MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 4961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019738	TCTTA	2	10	5984883	5984892	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4002	NC_019738	TCTCC	2	10	5986952	5986961	0 %	40 %	0 %	60 %	428313191
4003	NC_019738	ATGCC	2	10	5987461	5987470	20 %	20 %	20 %	40 %	428313192
4004	NC_019738	AACAT	2	10	5987584	5987593	60 %	20 %	0 %	20 %	428313192
4005	NC_019738	TGGCG	2	10	5990703	5990712	0 %	20 %	60 %	20 %	428313194
4006	NC_019738	ACACA	2	10	5991799	5991808	60 %	0 %	0 %	40 %	428313194
4007	NC_019738	CAATG	2	10	5992907	5992916	40 %	20 %	20 %	20 %	428313195
4008	NC_019738	CGTAA	2	10	5993401	5993410	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4009	NC_019738	AAAGA	2	10	5996818	5996827	80 %	0 %	20 %	0 %	428313199
4010	NC_019738	GCCCC	2	10	5998130	5998139	0 %	0 %	20 %	80 %	428313200
4011	NC_019738	TTGCC	2	10	5998741	5998750	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4012	NC_019738	ACCCA	2	10	5999002	5999011	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4013	NC_019738	CCTCA	2	10	5999362	5999371	20 %	20 %	0 %	60 %	428313201
4014	NC_019738	TGTGC	2	10	6000837	6000846	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4015	NC_019738	CAACA	2	10	6002650	6002659	60 %	0 %	0 %	40 %	428313204
4016	NC_019738	GAGAC	2	10	6004113	6004122	40 %	0 %	40 %	20 %	428313204
4017	NC_019738	GTAAA	2	10	6004608	6004617	60 %	20 %	20 %	0 %	428313204
4018	NC_019738	TCTCA	2	10	6005391	6005400	20 %	40 %	0 %	40 %	428313205
4019	NC_019738	ATGGG	2	10	6005467	6005476	20 %	20 %	60 %	0 %	428313205
4020	NC_019738	ACCCC	2	10	6006813	6006822	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
4021	NC_019738	AGGGG	2	10	6006854	6006863	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_019738	GATTC	2	10	6007174	6007183	20 %	40 %	20 %	20 %	428313207
4023	NC_019738	ATTCA	2	10	6008193	6008202	40 %	40 %	0 %	20 %	428313208
4024	NC_019738	ATCCA	2	10	6011499	6011508	40 %	20 %	0 %	40 %	428313212
4025	NC_019738	TAACT	2	10	6013016	6013025	40 %	40 %	0 %	20 %	428313213
4026	NC_019738	ATCCG	2	10	6013428	6013437	20 %	20 %	20 %	40 %	428313213
4027	NC_019738	CCCAT	2	10	6013810	6013819	20 %	20 %	0 %	60 %	428313213
4028	NC_019738	CAGAT	2	10	6013830	6013839	40 %	20 %	20 %	20 %	428313213
4029	NC_019738	GGATG	2	10	6017632	6017641	20 %	20 %	60 %	0 %	428313215
4030	NC_019738	CGTAT	2	10	6019086	6019095	20 %	40 %	20 %	20 %	428313217
4031	NC_019738	GCTAT	2	10	6020432	6020441	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4032	NC_019738	TCCAC	2	10	6021370	6021379	20 %	20 %	0 %	60 %	428313220
4033	NC_019738	ATGAA	2	10	6021947	6021956	60 %	20 %	20 %	0 %	428313220
4034	NC_019738	GCATG	2	10	6023747	6023756	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4035	NC_019738	GTTGT	2	10	6024629	6024638	0 %	60 %	40 %	0 %	428313223
4036	NC_019738	TGCTC	2	10	6025730	6025739	0 %	40 %	20 %	40 %	428313225
4037	NC_019738	TTAAG	2	10	6027851	6027860	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_019738	TATCC	2	10	6030883	6030892	20 %	40 %	0 %	40 %	428313228
4039	NC_019738	CAATT	2	10	6033849	6033858	40 %	40 %	0 %	20 %	428313231
4040	NC_019738	AAACC	2	10	6034626	6034635	60 %	0 %	0 %	40 %	428313231
4041	NC_019738	TAGTG	2	10	6039684	6039693	20 %	40 %	40 %	0 %	428313234
4042	NC_019738	TTAGC	2	10	6040256	6040265	20 %	40 %	20 %	20 %	428313235
4043	NC_019738	ATGGC	2	10	6042842	6042851	20 %	20 %	40 %	20 %	428313235
4044	NC_019738	ACTCA	2	10	6046561	6046570	40 %	20 %	0 %	40 %	428313237
4045	NC_019738	CGAGT	2	10	6053070	6053079	20 %	20 %	40 %	20 %	428313238
4046	NC_019738	CAACT	2	10	6054462	6054471	40 %	20 %	0 %	40 %	428313240
4047	NC_019738	AAATC	2	10	6057669	6057678	60 %	20 %	0 %	20 %	428313243
4048	NC_019738	CCAAG	2	10	6058212	6058221	40 %	0 %	20 %	40 %	428313243
4049	NC_019738	GAAAT	2	10	6060778	6060787	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_019738	CCTTG	2	10	6064185	6064194	0 %	40 %	20 %	40 %	428313249
4051	NC_019738	TAGCG	2	10	6066830	6066839	20 %	20 %	40 %	20 %	428313253
4052	NC_019738	AAATG	2	10	6067167	6067176	60 %	20 %	20 %	0 %	428313253
4053	NC_019738	ATTTA	2	10	6067851	6067860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_019738	TTATG	2	10	6068638	6068647	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_019738	CAGTT	2	10	6070461	6070470	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4056	NC_019738	TTTTG	2	10	6072551	6072560	0 %	80 %	20 %	0 %	428313260
4057	NC_019738	TGATG	2	10	6073839	6073848	20 %	40 %	40 %	0 %	428313261
4058	NC_019738	TTGTG	2	10	6074668	6074677	0 %	60 %	40 %	0 %	428313262
4059	NC_019738	ACGCC	2	10	6076667	6076676	20 %	0 %	20 %	60 %	428313264
4060	NC_019738	CTCGT	2	10	6077250	6077259	0 %	40 %	20 %	40 %	428313264
4061	NC_019738	TAACT	2	10	6082392	6082401	40 %	40 %	0 %	20 %	428313268
4062	NC_019738	TCATC	2	10	6082955	6082964	20 %	40 %	0 %	40 %	428313268
4063	NC_019738	GTTTA	2	10	6084143	6084152	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_019738	ATAGA	2	10	6085114	6085123	60 %	20 %	20 %	0 %	428313270
4065	NC_019738	AATTT	2	10	6085214	6085223	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_019738	CTGAA	2	10	6085763	6085772	40 %	20 %	20 %	20 %	428313271
4067	NC_019738	CAACC	2	10	6085898	6085907	40 %	0 %	0 %	60 %	428313271
4068	NC_019738	GATGA	2	10	6087984	6087993	40 %	20 %	40 %	0 %	428313272
4069	NC_019738	CCACG	2	10	6090573	6090582	20 %	0 %	20 %	60 %	428313278
4070	NC_019738	CCAAC	2	10	6090768	6090777	40 %	0 %	0 %	60 %	428313278
4071	NC_019738	CGTCA	2	10	6092185	6092194	20 %	20 %	20 %	40 %	428313280
4072	NC_019738	CATTT	2	10	6092413	6092422	20 %	60 %	0 %	20 %	428313280
4073	NC_019738	TTGAG	2	10	6097156	6097165	20 %	40 %	40 %	0 %	428313285
4074	NC_019738	ACAGC	2	10	6100878	6100887	40 %	0 %	20 %	40 %	428313288
4075	NC_019738	ACTCC	2	10	6102512	6102521	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4076	NC_019738	ACAAA	2	10	6103464	6103473	80 %	0 %	0 %	20 %	428313289
4077	NC_019738	TTCGC	2	10	6106085	6106094	0 %	40 %	20 %	40 %	428313290
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4079	NC_019738	ACTCC	2	10	6109940	6109949	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4080	NC_019738	ACACC	2	10	6111394	6111403	40 %	0 %	0 %	60 %	428313294
4081	NC_019738	CCCAC	2	10	6111798	6111807	20 %	0 %	0 %	80 %	428313294
4082	NC_019738	AACAC	2	10	6112094	6112103	60 %	0 %	0 %	40 %	428313295
4083	NC_019738	GGTGA	2	10	6112225	6112234	20 %	20 %	60 %	0 %	428313295
4084	NC_019738	CTTTC	2	10	6114003	6114012	0 %	60 %	0 %	40 %	428313296
4085	NC_019738	GCGAA	2	10	6114313	6114322	40 %	0 %	40 %	20 %	428313296
4086	NC_019738	TGCGT	2	10	6114842	6114851	0 %	40 %	40 %	20 %	428313296
4087	NC_019738	CGATC	2	10	6115516	6115525	20 %	20 %	20 %	40 %	428313297
4088	NC_019738	GAACT	2	10	6119382	6119391	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4089	NC_019738	TAGTA	2	10	6121310	6121319	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_019738	TTTTA	2	10	6121321	6121330	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_019738	CAGAA	2	10	6122873	6122882	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4092	NC_019738	AAGTT	2	10	6124987	6124996	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_019738	ATTAA	2	10	6127122	6127131	60 %	40 %	0 %	0 %	428313308
4094	NC_019738	CCTTG	2	10	6127439	6127448	0 %	40 %	20 %	40 %	428313308
4095	NC_019738	AATCC	2	10	6129853	6129862	40 %	20 %	0 %	40 %	428313310
4096	NC_019738	CTCAA	2	10	6130042	6130051	40 %	20 %	0 %	40 %	428313310
4097	NC_019738	ATTCA	2	10	6133240	6133249	40 %	40 %	0 %	20 %	428313312
4098	NC_019738	ACGGG	2	10	6135145	6135154	20 %	0 %	60 %	20 %	428313312
4099	NC_019738	ATCAG	2	10	6135681	6135690	40 %	20 %	20 %	20 %	428313312
4100	NC_019738	ATCGC	2	10	6138872	6138881	20 %	20 %	20 %	40 %	428313313
4101	NC_019738	TGAGG	2	10	6139997	6140006	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_019738	GTCCT	2	10	6142399	6142408	0 %	40 %	20 %	40 %	428313317
4103	NC_019738	TAGCG	2	10	6143225	6143234	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4104	NC_019738	AGTCC	2	10	6144896	6144905	20 %	20 %	20 %	40 %	428313320
4105	NC_019738	AGACC	2	10	6145898	6145907	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4106	NC_019738	CCAGC	2	10	6147200	6147209	20 %	0 %	20 %	60 %	428313322
4107	NC_019738	TTCAC	2	10	6148618	6148627	20 %	40 %	0 %	40 %	428313323
4108	NC_019738	GTATT	2	10	6151518	6151527	20 %	60 %	20 %	0 %	428313326
4109	NC_019738	CTTCG	2	10	6155510	6155519	0 %	40 %	20 %	40 %	428313330
4110	NC_019738	GCCAA	2	10	6158829	6158838	40 %	0 %	20 %	40 %	428313333
4111	NC_019738	AAACC	2	10	6159063	6159072	60 %	0 %	0 %	40 %	428313333
4112	NC_019738	GGGTA	2	10	6159248	6159257	20 %	20 %	60 %	0 %	428313333
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4114	NC_019738	CGCGC	2	10	6161386	6161395	0 %	0 %	40 %	60 %	428313335
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4118	NC_019738	GCCTT	2	10	6169084	6169093	0 %	40 %	20 %	40 %	428313342
4119	NC_019738	AAATT	2	10	6169858	6169867	60 %	40 %	0 %	0 %	428313342
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4123	NC_019738	TTGTA	2	10	6172788	6172797	20 %	60 %	20 %	0 %	428313345
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