	ACTGT	2	10	93931	93940	20 %	40 %	20 %	20 %	428308457
58	NC_019738	ACTTA	2	10	95577	95586	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_019738	GGTTT	2	10	96019	96028	0 %	60 %	40 %	0 %	428308460
60	NC_019738	GTCTT	2	10	101099	101108	0 %	60 %	20 %	20 %	428308462
61	NC_019738	CACCC	2	10	101558	101567	20 %	0 %	0 %	80 %	428308463
62	NC_019738	TTTTC	2	10	103012	103021	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_019738	GTGGC	2	10	103852	103861	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_019738	GTTTT	2	10	113772	113781	0 %	80 %	20 %	0 %	428308472
65	NC_019738	CCCAT	2	10	114849	114858	20 %	20 %	0 %	60 %	428308473
66	NC_019738	ACATC	2	10	115728	115737	40 %	20 %	0 %	40 %	428308474
67	NC_019738	CTGAG	2	10	116099	116108	20 %	20 %	40 %	20 %	428308474
68	NC_019738	TCTGA	2	10	117933	117942	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_019738	TTCAA	2	10	118392	118401	40 %	40 %	0 %	20 %	428308475
70	NC_019738	TGGGC	2	10	119320	119329	0 %	20 %	60 %	20 %	428308476
71	NC_019738	GTGGA	2	10	119823	119832	20 %	20 %	60 %	0 %	428308476
72	NC_019738	GGGTT	2	10	119937	119946	0 %	40 %	60 %	0 %	428308476
73	NC_019738	TTGGC	2	10	120171	120180	0 %	40 %	40 %	20 %	428308476
74	NC_019738	ATATT	2	10	121880	121889	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019738	TTGAA	2	10	123327	123336	40 %	40 %	20 %	0 %	428308478
76	NC_019738	GTTAA	2	10	124515	124524	40 %	40 %	20 %	0 %	428308480
77	NC_019738	TATTC	2	10	125204	125213	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_019738	AGTTC	2	10	127679	127688	20 %	40 %	20 %	20 %	428308482
79	NC_019738	AACCT	2	10	129436	129445	40 %	20 %	0 %	40 %	428308483
80	NC_019738	TTATT	2	10	132931	132940	20 %	80 %	0 %	0 %	428308487
81	NC_019738	GGCAC	2	10	134180	134189	20 %	0 %	40 %	40 %	428308487
82	NC_019738	GTCGG	2	10	134830	134839	0 %	20 %	60 %	20 %	428308487
83	NC_019738	CTGCC	2	10	136031	136040	0 %	20 %	20 %	60 %	428308489
84	NC_019738	GGAGA	2	10	137897	137906	40 %	0 %	60 %	0 %	428308489
85	NC_019738	CCTAA	2	10	139237	139246	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_019738	AATCC	2	10	139606	139615	40 %	20 %	0 %	40 %	428308490
87	NC_019738	CTTTT	2	10	141556	141565	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_019738	CGTCC	2	10	141943	141952	0 %	20 %	20 %	60 %	428308493
89	NC_019738	AGGAC	2	10	142907	142916	40 %	0 %	40 %	20 %	428308493
90	NC_019738	TCCCC	2	10	144900	144909	0 %	20 %	0 %	80 %	428308494
91	NC_019738	TTTAG	2	10	146066	146075	20 %	60 %	20 %	0 %	428308495
92	NC_019738	AGCCC	2	10	146464	146473	20 %	0 %	20 %	60 %	428308495
93	NC_019738	ATCCC	2	10	149282	149291	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
94	NC_019738	ATTGC	2	10	150198	150207	20 %	40 %	20 %	20 %	428308497
95	NC_019738	ACGGC	2	10	154666	154675	20 %	0 %	40 %	40 %	428308500
96	NC_019738	CTTTA	2	10	157366	157375	20 %	60 %	0 %	20 %	428308502
97	NC_019738	GTACC	2	10	159882	159891	20 %	20 %	20 %	40 %	428308506
98	NC_019738	CTGTC	2	10	160571	160580	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_019738	AAATG	2	10	160932	160941	60 %	20 %	20 %	0 %	428308507
100	NC_019738	CTTGA	2	10	161248	161257	20 %	40 %	20 %	20 %	428308507
101	NC_019738	CCCTT	2	10	161414	161423	0 %	40 %	0 %	60 %	428308507
102	NC_019738	TAATT	2	10	164651	164660	40 %	60 %	0 %	0 %	428308510
103	NC_019738	TTCAA	2	10	169794	169803	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_019738	TTTGG	2	10	170387	170396	0 %	60 %	40 %	0 %	428308514
105	NC_019738	AGGTA	2	10	176555	176564	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019738	GAGAA	2	10	177440	177449	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019738	CTCTT	2	10	177522	177531	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_019738	TACAA	2	10	178256	178265	60 %	20 %	0 %	20 %	428308522
109	NC_019738	TTTCG	2	10	179939	179948	0 %	60 %	20 %	20 %	428308523
110	NC_019738	TTGAA	2	10	181144	181153	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019738	TGTTT	2	10	182989	182998	0 %	80 %	20 %	0 %	428308526
112	NC_019738	CCTCC	2	10	186660	186669	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
113	NC_019738	TGCGA	2	10	187976	187985	20 %	20 %	40 %	20 %	428308533
114	NC_019738	AAATA	2	10	190971	190980	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019738	ATTTT	2	10	192112	192121	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019738	CCGCT	2	10	193395	193404	0 %	20 %	20 %	60 %	428308539
117	NC_019738	AAATA	2	10	193500	193509	80 %	20 %	0 %	0 %	428308539
118	NC_019738	GGGAA	2	10	193924	193933	40 %	0 %	60 %	0 %	428308539
119	NC_019738	CTTGA	2	10	194185	194194	20 %	40 %	20 %	20 %	428308539
120	NC_019738	TAACA	2	10	195594	195603	60 %	20 %	0 %	20 %	428308540
121	NC_019738	CCAAA	2	10	196575	196584	60 %	0 %	0 %	40 %	428308540
122	NC_019738	TGCCT	2	10	197805	197814	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_019738	TTGGT	2	10	198228	198237	0 %	60 %	40 %	0 %	428308541
124	NC_019738	CCAGC	2	10	200296	200305	20 %	0 %	20 %	60 %	428308543
125	NC_019738	TCGCC	2	10	201069	201078	0 %	20 %	20 %	60 %	428308545
126	NC_019738	GGGCT	2	10	201719	201728	0 %	20 %	60 %	20 %	428308545
127	NC_019738	TAATT	2	10	202369	202378	40 %	60 %	0 %	0 %	428308546
128	NC_019738	CGATT	2	10	202783	202792	20 %	40 %	20 %	20 %	428308546
129	NC_019738	AAGCT	2	10	204191	204200	40 %	20 %	20 %	20 %	428308547
130	NC_019738	CACAA	2	10	205590	205599	60 %	0 %	0 %	40 %	428308547
131	NC_019738	GGAGT	2	10	206060	206069	20 %	20 %	60 %	0 %	428308547
132	NC_019738	CAACA	2	10	207376	207385	60 %	0 %	0 %	40 %	428308548
133	NC_019738	ACTCA	2	10	209814	209823	40 %	20 %	0 %	40 %	428308549
134	NC_019738	AGTTG	2	10	215530	215539	20 %	40 %	40 %	0 %	428308554
135	NC_019738	AAATG	2	10	215916	215925	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019738	GAAAA	2	10	217013	217022	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019738	GCAGC	2	10	217217	217226	20 %	0 %	40 %	40 %	428308556
138	NC_019738	CGATT	2	10	220997	221006	20 %	40 %	20 %	20 %	428308559
139	NC_019738	AGATG	2	10	221636	221645	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019738	CTTAA	2	10	223004	223013	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_019738	CTAAT	2	10	223532	223541	40 %	40 %	0 %	20 %	428308561
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267	NC_019738	ACCCC	2	10	453522	453531	20 %	0 %	0 %	80 %	428308754
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