MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 4961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_019738	GGATT	2	10	3700110	3700119	20 %	40 %	40 %	0 %	428311393
2502	NC_019738	GCGTT	2	10	3701920	3701929	0 %	40 %	40 %	20 %	428311394
2503	NC_019738	TTTGA	2	10	3701978	3701987	20 %	60 %	20 %	0 %	428311394
2504	NC_019738	GATTT	2	10	3703281	3703290	20 %	60 %	20 %	0 %	428311396
2505	NC_019738	AATTC	2	10	3704104	3704113	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2506	NC_019738	TTTGC	2	10	3704920	3704929	0 %	60 %	20 %	20 %	428311397
2507	NC_019738	ATATT	2	10	3704979	3704988	40 %	60 %	0 %	0 %	428311397
2508	NC_019738	TCCCT	2	10	3710632	3710641	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2509	NC_019738	CCTGG	2	10	3713501	3713510	0 %	20 %	40 %	40 %	428311403
2510	NC_019738	AGGGG	2	10	3717032	3717041	20 %	0 %	80 %	0 %	428311406
2511	NC_019738	AGGGG	2	10	3717392	3717401	20 %	0 %	80 %	0 %	428311406
2512	NC_019738	AGGGG	2	10	3717512	3717521	20 %	0 %	80 %	0 %	428311406
2513	NC_019738	GTTCC	2	10	3719565	3719574	0 %	40 %	20 %	40 %	428311406
2514	NC_019738	TACCT	2	10	3720799	3720808	20 %	40 %	0 %	40 %	428311407
2515	NC_019738	AGTTG	2	10	3722169	3722178	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_019738	ATTGA	2	10	3722189	3722198	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_019738	GACGC	2	10	3724720	3724729	20 %	0 %	40 %	40 %	428311411
2518	NC_019738	AGAGC	2	10	3728139	3728148	40 %	0 %	40 %	20 %	428311416
2519	NC_019738	TGTAC	2	10	3732528	3732537	20 %	40 %	20 %	20 %	428311422
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2521	NC_019738	CTTTG	2	10	3734562	3734571	0 %	60 %	20 %	20 %	428311424
2522	NC_019738	TTTCT	2	10	3735806	3735815	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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2529	NC_019738	ATGCC	2	10	3743762	3743771	20 %	20 %	20 %	40 %	428311434
2530	NC_019738	AGGCA	2	10	3747625	3747634	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2531	NC_019738	TCATT	2	10	3747814	3747823	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2532	NC_019738	ATCCG	2	10	3753370	3753379	20 %	20 %	20 %	40 %	428311443
2533	NC_019738	AAGGT	2	10	3753712	3753721	40 %	20 %	40 %	0 %	428311443
2534	NC_019738	GTTTG	2	10	3756278	3756287	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_019738	CCCTT	2	10	3756927	3756936	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2536	NC_019738	CCCCG	2	10	3758376	3758385	0 %	0 %	20 %	80 %	428311447
2537	NC_019738	CCGCC	2	10	3758451	3758460	0 %	0 %	20 %	80 %	428311447
2538	NC_019738	AATTA	2	10	3759588	3759597	60 %	40 %	0 %	0 %	428311449
2539	NC_019738	TGCCC	2	10	3761804	3761813	0 %	20 %	20 %	60 %	428311450
2540	NC_019738	AATCC	2	10	3761904	3761913	40 %	20 %	0 %	40 %	428311450
2541	NC_019738	TGATT	2	10	3762930	3762939	20 %	60 %	20 %	0 %	428311451
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2546	NC_019738	TAACT	2	10	3768810	3768819	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2547	NC_019738	CTTGA	2	10	3775193	3775202	20 %	40 %	20 %	20 %	428311459
2548	NC_019738	CGCTA	2	10	3776629	3776638	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2549	NC_019738	TTAAA	2	10	3776691	3776700	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_019738	CTTGT	2	10	3777886	3777895	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2551	NC_019738	AATTT	2	10	3779246	3779255	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_019738	AATTG	2	10	3782016	3782025	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_019738	GGTTG	2	10	3785481	3785490	0 %	40 %	60 %	0 %	428311467
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2556	NC_019738	CCCAA	2	10	3796239	3796248	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2557	NC_019738	CCCTT	2	10	3797034	3797043	0 %	40 %	0 %	60 %	428311472
2558	NC_019738	AGCCA	2	10	3797585	3797594	40 %	0 %	20 %	40 %	428311472
2559	NC_019738	GTTGC	2	10	3799205	3799214	0 %	40 %	40 %	20 %	428311472
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2563	NC_019738	TTCGG	2	10	3804341	3804350	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2564	NC_019738	TCTTT	2	10	3805432	3805441	0 %	80 %	0 %	20 %	428311476
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2566	NC_019738	CCCTT	2	10	3809826	3809835	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2567	NC_019738	TTCTA	2	10	3810159	3810168	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2568	NC_019738	CTGGA	2	10	3815547	3815556	20 %	20 %	40 %	20 %	428311484
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2570	NC_019738	CTCAT	2	10	3817308	3817317	20 %	40 %	0 %	40 %	428311488
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2573	NC_019738	GTGTC	2	10	3820401	3820410	0 %	40 %	40 %	20 %	428311491
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2575	NC_019738	GTCAG	2	10	3821111	3821120	20 %	20 %	40 %	20 %	428311492
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2577	NC_019738	TTAAG	2	10	3823099	3823108	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_019738	GTTAG	2	10	3823377	3823386	20 %	40 %	40 %	0 %	428311495
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2581	NC_019738	CCCCT	2	10	3826038	3826047	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2582	NC_019738	AGGGG	2	10	3826053	3826062	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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2585	NC_019738	TCAAT	2	10	3828308	3828317	40 %	40 %	0 %	20 %	428311498
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2592	NC_019738	GAATT	2	10	3839016	3839025	40 %	40 %	20 %	0 %	428311504
2593	NC_019738	TAATT	2	10	3845727	3845736	40 %	60 %	0 %	0 %	428311510
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2598	NC_019738	TTGGG	2	10	3852800	3852809	0 %	40 %	60 %	0 %	428311517
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2609	NC_019738	GGACT	2	10	3876743	3876752	20 %	20 %	40 %	20 %	428311533
2610	NC_019738	CTATC	2	10	3877771	3877780	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2611	NC_019738	CCATA	2	10	3878919	3878928	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2612	NC_019738	TTTAC	2	10	3881160	3881169	20 %	60 %	0 %	20 %	428311538
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