MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 4961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_019738	AGGGG	2	10	2964073	2964082	20 %	0 %	80 %	0 %	428310801
2002	NC_019738	GCAGA	2	10	2966225	2966234	40 %	0 %	40 %	20 %	428310803
2003	NC_019738	TTCCA	2	10	2969289	2969298	20 %	40 %	0 %	40 %	428310807
2004	NC_019738	TTTGG	2	10	2970439	2970448	0 %	60 %	40 %	0 %	428310808
2005	NC_019738	TCGCT	2	10	2970998	2971007	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2006	NC_019738	CTGTG	2	10	2971274	2971283	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2007	NC_019738	GGTAA	2	10	2973647	2973656	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_019738	TACCC	2	10	2974225	2974234	20 %	20 %	0 %	60 %	428310812
2009	NC_019738	CTTAT	2	10	2977756	2977765	20 %	60 %	0 %	20 %	428310817
2010	NC_019738	GTCTT	2	10	2977836	2977845	0 %	60 %	20 %	20 %	428310817
2011	NC_019738	GCGAG	2	10	2979333	2979342	20 %	0 %	60 %	20 %	428310817
2012	NC_019738	CAAAA	2	10	2979899	2979908	80 %	0 %	0 %	20 %	428310817
2013	NC_019738	CGTCA	2	10	2987434	2987443	20 %	20 %	20 %	40 %	428310820
2014	NC_019738	ATTTG	2	10	2989487	2989496	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_019738	GTTTG	2	10	2991529	2991538	0 %	60 %	40 %	0 %	428310823
2016	NC_019738	CAAAA	2	10	2992597	2992606	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2017	NC_019738	TCTTT	2	10	2992665	2992674	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2018	NC_019738	CAAAT	2	10	2994323	2994332	60 %	20 %	0 %	20 %	428310828
2019	NC_019738	TGAAT	2	10	2997326	2997335	40 %	40 %	20 %	0 %	428310830
2020	NC_019738	AGACT	2	10	3001335	3001344	40 %	20 %	20 %	20 %	428310832
2021	NC_019738	AAGAG	2	10	3002231	3002240	60 %	0 %	40 %	0 %	428310833
2022	NC_019738	ATTTG	2	10	3002749	3002758	20 %	60 %	20 %	0 %	428310834
2023	NC_019738	GAGAA	2	10	3004174	3004183	60 %	0 %	40 %	0 %	428310835
2024	NC_019738	CCCAT	2	10	3004624	3004633	20 %	20 %	0 %	60 %	428310836
2025	NC_019738	ACCAA	2	10	3004934	3004943	60 %	0 %	0 %	40 %	428310836
2026	NC_019738	TCAAC	2	10	3006602	3006611	40 %	20 %	0 %	40 %	428310837
2027	NC_019738	GTAGA	2	10	3007020	3007029	40 %	20 %	40 %	0 %	428310837
2028	NC_019738	CTTTA	2	10	3010814	3010823	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2029	NC_019738	TTTGG	2	10	3012338	3012347	0 %	60 %	40 %	0 %	428310840
2030	NC_019738	ATCCC	2	10	3014599	3014608	20 %	20 %	0 %	60 %	428310842
2031	NC_019738	TGGAG	2	10	3016233	3016242	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2032	NC_019738	AATAC	2	10	3024146	3024155	60 %	20 %	0 %	20 %	428310849
2033	NC_019738	GGGGT	2	10	3027396	3027405	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
2034	NC_019738	ATTGT	2	10	3028927	3028936	20 %	60 %	20 %	0 %	428310851
2035	NC_019738	GTAAT	2	10	3030863	3030872	40 %	40 %	20 %	0 %	428310852
2036	NC_019738	GCTCG	2	10	3030921	3030930	0 %	20 %	40 %	40 %	428310852
2037	NC_019738	TGCCT	2	10	3032222	3032231	0 %	40 %	20 %	40 %	428310853
2038	NC_019738	AAGAA	2	10	3033047	3033056	80 %	0 %	20 %	0 %	428310854
2039	NC_019738	GCAAA	2	10	3033555	3033564	60 %	0 %	20 %	20 %	428310854
2040	NC_019738	AGCCA	2	10	3034618	3034627	40 %	0 %	20 %	40 %	428310855
2041	NC_019738	AGCCA	2	10	3037695	3037704	40 %	0 %	20 %	40 %	428310857
2042	NC_019738	CGCGC	2	10	3040448	3040457	0 %	0 %	40 %	60 %	428310860
2043	NC_019738	GCTTA	2	10	3040460	3040469	20 %	40 %	20 %	20 %	428310860
2044	NC_019738	TTACG	2	10	3040787	3040796	20 %	40 %	20 %	20 %	428310860
2045	NC_019738	TTGAA	2	10	3045111	3045120	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2046	NC_019738	GCACA	2	10	3046001	3046010	40 %	0 %	20 %	40 %	428310863
2047	NC_019738	TGCTC	2	10	3046710	3046719	0 %	40 %	20 %	40 %	428310863
2048	NC_019738	TGGGG	2	10	3046807	3046816	0 %	20 %	80 %	0 %	428310863
2049	NC_019738	TTGAA	2	10	3049729	3049738	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2050	NC_019738	GATGC	2	10	3054314	3054323	20 %	20 %	40 %	20 %	428310871
2051	NC_019738	GTGAA	2	10	3055279	3055288	40 %	20 %	40 %	0 %	428310872
2052	NC_019738	GCTAC	2	10	3056386	3056395	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2053	NC_019738	CCTTA	2	10	3056828	3056837	20 %	40 %	0 %	40 %	428310873
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2059	NC_019738	AAGGT	2	10	3071084	3071093	40 %	20 %	40 %	0 %	428310888
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2064	NC_019738	TGGCT	2	10	3078194	3078203	0 %	40 %	40 %	20 %	428310891
2065	NC_019738	CTTGT	2	10	3078718	3078727	0 %	60 %	20 %	20 %	428310891
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2067	NC_019738	TGACC	2	10	3079662	3079671	20 %	20 %	20 %	40 %	428310891
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2097	NC_019738	TTTGG	2	10	3109378	3109387	0 %	60 %	40 %	0 %	428310914
2098	NC_019738	TAGTG	2	10	3110279	3110288	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2099	NC_019738	TTCTT	2	10	3113867	3113876	0 %	80 %	0 %	20 %	428310919
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2110	NC_019738	CTTTT	2	10	3134598	3134607	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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2112	NC_019738	GAAAT	2	10	3135717	3135726	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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2249	NC_019738	CTAAA	2	10	3334388	3334397	60 %	20 %	0 %	20 %	428311089
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