MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 4961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019738	GATGT	2	10	1566129	1566138	20 %	40 %	40 %	0 %	428309681
1002	NC_019738	TTCAG	2	10	1566402	1566411	20 %	40 %	20 %	20 %	428309681
1003	NC_019738	TAGTG	2	10	1567103	1567112	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_019738	GCTGC	2	10	1571231	1571240	0 %	20 %	40 %	40 %	428309683
1005	NC_019738	ATTGA	2	10	1572431	1572440	40 %	40 %	20 %	0 %	428309685
1006	NC_019738	TGAAA	2	10	1573199	1573208	60 %	20 %	20 %	0 %	428309685
1007	NC_019738	CGATT	2	10	1573865	1573874	20 %	40 %	20 %	20 %	428309686
1008	NC_019738	TCGGA	2	10	1574502	1574511	20 %	20 %	40 %	20 %	428309686
1009	NC_019738	AAATT	2	10	1582005	1582014	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_019738	CCCAG	2	10	1582025	1582034	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1011	NC_019738	TGGGT	2	10	1582580	1582589	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_019738	TGGGA	2	10	1584372	1584381	20 %	20 %	60 %	0 %	428309694
1013	NC_019738	ATAAA	2	10	1586510	1586519	80 %	20 %	0 %	0 %	428309697
1014	NC_019738	CATCT	2	10	1586578	1586587	20 %	40 %	0 %	40 %	428309697
1015	NC_019738	CTTGG	2	10	1587297	1587306	0 %	40 %	40 %	20 %	428309698
1016	NC_019738	CAGCT	2	10	1588633	1588642	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1017	NC_019738	ATATC	2	10	1589482	1589491	40 %	40 %	0 %	20 %	428309700
1018	NC_019738	TAGTC	2	10	1590716	1590725	20 %	40 %	20 %	20 %	428309701
1019	NC_019738	AATCA	2	10	1591409	1591418	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1020	NC_019738	TGTAC	2	10	1591529	1591538	20 %	40 %	20 %	20 %	428309702
1021	NC_019738	CTCAA	2	10	1594064	1594073	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1022	NC_019738	TTGCA	2	10	1595026	1595035	20 %	40 %	20 %	20 %	428309704
1023	NC_019738	AACCT	2	10	1595188	1595197	40 %	20 %	0 %	40 %	428309704
1024	NC_019738	TGCGT	2	10	1600015	1600024	0 %	40 %	40 %	20 %	428309706
1025	NC_019738	CTCAG	2	10	1601355	1601364	20 %	20 %	20 %	40 %	428309706
1026	NC_019738	GACTG	2	10	1603566	1603575	20 %	20 %	40 %	20 %	428309707
1027	NC_019738	TCAAA	2	10	1604470	1604479	60 %	20 %	0 %	20 %	428309707
1028	NC_019738	TGCAA	2	10	1607074	1607083	40 %	20 %	20 %	20 %	428309708
1029	NC_019738	TTTTG	2	10	1609381	1609390	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_019738	CCAAT	2	10	1610622	1610631	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1031	NC_019738	GAGCT	2	10	1610643	1610652	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1032	NC_019738	CAAGG	2	10	1611287	1611296	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1033	NC_019738	TCTTA	2	10	1612060	1612069	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1034	NC_019738	CTTGA	2	10	1613094	1613103	20 %	40 %	20 %	20 %	428309712
1035	NC_019738	CAAAA	2	10	1613609	1613618	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1036	NC_019738	TTTGG	2	10	1614714	1614723	0 %	60 %	40 %	0 %	428309714
1037	NC_019738	AGGGC	2	10	1615975	1615984	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1038	NC_019738	TCACA	2	10	1616287	1616296	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1039	NC_019738	TTTAG	2	10	1616300	1616309	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_019738	TCGTT	2	10	1616533	1616542	0 %	60 %	20 %	20 %	428309717
1041	NC_019738	TCCGA	2	10	1617812	1617821	20 %	20 %	20 %	40 %	428309718
1042	NC_019738	GTCAA	2	10	1617962	1617971	40 %	20 %	20 %	20 %	428309718
1043	NC_019738	GTCTC	2	10	1622549	1622558	0 %	40 %	20 %	40 %	428309720
1044	NC_019738	TTCTG	2	10	1622716	1622725	0 %	60 %	20 %	20 %	428309720
1045	NC_019738	TTGTC	2	10	1623069	1623078	0 %	60 %	20 %	20 %	428309720
1046	NC_019738	GGACT	2	10	1623420	1623429	20 %	20 %	40 %	20 %	428309720
1047	NC_019738	GTAAG	2	10	1624430	1624439	40 %	20 %	40 %	0 %	428309721
1048	NC_019738	AGGCA	2	10	1626685	1626694	40 %	0 %	40 %	20 %	428309723
1049	NC_019738	AGTGC	2	10	1626971	1626980	20 %	20 %	40 %	20 %	428309723
1050	NC_019738	AGGCA	2	10	1628569	1628578	40 %	0 %	40 %	20 %	428309725
1051	NC_019738	ACGGA	2	10	1629170	1629179	40 %	0 %	40 %	20 %	428309725
1052	NC_019738	TTGGG	2	10	1629503	1629512	0 %	40 %	60 %	0 %	428309725
1053	NC_019738	CCACT	2	10	1634273	1634282	20 %	20 %	0 %	60 %	428309731
1054	NC_019738	CATCC	2	10	1635025	1635034	20 %	20 %	0 %	60 %	428309731
1055	NC_019738	AATTC	2	10	1635548	1635557	40 %	40 %	0 %	20 %	428309732
1056	NC_019738	CGTCC	2	10	1637426	1637435	0 %	20 %	20 %	60 %	428309733
1057	NC_019738	GGGGT	2	10	1639343	1639352	0 %	20 %	80 %	0 %	428309733
1058	NC_019738	CGACA	2	10	1640158	1640167	40 %	0 %	20 %	40 %	428309733
1059	NC_019738	GCGCT	2	10	1646240	1646249	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1060	NC_019738	ACTCA	2	10	1648003	1648012	40 %	20 %	0 %	40 %	428309740
1061	NC_019738	TCAAC	2	10	1648243	1648252	40 %	20 %	0 %	40 %	428309740
1062	NC_019738	CAATC	2	10	1648801	1648810	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1063	NC_019738	CTACA	2	10	1649006	1649015	40 %	20 %	0 %	40 %	428309741
1064	NC_019738	GCTTG	2	10	1649375	1649384	0 %	40 %	40 %	20 %	428309742
1065	NC_019738	GAGCT	2	10	1651152	1651161	20 %	20 %	40 %	20 %	428309743
1066	NC_019738	CAGTA	2	10	1656288	1656297	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1067	NC_019738	AGTTC	2	10	1657617	1657626	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1068	NC_019738	AGCCC	2	10	1658437	1658446	20 %	0 %	20 %	60 %	428309750
1069	NC_019738	CAAGC	2	10	1658648	1658657	40 %	0 %	20 %	40 %	428309750
1070	NC_019738	ATCCC	2	10	1658799	1658808	20 %	20 %	0 %	60 %	428309750
1071	NC_019738	CCGCT	2	10	1659569	1659578	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1072	NC_019738	AACCG	2	10	1659929	1659938	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1073	NC_019738	CGCCT	2	10	1660070	1660079	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1074	NC_019738	CGCCC	2	10	1660482	1660491	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1075	NC_019738	CGGCG	2	10	1661510	1661519	0 %	0 %	60 %	40 %	428309751
1076	NC_019738	TTGGC	2	10	1661614	1661623	0 %	40 %	40 %	20 %	428309751
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1079	NC_019738	TCAGT	2	10	1663629	1663638	20 %	40 %	20 %	20 %	428309752
1080	NC_019738	TTTGT	2	10	1663824	1663833	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_019738	CTTCT	2	10	1664315	1664324	0 %	60 %	0 %	40 %	428309753
1082	NC_019738	TCAGG	2	10	1664805	1664814	20 %	20 %	40 %	20 %	428309753
1083	NC_019738	TTCCA	2	10	1665098	1665107	20 %	40 %	0 %	40 %	428309753
1084	NC_019738	CCCAA	2	10	1665441	1665450	40 %	0 %	0 %	60 %	428309753
1085	NC_019738	CCAAC	2	10	1669199	1669208	40 %	0 %	0 %	60 %	428309758
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1087	NC_019738	ACAAT	2	10	1676147	1676156	60 %	20 %	0 %	20 %	428309761
1088	NC_019738	CCAAG	2	10	1677195	1677204	40 %	0 %	20 %	40 %	428309762
1089	NC_019738	TATTT	2	10	1677307	1677316	20 %	80 %	0 %	0 %	428309762
1090	NC_019738	ATTAG	2	10	1677821	1677830	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_019738	TGACG	2	10	1678817	1678826	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1092	NC_019738	ACTTA	2	10	1680472	1680481	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1093	NC_019738	GAAAG	2	10	1682574	1682583	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_019738	CATGA	2	10	1683417	1683426	40 %	20 %	20 %	20 %	428309767
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1096	NC_019738	GAGTT	2	10	1685614	1685623	20 %	40 %	40 %	0 %	428309768
1097	NC_019738	TCAAG	2	10	1688694	1688703	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1098	NC_019738	GCGTC	2	10	1689260	1689269	0 %	20 %	40 %	40 %	428309770
1099	NC_019738	GACAA	2	10	1690388	1690397	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1100	NC_019738	GTGCT	2	10	1697420	1697429	0 %	40 %	40 %	20 %	428309779
1101	NC_019738	GAAGA	2	10	1697473	1697482	60 %	0 %	40 %	0 %	428309779
1102	NC_019738	CTACT	2	10	1698692	1698701	20 %	40 %	0 %	40 %	428309782
1103	NC_019738	TTGGG	2	10	1704452	1704461	0 %	40 %	60 %	0 %	428309785
1104	NC_019738	TTTAA	2	10	1705423	1705432	40 %	60 %	0 %	0 %	428309785
1105	NC_019738	TTGAC	2	10	1707374	1707383	20 %	40 %	20 %	20 %	428309785
1106	NC_019738	ATGTG	2	10	1712225	1712234	20 %	40 %	40 %	0 %	428309787
1107	NC_019738	TACAA	2	10	1712723	1712732	60 %	20 %	0 %	20 %	428309787
1108	NC_019738	CGCCT	2	10	1714393	1714402	0 %	20 %	20 %	60 %	428309787
1109	NC_019738	CAGCC	2	10	1714938	1714947	20 %	0 %	20 %	60 %	428309788
1110	NC_019738	AATTT	2	10	1715127	1715136	40 %	60 %	0 %	0 %	428309788
1111	NC_019738	CAACC	2	10	1715214	1715223	40 %	0 %	0 %	60 %	428309788
1112	NC_019738	GTGGG	2	10	1715380	1715389	0 %	20 %	80 %	0 %	428309788
1113	NC_019738	AATTT	2	10	1715804	1715813	40 %	60 %	0 %	0 %	428309788
1114	NC_019738	ACCCC	2	10	1718966	1718975	20 %	0 %	0 %	80 %	428309789
1115	NC_019738	CAACC	2	10	1719423	1719432	40 %	0 %	0 %	60 %	428309789
1116	NC_019738	CCAGT	2	10	1721807	1721816	20 %	20 %	20 %	40 %	428309790
1117	NC_019738	CCTCT	2	10	1722680	1722689	0 %	40 %	0 %	60 %	428309790
1118	NC_019738	GAAAG	2	10	1722884	1722893	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_019738	GGAGG	2	10	1723413	1723422	20 %	0 %	80 %	0 %	428309791
1120	NC_019738	TGAGC	2	10	1727424	1727433	20 %	20 %	40 %	20 %	428309793
1121	NC_019738	CTCTC	2	10	1727936	1727945	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1122	NC_019738	AGTAA	2	10	1728826	1728835	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_019738	AGGGG	2	10	1730669	1730678	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_019738	CCGAA	2	10	1732654	1732663	40 %	0 %	20 %	40 %	428309797
1125	NC_019738	AGGCG	2	10	1732675	1732684	20 %	0 %	60 %	20 %	428309797
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