MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 4961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019738	ATGGC	2	10	2266549	2266558	20 %	20 %	40 %	20 %	428310217
1502	NC_019738	CTGTC	2	10	2267266	2267275	0 %	40 %	20 %	40 %	428310217
1503	NC_019738	TAACT	2	10	2268107	2268116	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1504	NC_019738	CCCTT	2	10	2270116	2270125	0 %	40 %	0 %	60 %	428310219
1505	NC_019738	GCTCT	2	10	2271009	2271018	0 %	40 %	20 %	40 %	428310220
1506	NC_019738	TGCTC	2	10	2271050	2271059	0 %	40 %	20 %	40 %	428310220
1507	NC_019738	CAACT	2	10	2271151	2271160	40 %	20 %	0 %	40 %	428310220
1508	NC_019738	GGTTG	2	10	2271840	2271849	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_019738	ACTCA	2	10	2272643	2272652	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1510	NC_019738	TGATT	2	10	2274163	2274172	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_019738	CTATT	2	10	2274180	2274189	20 %	60 %	0 %	20 %	428310222
1512	NC_019738	TTCAG	2	10	2276608	2276617	20 %	40 %	20 %	20 %	428310222
1513	NC_019738	TTCTC	2	10	2278178	2278187	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1514	NC_019738	TAGTC	2	10	2279411	2279420	20 %	40 %	20 %	20 %	428310223
1515	NC_019738	CACCT	2	10	2280054	2280063	20 %	20 %	0 %	60 %	428310224
1516	NC_019738	CATGC	2	10	2281166	2281175	20 %	20 %	20 %	40 %	428310225
1517	NC_019738	AGGTG	2	10	2282709	2282718	20 %	20 %	60 %	0 %	428310226
1518	NC_019738	TACCG	2	10	2283007	2283016	20 %	20 %	20 %	40 %	428310226
1519	NC_019738	TTCAA	2	10	2284830	2284839	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1520	NC_019738	TTGCA	2	10	2285118	2285127	20 %	40 %	20 %	20 %	428310228
1521	NC_019738	CAGGT	2	10	2286636	2286645	20 %	20 %	40 %	20 %	428310230
1522	NC_019738	ACTGA	3	15	2287089	2287103	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1523	NC_019738	AATGG	2	10	2287828	2287837	40 %	20 %	40 %	0 %	428310231
1524	NC_019738	AACTC	2	10	2290108	2290117	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1525	NC_019738	CCAGT	2	10	2291560	2291569	20 %	20 %	20 %	40 %	428310234
1526	NC_019738	GGCTT	2	10	2291870	2291879	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1527	NC_019738	TGCCT	2	10	2292757	2292766	0 %	40 %	20 %	40 %	428310236
1528	NC_019738	TGCCT	2	10	2292997	2293006	0 %	40 %	20 %	40 %	428310236
1529	NC_019738	TGCCT	2	10	2293237	2293246	0 %	40 %	20 %	40 %	428310236
1530	NC_019738	TGCCT	2	10	2293357	2293366	0 %	40 %	20 %	40 %	428310236
1531	NC_019738	TGCCT	2	10	2293477	2293486	0 %	40 %	20 %	40 %	428310236
1532	NC_019738	TGCCT	2	10	2293597	2293606	0 %	40 %	20 %	40 %	428310236
1533	NC_019738	CTCAC	2	10	2293784	2293793	20 %	20 %	0 %	60 %	428310236
1534	NC_019738	TTTTC	2	10	2294424	2294433	0 %	80 %	0 %	20 %	428310236
1535	NC_019738	TTACC	2	10	2295270	2295279	20 %	40 %	0 %	40 %	428310236
1536	NC_019738	CCCAA	2	10	2295534	2295543	40 %	0 %	0 %	60 %	428310236
1537	NC_019738	AAACA	2	10	2295943	2295952	80 %	0 %	0 %	20 %	428310236
1538	NC_019738	CACGT	2	10	2298145	2298154	20 %	20 %	20 %	40 %	428310238
1539	NC_019738	CTGTT	2	10	2298606	2298615	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1540	NC_019738	CCACG	2	10	2300626	2300635	20 %	0 %	20 %	60 %	428310241
1541	NC_019738	AGTGA	2	10	2301083	2301092	40 %	20 %	40 %	0 %	428310242
1542	NC_019738	GGTAT	2	10	2303226	2303235	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_019738	CGCCA	2	10	2304553	2304562	20 %	0 %	20 %	60 %	428310246
1544	NC_019738	CCTTC	2	10	2304593	2304602	0 %	40 %	0 %	60 %	428310246
1545	NC_019738	CAGAA	2	10	2305314	2305323	60 %	0 %	20 %	20 %	428310247
1546	NC_019738	TGATT	2	10	2306348	2306357	20 %	60 %	20 %	0 %	428310248
1547	NC_019738	TTTTA	2	10	2306507	2306516	20 %	80 %	0 %	0 %	428310248
1548	NC_019738	AGTTA	2	10	2308176	2308185	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_019738	CAAGG	2	10	2312688	2312697	40 %	0 %	40 %	20 %	428310253
1550	NC_019738	TTTTG	2	10	2312778	2312787	0 %	80 %	20 %	0 %	428310253
1551	NC_019738	TATCT	2	10	2314814	2314823	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1552	NC_019738	GGAAA	2	10	2316250	2316259	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_019738	CTTTT	2	10	2318875	2318884	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1554	NC_019738	CCCTT	2	10	2318898	2318907	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1555	NC_019738	TTCAA	2	10	2318932	2318941	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1556	NC_019738	GCTTG	2	10	2319137	2319146	0 %	40 %	40 %	20 %	428310261
1557	NC_019738	TGCTG	2	10	2320999	2321008	0 %	40 %	40 %	20 %	428310264
1558	NC_019738	TCGCT	2	10	2326225	2326234	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1559	NC_019738	ATAGA	2	10	2328495	2328504	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_019738	GCCCA	2	10	2331774	2331783	20 %	0 %	20 %	60 %	428310274
1561	NC_019738	CTTCA	2	10	2335399	2335408	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1562	NC_019738	GAAAA	2	10	2335745	2335754	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_019738	TAGCT	2	10	2337298	2337307	20 %	40 %	20 %	20 %	428310279
1564	NC_019738	TGGCG	2	10	2337629	2337638	0 %	20 %	60 %	20 %	428310279
1565	NC_019738	CTTTG	2	10	2337673	2337682	0 %	60 %	20 %	20 %	428310279
1566	NC_019738	ATGTG	2	10	2337837	2337846	20 %	40 %	40 %	0 %	428310279
1567	NC_019738	AAGCT	2	10	2340126	2340135	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1568	NC_019738	AGGCA	2	10	2341276	2341285	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1569	NC_019738	AATCC	2	10	2341598	2341607	40 %	20 %	0 %	40 %	428310283
1570	NC_019738	TTGCC	2	10	2342391	2342400	0 %	40 %	20 %	40 %	428310283
1571	NC_019738	CCCCT	2	10	2343773	2343782	0 %	20 %	0 %	80 %	428310283
1572	NC_019738	GGACT	2	10	2346069	2346078	20 %	20 %	40 %	20 %	428310284
1573	NC_019738	GCTCA	2	10	2346702	2346711	20 %	20 %	20 %	40 %	428310284
1574	NC_019738	GACGC	2	10	2347191	2347200	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1575	NC_019738	TTGGT	2	10	2348795	2348804	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_019738	AACCC	2	10	2350224	2350233	40 %	0 %	0 %	60 %	428310287
1577	NC_019738	GCAGG	2	10	2352958	2352967	20 %	0 %	60 %	20 %	428310290
1578	NC_019738	ACCCT	2	10	2353797	2353806	20 %	20 %	0 %	60 %	428310291
1579	NC_019738	ATTTG	2	10	2356417	2356426	20 %	60 %	20 %	0 %	428310293
1580	NC_019738	TGATC	2	10	2357940	2357949	20 %	40 %	20 %	20 %	428310297
1581	NC_019738	GGTTA	2	10	2360112	2360121	20 %	40 %	40 %	0 %	428310298
1582	NC_019738	GTTTG	2	10	2360872	2360881	0 %	60 %	40 %	0 %	428310298
1583	NC_019738	GCGTC	2	10	2363683	2363692	0 %	20 %	40 %	40 %	428310298
1584	NC_019738	GCTGA	2	10	2363807	2363816	20 %	20 %	40 %	20 %	428310298
1585	NC_019738	CGGAT	2	10	2363937	2363946	20 %	20 %	40 %	20 %	428310298
1586	NC_019738	GGATG	2	10	2364558	2364567	20 %	20 %	60 %	0 %	428310299
1587	NC_019738	CTTTT	2	10	2365322	2365331	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1588	NC_019738	ACTTT	2	10	2367365	2367374	20 %	60 %	0 %	20 %	428310303
1589	NC_019738	CACCC	2	10	2367579	2367588	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1590	NC_019738	GCAGA	2	10	2370915	2370924	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1591	NC_019738	ATAAA	2	10	2374622	2374631	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_019738	AACGG	2	10	2378380	2378389	40 %	0 %	40 %	20 %	428310316
1593	NC_019738	ACCCG	2	10	2378641	2378650	20 %	0 %	20 %	60 %	428310317
1594	NC_019738	TGGGC	2	10	2378666	2378675	0 %	20 %	60 %	20 %	428310317
1595	NC_019738	TCACC	2	10	2379062	2379071	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1596	NC_019738	TCACC	2	10	2379495	2379504	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1597	NC_019738	TCACC	2	10	2380551	2380560	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1598	NC_019738	GAACT	2	10	2381571	2381580	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1599	NC_019738	GAACA	2	10	2381989	2381998	60 %	0 %	20 %	20 %	428310323
1600	NC_019738	TCAAT	2	10	2384037	2384046	40 %	40 %	0 %	20 %	428310326
1601	NC_019738	CACGG	2	10	2386005	2386014	20 %	0 %	40 %	40 %	428310328
1602	NC_019738	CTGGA	2	10	2390402	2390411	20 %	20 %	40 %	20 %	428310333
1603	NC_019738	GAGCG	2	10	2390952	2390961	20 %	0 %	60 %	20 %	428310333
1604	NC_019738	ATGAA	2	10	2392806	2392815	60 %	20 %	20 %	0 %	428310334
1605	NC_019738	CACAC	3	15	2392862	2392876	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1606	NC_019738	TATCA	2	10	2392903	2392912	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1607	NC_019738	CCCTC	2	10	2393148	2393157	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1608	NC_019738	TCAAC	2	10	2393223	2393232	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1609	NC_019738	ATCGA	2	10	2394577	2394586	40 %	20 %	20 %	20 %	428310337
1610	NC_019738	AGCAC	2	10	2395766	2395775	40 %	0 %	20 %	40 %	428310339
1611	NC_019738	TGTAT	2	10	2396259	2396268	20 %	60 %	20 %	0 %	428310339
1612	NC_019738	CGACG	2	10	2399255	2399264	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1613	NC_019738	TCGCC	2	10	2400329	2400338	0 %	20 %	20 %	60 %	428310344
1614	NC_019738	CTTCC	2	10	2400538	2400547	0 %	40 %	0 %	60 %	428310345
1615	NC_019738	CTGCC	2	10	2407748	2407757	0 %	20 %	20 %	60 %	428310353
1616	NC_019738	GCAAA	2	10	2408740	2408749	60 %	0 %	20 %	20 %	428310356
1617	NC_019738	AACTC	2	10	2413697	2413706	40 %	20 %	0 %	40 %	428310359
1618	NC_019738	AAGGG	2	10	2419678	2419687	40 %	0 %	60 %	0 %	428310365
1619	NC_019738	AGGGG	2	10	2419713	2419722	20 %	0 %	80 %	0 %	428310365
1620	NC_019738	GGGGA	2	10	2420265	2420274	20 %	0 %	80 %	0 %	428310365
1621	NC_019738	CAAGC	2	10	2421331	2421340	40 %	0 %	20 %	40 %	428310366
1622	NC_019738	CAACC	2	10	2421954	2421963	40 %	0 %	0 %	60 %	428310366
1623	NC_019738	GAATG	2	10	2422432	2422441	40 %	20 %	40 %	0 %	428310366
1624	NC_019738	TCAAG	2	10	2423688	2423697	40 %	20 %	20 %	20 %	428310366
1625	NC_019738	CAACT	2	10	2424134	2424143	40 %	20 %	0 %	40 %	428310366
1626	NC_019738	CAAAT	2	10	2424643	2424652	60 %	20 %	0 %	20 %	428310368
1627	NC_019738	TTGGG	2	10	2424858	2424867	0 %	40 %	60 %	0 %	428310368
1628	NC_019738	CTCAC	2	10	2425922	2425931	20 %	20 %	0 %	60 %	428310369
1629	NC_019738	TTGAG	2	10	2428074	2428083	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_019738	TCTTA	2	10	2428337	2428346	20 %	60 %	0 %	20 %	428310374
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1640	NC_019738	CTGAA	2	10	2443640	2443649	40 %	20 %	20 %	20 %	428310384
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1643	NC_019738	TCTGA	2	10	2451649	2451658	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1644	NC_019738	ATTTT	2	10	2452296	2452305	20 %	80 %	0 %	0 %	428310390
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