MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 4961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019738	CGAAG	2	10	4487595	4487604	40 %	0 %	40 %	20 %	428312016
3002	NC_019738	GGTGA	2	10	4487657	4487666	20 %	20 %	60 %	0 %	428312016
3003	NC_019738	AGCTG	2	10	4488310	4488319	20 %	20 %	40 %	20 %	428312016
3004	NC_019738	AAAAT	2	10	4489112	4489121	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_019738	TCAGT	2	10	4489604	4489613	20 %	40 %	20 %	20 %	428312017
3006	NC_019738	CCCCA	2	10	4491584	4491593	20 %	0 %	0 %	80 %	428312019
3007	NC_019738	TGGCA	2	10	4494147	4494156	20 %	20 %	40 %	20 %	428312023
3008	NC_019738	CAAGC	2	10	4496099	4496108	40 %	0 %	20 %	40 %	428312024
3009	NC_019738	TCCTA	2	10	4496594	4496603	20 %	40 %	0 %	40 %	428312024
3010	NC_019738	TTTCT	2	10	4497677	4497686	0 %	80 %	0 %	20 %	428312025
3011	NC_019738	TAACC	2	10	4500591	4500600	40 %	20 %	0 %	40 %	428312028
3012	NC_019738	TCCCA	2	10	4501846	4501855	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3013	NC_019738	AGGCG	2	10	4502390	4502399	20 %	0 %	60 %	20 %	428312030
3014	NC_019738	AGCAA	2	10	4502823	4502832	60 %	0 %	20 %	20 %	428312031
3015	NC_019738	AGATC	2	10	4508673	4508682	40 %	20 %	20 %	20 %	428312036
3016	NC_019738	CTTTT	2	10	4510735	4510744	0 %	80 %	0 %	20 %	428312038
3017	NC_019738	CGACT	2	10	4511932	4511941	20 %	20 %	20 %	40 %	428312038
3018	NC_019738	GTTCG	2	10	4514314	4514323	0 %	40 %	40 %	20 %	428312039
3019	NC_019738	TTTGT	2	10	4517709	4517718	0 %	80 %	20 %	0 %	428312040
3020	NC_019738	AACTG	2	10	4518303	4518312	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3021	NC_019738	GCTTC	2	10	4520332	4520341	0 %	40 %	20 %	40 %	428312043
3022	NC_019738	GGGTG	2	10	4520836	4520845	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_019738	CTCAT	2	10	4522373	4522382	20 %	40 %	0 %	40 %	428312045
3024	NC_019738	ATTGC	2	10	4523450	4523459	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3025	NC_019738	AGGGT	2	10	4527888	4527897	20 %	20 %	60 %	0 %	428312048
3026	NC_019738	TCCAC	2	10	4529362	4529371	20 %	20 %	0 %	60 %	428312049
3027	NC_019738	GATTT	2	10	4530367	4530376	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_019738	TTGCC	2	10	4532354	4532363	0 %	40 %	20 %	40 %	428312052
3029	NC_019738	TCACC	2	10	4532690	4532699	20 %	20 %	0 %	60 %	428312053
3030	NC_019738	GCCAC	2	10	4532913	4532922	20 %	0 %	20 %	60 %	428312053
3031	NC_019738	ATAAA	2	10	4534970	4534979	80 %	20 %	0 %	0 %	428312054
3032	NC_019738	AGAAA	2	10	4535465	4535474	80 %	0 %	20 %	0 %	428312055
3033	NC_019738	TCCTC	2	10	4544220	4544229	0 %	40 %	0 %	60 %	428312058
3034	NC_019738	AACGA	2	10	4544579	4544588	60 %	0 %	20 %	20 %	428312058
3035	NC_019738	TCAAC	2	10	4548825	4548834	40 %	20 %	0 %	40 %	428312061
3036	NC_019738	AGTAT	2	10	4549388	4549397	40 %	40 %	20 %	0 %	428312061
3037	NC_019738	CATAT	2	10	4549824	4549833	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3038	NC_019738	ACCGC	2	10	4550010	4550019	20 %	0 %	20 %	60 %	428312062
3039	NC_019738	TATTC	2	10	4552408	4552417	20 %	60 %	0 %	20 %	428312064
3040	NC_019738	TCACC	2	10	4553350	4553359	20 %	20 %	0 %	60 %	428312065
3041	NC_019738	CCCCG	2	10	4553690	4553699	0 %	0 %	20 %	80 %	428312065
3042	NC_019738	ACGCT	2	10	4553751	4553760	20 %	20 %	20 %	40 %	428312065
3043	NC_019738	CTTAA	2	10	4555749	4555758	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3044	NC_019738	CAACC	2	10	4556554	4556563	40 %	0 %	0 %	60 %	428312067
3045	NC_019738	TGGGT	2	10	4557030	4557039	0 %	40 %	60 %	0 %	428312067
3046	NC_019738	ATTTA	2	10	4562893	4562902	40 %	60 %	0 %	0 %	428312072
3047	NC_019738	CTGGG	2	10	4564717	4564726	0 %	20 %	60 %	20 %	428312073
3048	NC_019738	GACGG	2	10	4565067	4565076	20 %	0 %	60 %	20 %	428312073
3049	NC_019738	GGCTG	2	10	4567538	4567547	0 %	20 %	60 %	20 %	428312073
3050	NC_019738	TCCCG	2	10	4569273	4569282	0 %	20 %	20 %	60 %	428312073
3051	NC_019738	TTTCC	2	10	4571559	4571568	0 %	60 %	0 %	40 %	428312075
3052	NC_019738	CAAGA	2	10	4572773	4572782	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3053	NC_019738	TATTG	2	10	4573458	4573467	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_019738	GTTCT	2	10	4574687	4574696	0 %	60 %	20 %	20 %	428312078
3055	NC_019738	TGCTC	2	10	4575375	4575384	0 %	40 %	20 %	40 %	428312078
3056	NC_019738	TGTCG	2	10	4575560	4575569	0 %	40 %	40 %	20 %	428312078
3057	NC_019738	CTCAA	2	10	4576200	4576209	40 %	20 %	0 %	40 %	428312078
3058	NC_019738	TAATG	2	10	4578592	4578601	40 %	40 %	20 %	0 %	428312080
3059	NC_019738	CATCA	2	10	4578655	4578664	40 %	20 %	0 %	40 %	428312080
3060	NC_019738	AATAA	2	10	4578715	4578724	80 %	20 %	0 %	0 %	428312080
3061	NC_019738	TTTGC	2	10	4581352	4581361	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3062	NC_019738	TCGGT	2	10	4584067	4584076	0 %	40 %	40 %	20 %	428312085
3063	NC_019738	CAACC	2	10	4584512	4584521	40 %	0 %	0 %	60 %	428312085
3064	NC_019738	GTAGC	2	10	4585131	4585140	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3065	NC_019738	ATGTT	2	10	4586760	4586769	20 %	60 %	20 %	0 %	428312087
3066	NC_019738	TGCCC	2	10	4587229	4587238	0 %	20 %	20 %	60 %	428312087
3067	NC_019738	TCCCC	2	10	4587511	4587520	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3068	NC_019738	GATGT	2	10	4589114	4589123	20 %	40 %	40 %	0 %	428312089
3069	NC_019738	CCAAC	2	10	4591861	4591870	40 %	0 %	0 %	60 %	428312090
3070	NC_019738	AACCT	2	10	4597406	4597415	40 %	20 %	0 %	40 %	428312095
3071	NC_019738	ATCTC	2	10	4599322	4599331	20 %	40 %	0 %	40 %	428312096
3072	NC_019738	CGCAG	2	10	4599518	4599527	20 %	0 %	40 %	40 %	428312096
3073	NC_019738	TGCTA	2	10	4601878	4601887	20 %	40 %	20 %	20 %	428312098
3074	NC_019738	GACGC	2	10	4601905	4601914	20 %	0 %	40 %	40 %	428312098
3075	NC_019738	GGCTT	2	10	4603286	4603295	0 %	40 %	40 %	20 %	428312099
3076	NC_019738	TCACC	2	10	4604252	4604261	20 %	20 %	0 %	60 %	428312100
3077	NC_019738	AGGAC	2	10	4604494	4604503	40 %	0 %	40 %	20 %	428312100
3078	NC_019738	CATCA	2	10	4605452	4605461	40 %	20 %	0 %	40 %	428312101
3079	NC_019738	GCGAC	2	10	4606410	4606419	20 %	0 %	40 %	40 %	428312102
3080	NC_019738	TCCAT	2	10	4607181	4607190	20 %	40 %	0 %	40 %	428312102
3081	NC_019738	AAGTT	2	10	4607920	4607929	40 %	40 %	20 %	0 %	428312102
3082	NC_019738	GTCTT	2	10	4608509	4608518	0 %	60 %	20 %	20 %	428312103
3083	NC_019738	TTGTT	2	10	4609171	4609180	0 %	80 %	20 %	0 %	428312103
3084	NC_019738	ATTAT	2	10	4609538	4609547	40 %	60 %	0 %	0 %	428312104
3085	NC_019738	CGATT	2	10	4612500	4612509	20 %	40 %	20 %	20 %	428312106
3086	NC_019738	CAATT	2	10	4615767	4615776	40 %	40 %	0 %	20 %	428312108
3087	NC_019738	AATCC	2	10	4617243	4617252	40 %	20 %	0 %	40 %	428312109
3088	NC_019738	TCACC	2	10	4617506	4617515	20 %	20 %	0 %	60 %	428312109
3089	NC_019738	TAAAT	2	10	4620344	4620353	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_019738	CCCCT	2	10	4620474	4620483	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3091	NC_019738	ATAGT	2	10	4623009	4623018	40 %	40 %	20 %	0 %	428312113
3092	NC_019738	CTCTG	2	10	4625448	4625457	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3093	NC_019738	TGACT	2	10	4625906	4625915	20 %	40 %	20 %	20 %	428312115
3094	NC_019738	TGACT	2	10	4625966	4625975	20 %	40 %	20 %	20 %	428312115
3095	NC_019738	CCCTT	2	10	4626397	4626406	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3096	NC_019738	GGTTA	2	10	4626424	4626433	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_019738	GAGAT	2	10	4628931	4628940	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_019738	CTTGG	2	10	4629804	4629813	0 %	40 %	40 %	20 %	428312118
3099	NC_019738	CACCT	2	10	4632373	4632382	20 %	20 %	0 %	60 %	428312119
3100	NC_019738	ACCGT	2	10	4633733	4633742	20 %	20 %	20 %	40 %	428312120
3101	NC_019738	TGGTC	2	10	4634819	4634828	0 %	40 %	40 %	20 %	428312121
3102	NC_019738	ATACC	2	10	4635331	4635340	40 %	20 %	0 %	40 %	428312123
3103	NC_019738	GGATG	2	10	4639755	4639764	20 %	20 %	60 %	0 %	428312126
3104	NC_019738	GAGTC	2	10	4640794	4640803	20 %	20 %	40 %	20 %	428312127
3105	NC_019738	TAGGT	2	10	4647035	4647044	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_019738	AGTAA	2	10	4651790	4651799	60 %	20 %	20 %	0 %	428312138
3107	NC_019738	TATTT	2	10	4659263	4659272	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_019738	CGCAT	2	10	4660224	4660233	20 %	20 %	20 %	40 %	428312142
3109	NC_019738	GTAGG	2	10	4660430	4660439	20 %	20 %	60 %	0 %	428312142
3110	NC_019738	ATGAA	2	10	4664848	4664857	60 %	20 %	20 %	0 %	428312144
3111	NC_019738	ATTAA	2	10	4664944	4664953	60 %	40 %	0 %	0 %	428312144
3112	NC_019738	GTTTG	2	10	4665643	4665652	0 %	60 %	40 %	0 %	428312144
3113	NC_019738	AGGGC	2	10	4665695	4665704	20 %	0 %	60 %	20 %	428312144
3114	NC_019738	TGCTC	2	10	4667480	4667489	0 %	40 %	20 %	40 %	428312144
3115	NC_019738	ATTCC	2	10	4667859	4667868	20 %	40 %	0 %	40 %	428312144
3116	NC_019738	AAGGC	2	10	4669819	4669828	40 %	0 %	40 %	20 %	428312145
3117	NC_019738	ACCCC	2	10	4676981	4676990	20 %	0 %	0 %	80 %	428312147
3118	NC_019738	CCCAA	2	10	4677342	4677351	40 %	0 %	0 %	60 %	428312147
3119	NC_019738	CCCAA	2	10	4677366	4677375	40 %	0 %	0 %	60 %	428312147
3120	NC_019738	TCGAT	2	10	4677731	4677740	20 %	40 %	20 %	20 %	428312148
3121	NC_019738	TATTT	2	10	4678921	4678930	20 %	80 %	0 %	0 %	428312149
3122	NC_019738	GTTTG	2	10	4681594	4681603	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_019738	GCTTT	2	10	4681944	4681953	0 %	60 %	20 %	20 %	428312153
3124	NC_019738	GCCTC	2	10	4682333	4682342	0 %	20 %	20 %	60 %	428312154
3125	NC_019738	TCAAC	2	10	4682813	4682822	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3126	NC_019738	TGATT	2	10	4683309	4683318	20 %	60 %	20 %	0 %	428312155
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3240	NC_019738	AACCC	2	10	4881624	4881633	40 %	0 %	0 %	60 %	428312305
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3248	NC_019738	TCTAC	2	10	4889970	4889979	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3249	NC_019738	TGGCT	2	10	4893662	4893671	0 %	40 %	40 %	20 %	428312311
3250	NC_019738	AGTTA	2	10	4897923	4897932	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_019738	AGAGC	2	10	4898210	4898219	40 %	0 %	40 %	20 %	428312313
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