MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 4961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019738	GCTTG	2	10	839394	839403	0 %	40 %	40 %	20 %	428309071
502	NC_019738	AATGG	2	10	845448	845457	40 %	20 %	40 %	0 %	428309076
503	NC_019738	TCAAC	2	10	846561	846570	40 %	20 %	0 %	40 %	428309077
504	NC_019738	ACAGT	2	10	847004	847013	40 %	20 %	20 %	20 %	428309077
505	NC_019738	AAGGT	2	10	848619	848628	40 %	20 %	40 %	0 %	428309080
506	NC_019738	GATTA	2	10	850559	850568	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
507	NC_019738	GAATC	2	10	850811	850820	40 %	20 %	20 %	20 %	428309083
508	NC_019738	CCACA	2	10	851441	851450	40 %	0 %	0 %	60 %	428309083
509	NC_019738	CCAAC	2	10	852909	852918	40 %	0 %	0 %	60 %	428309085
510	NC_019738	CCTTT	2	10	853949	853958	0 %	60 %	0 %	40 %	428309086
511	NC_019738	ATAAC	2	10	856210	856219	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
512	NC_019738	AAAAC	2	10	857164	857173	80 %	0 %	0 %	20 %	428309090
513	NC_019738	TTCTT	2	10	859929	859938	0 %	80 %	0 %	20 %	428309092
514	NC_019738	TCAGC	2	10	860883	860892	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
515	NC_019738	CTGGA	2	10	862860	862869	20 %	20 %	40 %	20 %	428309095
516	NC_019738	TCTCG	2	10	863115	863124	0 %	40 %	20 %	40 %	428309095
517	NC_019738	GTTTT	2	10	863191	863200	0 %	80 %	20 %	0 %	428309095
518	NC_019738	GCCTC	2	10	863949	863958	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
519	NC_019738	CGAGT	2	10	865535	865544	20 %	20 %	40 %	20 %	428309098
520	NC_019738	CCATG	2	10	867808	867817	20 %	20 %	20 %	40 %	428309100
521	NC_019738	TTCAT	2	10	868234	868243	20 %	60 %	0 %	20 %	428309100
522	NC_019738	TCACC	2	10	871014	871023	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
523	NC_019738	CAAAG	2	10	871234	871243	60 %	0 %	20 %	20 %	428309105
524	NC_019738	CACCT	2	10	873061	873070	20 %	20 %	0 %	60 %	428309106
525	NC_019738	CAACC	2	10	873535	873544	40 %	0 %	0 %	60 %	428309107
526	NC_019738	AGAAA	2	10	875227	875236	80 %	0 %	20 %	0 %	428309108
527	NC_019738	GAAGG	2	10	881887	881896	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
528	NC_019738	TAGCT	2	10	884322	884331	20 %	40 %	20 %	20 %	428309114
529	NC_019738	TACTG	2	10	886485	886494	20 %	40 %	20 %	20 %	428309115
530	NC_019738	GACAT	2	10	886700	886709	40 %	20 %	20 %	20 %	428309115
531	NC_019738	CAAGA	2	10	887005	887014	60 %	0 %	20 %	20 %	428309115
532	NC_019738	CAAGA	2	10	887179	887188	60 %	0 %	20 %	20 %	428309115
533	NC_019738	CAACT	2	10	887234	887243	40 %	20 %	0 %	40 %	428309115
534	NC_019738	GCGCC	2	10	888433	888442	0 %	0 %	40 %	60 %	428309115
535	NC_019738	CAACC	2	10	888618	888627	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
536	NC_019738	ATATT	2	10	889385	889394	40 %	60 %	0 %	0 %	428309116
537	NC_019738	ACGAT	2	10	890181	890190	40 %	20 %	20 %	20 %	428309117
538	NC_019738	CAGTT	2	10	890652	890661	20 %	40 %	20 %	20 %	428309117
539	NC_019738	GCGTC	2	10	894428	894437	0 %	20 %	40 %	40 %	428309118
540	NC_019738	CGATC	2	10	894807	894816	20 %	20 %	20 %	40 %	428309118
541	NC_019738	TGCCG	2	10	896762	896771	0 %	20 %	40 %	40 %	428309118
542	NC_019738	CTTTT	2	10	897724	897733	0 %	80 %	0 %	20 %	428309119
543	NC_019738	TAAAG	2	10	900060	900069	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
544	NC_019738	AAAAG	2	10	900629	900638	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
545	NC_019738	AATGG	2	10	901552	901561	40 %	20 %	40 %	0 %	428309121
546	NC_019738	CAAGT	2	10	901969	901978	40 %	20 %	20 %	20 %	428309121
547	NC_019738	ACTGA	2	10	904032	904041	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
548	NC_019738	TTTTG	2	10	904289	904298	0 %	80 %	20 %	0 %	428309124
549	NC_019738	CCCTT	2	10	905317	905326	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
550	NC_019738	ATTGT	2	10	906569	906578	20 %	60 %	20 %	0 %	428309126
551	NC_019738	GAAGA	2	10	912480	912489	60 %	0 %	40 %	0 %	428309131
552	NC_019738	TTTGG	2	10	912546	912555	0 %	60 %	40 %	0 %	428309131
553	NC_019738	CAAGG	2	10	914457	914466	40 %	0 %	40 %	20 %	428309132
554	NC_019738	TGGAT	2	10	914677	914686	20 %	40 %	40 %	0 %	428309132
555	NC_019738	TTGCC	2	10	916168	916177	0 %	40 %	20 %	40 %	428309133
556	NC_019738	TCCAC	2	10	918632	918641	20 %	20 %	0 %	60 %	428309136
557	NC_019738	ACACC	2	10	921810	921819	40 %	0 %	0 %	60 %	428309137
558	NC_019738	ATGAG	2	10	922672	922681	40 %	20 %	40 %	0 %	428309137
559	NC_019738	CATTG	2	10	922823	922832	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
560	NC_019738	TACTC	2	10	923251	923260	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
561	NC_019738	CCAGC	2	10	923497	923506	20 %	0 %	20 %	60 %	428309139
562	NC_019738	CATAT	2	10	923515	923524	40 %	40 %	0 %	20 %	428309139
563	NC_019738	ATGGG	2	10	923963	923972	20 %	20 %	60 %	0 %	428309139
564	NC_019738	TTATG	2	10	924321	924330	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
565	NC_019738	GAGCA	2	10	925085	925094	40 %	0 %	40 %	20 %	428309140
566	NC_019738	CGTTT	2	10	927089	927098	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
567	NC_019738	GCATG	2	10	928047	928056	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
568	NC_019738	TGTAC	2	10	930640	930649	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
569	NC_019738	CAAAA	2	10	932355	932364	80 %	0 %	0 %	20 %	428309147
570	NC_019738	TTGAT	2	10	933654	933663	20 %	60 %	20 %	0 %	428309147
571	NC_019738	CATTG	2	10	934158	934167	20 %	40 %	20 %	20 %	428309148
572	NC_019738	GCTGA	2	10	935235	935244	20 %	20 %	40 %	20 %	428309148
573	NC_019738	TCATC	2	10	936511	936520	20 %	40 %	0 %	40 %	428309149
574	NC_019738	GTCAA	2	10	937491	937500	40 %	20 %	20 %	20 %	428309149
575	NC_019738	ACTGA	2	10	938158	938167	40 %	20 %	20 %	20 %	428309150
576	NC_019738	AAAGC	2	10	938900	938909	60 %	0 %	20 %	20 %	428309150
577	NC_019738	AGTAC	2	10	940052	940061	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
578	NC_019738	TGCGG	2	10	940928	940937	0 %	20 %	60 %	20 %	428309152
579	NC_019738	AAAGT	2	10	944520	944529	60 %	20 %	20 %	0 %	428309157
580	NC_019738	ATCTC	2	10	944846	944855	20 %	40 %	0 %	40 %	428309157
581	NC_019738	ATTAC	2	10	946086	946095	40 %	40 %	0 %	20 %	428309158
582	NC_019738	TTATC	2	10	947104	947113	20 %	60 %	0 %	20 %	428309158
583	NC_019738	AATGA	2	10	947543	947552	60 %	20 %	20 %	0 %	428309158
584	NC_019738	ATTCT	2	10	948030	948039	20 %	60 %	0 %	20 %	428309158
585	NC_019738	ATTGC	2	10	948739	948748	20 %	40 %	20 %	20 %	428309159
586	NC_019738	GACTG	2	10	950918	950927	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
587	NC_019738	GACTT	2	10	956449	956458	20 %	40 %	20 %	20 %	428309169
588	NC_019738	ACGCT	2	10	956969	956978	20 %	20 %	20 %	40 %	428309169
589	NC_019738	TGAAT	2	10	958774	958783	40 %	40 %	20 %	0 %	428309171
590	NC_019738	CACCC	2	10	961770	961779	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
591	NC_019738	GCCTT	2	10	962490	962499	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
592	NC_019738	CATCC	2	10	964985	964994	20 %	20 %	0 %	60 %	428309174
593	NC_019738	CTGCC	2	10	965709	965718	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
594	NC_019738	GCTTG	2	10	967924	967933	0 %	40 %	40 %	20 %	428309175
595	NC_019738	CTCAA	2	10	968643	968652	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
596	NC_019738	AATCC	2	10	969254	969263	40 %	20 %	0 %	40 %	428309177
597	NC_019738	TTATA	2	10	971836	971845	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_019738	TTGGC	2	10	972520	972529	0 %	40 %	40 %	20 %	428309179
599	NC_019738	TTGGA	2	10	972535	972544	20 %	40 %	40 %	0 %	428309179
600	NC_019738	GTAGA	2	10	975882	975891	40 %	20 %	40 %	0 %	428309182
601	NC_019738	TTGAT	2	10	976150	976159	20 %	60 %	20 %	0 %	428309182
602	NC_019738	GCAAT	2	10	977169	977178	40 %	20 %	20 %	20 %	428309183
603	NC_019738	CCTAT	2	10	977411	977420	20 %	40 %	0 %	40 %	428309183
604	NC_019738	AAGTT	2	10	977849	977858	40 %	40 %	20 %	0 %	428309183
605	NC_019738	TAACA	2	10	978465	978474	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
606	NC_019738	AAAGT	2	10	978725	978734	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
607	NC_019738	GCGCC	2	10	980594	980603	0 %	0 %	40 %	60 %	428309185
608	NC_019738	GATTT	2	10	982136	982145	20 %	60 %	20 %	0 %	428309186
609	NC_019738	AACAA	2	10	982407	982416	80 %	0 %	0 %	20 %	428309186
610	NC_019738	CAGCG	2	10	984328	984337	20 %	0 %	40 %	40 %	428309187
611	NC_019738	AGGCA	2	10	984578	984587	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
612	NC_019738	TAAAA	2	10	984978	984987	80 %	20 %	0 %	0 %	428309188
613	NC_019738	TCACG	2	10	987293	987302	20 %	20 %	20 %	40 %	428309192
614	NC_019738	AAGGC	2	10	988653	988662	40 %	0 %	40 %	20 %	428309194
615	NC_019738	TCGGG	2	10	990497	990506	0 %	20 %	60 %	20 %	428309195
616	NC_019738	TTCCG	2	10	991907	991916	0 %	40 %	20 %	40 %	428309196
617	NC_019738	CAGCT	2	10	992416	992425	20 %	20 %	20 %	40 %	428309196
618	NC_019738	GTTGC	2	10	994867	994876	0 %	40 %	40 %	20 %	428309198
619	NC_019738	AGGAG	2	10	996503	996512	40 %	0 %	60 %	0 %	428309198
620	NC_019738	AATTC	2	10	996904	996913	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
621	NC_019738	CGACT	2	10	997308	997317	20 %	20 %	20 %	40 %	428309199
622	NC_019738	TGCGG	2	10	999249	999258	0 %	20 %	60 %	20 %	428309201
623	NC_019738	CTTCG	2	10	999974	999983	0 %	40 %	20 %	40 %	428309202
624	NC_019738	TCTTA	2	10	1001103	1001112	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
625	NC_019738	TAATG	2	10	1004664	1004673	40 %	40 %	20 %	0 %	428309206
626	NC_019738	AAAAG	2	10	1007236	1007245	80 %	0 %	20 %	0 %	428309209
627	NC_019738	TTGTT	2	10	1008174	1008183	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
628	NC_019738	CTGAG	2	10	1009479	1009488	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
629	NC_019738	ATGAC	2	10	1009736	1009745	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
630	NC_019738	CATTC	2	10	1010298	1010307	20 %	40 %	0 %	40 %	428309213
631	NC_019738	ATTGA	2	10	1013998	1014007	40 %	40 %	20 %	0 %	428309214
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