MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 41485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015942	GCC	3	9	278308	278316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198491
4002	NC_015942	GTG	3	9	278332	278340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198491
4003	NC_015942	CTG	2	6	278364	278369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198491
4004	NC_015942	CTT	2	6	278393	278398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198491
4005	NC_015942	CGG	2	6	278414	278419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198491
4006	NC_015942	CGG	2	6	278476	278481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198491
4007	NC_015942	CTG	2	6	278526	278531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198491
4008	NC_015942	CGA	2	6	278717	278722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198491
4009	NC_015942	TCA	2	6	278785	278790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198491
4010	NC_015942	TGT	2	6	278845	278850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198491
4011	NC_015942	CTG	2	6	278979	278984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198491
4012	NC_015942	TTG	2	6	279045	279050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198491
4013	NC_015942	TGC	2	6	279137	279142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198491
4014	NC_015942	CTG	2	6	279153	279158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198491
4015	NC_015942	GGC	2	6	279224	279229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198491
4016	NC_015942	TGG	2	6	279382	279387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198491
4017	NC_015942	CAG	2	6	279396	279401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198491
4018	NC_015942	GTA	2	6	279643	279648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198491
4019	NC_015942	TGC	2	6	279715	279720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198491
4020	NC_015942	GTT	2	6	279722	279727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198491
4021	NC_015942	GGC	2	6	279797	279802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198491
4022	NC_015942	CTG	2	6	279925	279930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198492
4023	NC_015942	TGG	3	9	279935	279943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198492
4024	NC_015942	GTG	2	6	279969	279974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198492
4025	NC_015942	GCA	2	6	280058	280063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198492
4026	NC_015942	GGC	2	6	280188	280193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198492
4027	NC_015942	TAT	2	6	280315	280320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198492
4028	NC_015942	GCT	2	6	280344	280349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198492
4029	NC_015942	ATC	2	6	280367	280372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198492
4030	NC_015942	TGG	2	6	280442	280447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198492
4031	NC_015942	TGT	2	6	280470	280475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198492
4032	NC_015942	GTT	2	6	280557	280562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198492
4033	NC_015942	CGG	2	6	280598	280603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198492
4034	NC_015942	CCT	2	6	280652	280657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198492
4035	NC_015942	GCG	2	6	280682	280687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198492
4036	NC_015942	AAT	2	6	280705	280710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198492
4037	NC_015942	TGG	2	6	280757	280762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198492
4038	NC_015942	CGA	2	6	280848	280853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198492
4039	NC_015942	GGC	2	6	280965	280970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198492
4040	NC_015942	GAC	2	6	281091	281096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198492
4041	NC_015942	GCC	2	6	281119	281124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198492
4042	NC_015942	GAA	2	6	281343	281348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198492
4043	NC_015942	CTG	2	6	281661	281666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198493
4044	NC_015942	GGC	3	9	281675	281683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198493
4045	NC_015942	CAT	2	6	281741	281746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198493
4046	NC_015942	GCG	2	6	281766	281771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198493
4047	NC_015942	TGT	2	6	281893	281898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198493
4048	NC_015942	CTG	3	9	282016	282024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198494
4049	NC_015942	GCC	2	6	282102	282107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198494
4050	NC_015942	CGC	2	6	282141	282146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198494
4051	NC_015942	ATT	2	6	282160	282165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198494
4052	NC_015942	TGC	2	6	282176	282181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198494
4053	NC_015942	TCT	2	6	282220	282225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198494
4054	NC_015942	CTG	2	6	282236	282241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198495
4055	NC_015942	TTC	2	6	282261	282266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198495
4056	NC_015942	CGG	2	6	282380	282385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198495
4057	NC_015942	CCA	2	6	282484	282489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198495
4058	NC_015942	GCC	2	6	282582	282587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198495
4059	NC_015942	TGG	2	6	282743	282748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198495
4060	NC_015942	AGC	2	6	282796	282801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198495
4061	NC_015942	CGC	2	6	282815	282820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198495
4062	NC_015942	CCT	2	6	282998	283003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198495
4063	NC_015942	CGG	2	6	283015	283020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198495
4064	NC_015942	GTC	2	6	283069	283074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198495
4065	NC_015942	GAT	2	6	283095	283100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198495
4066	NC_015942	CGC	2	6	283112	283117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198495
4067	NC_015942	CCG	2	6	283211	283216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198495
4068	NC_015942	CTG	2	6	283242	283247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198495
4069	NC_015942	TCA	2	6	283267	283272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198495
4070	NC_015942	GAC	2	6	283286	283291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198495
4071	NC_015942	GGC	2	6	283295	283300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198495
4072	NC_015942	CCT	2	6	283346	283351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198495
4073	NC_015942	CGG	3	9	283382	283390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198495
4074	NC_015942	CGG	2	6	283394	283399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198495
4075	NC_015942	TGA	2	6	283520	283525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198495
4076	NC_015942	GCA	2	6	283547	283552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198495
4077	NC_015942	TCG	2	6	283603	283608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198495
4078	NC_015942	CGA	2	6	283631	283636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198495
4079	NC_015942	GGC	2	6	283641	283646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198495
4080	NC_015942	CGT	2	6	283787	283792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198495
4081	NC_015942	CAG	2	6	284043	284048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198495
4082	NC_015942	CAG	2	6	284321	284326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198496
4083	NC_015942	CTT	2	6	284386	284391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198496
4084	NC_015942	CTG	2	6	284396	284401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198496
4085	NC_015942	GAG	2	6	284432	284437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198496
4086	NC_015942	CGC	2	6	284473	284478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198496
4087	NC_015942	GCG	2	6	284493	284498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198496
4088	NC_015942	CGA	2	6	284527	284532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198496
4089	NC_015942	AAC	2	6	284749	284754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198497
4090	NC_015942	CGC	2	6	284797	284802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198497
4091	NC_015942	CTG	2	6	284929	284934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198497
4092	NC_015942	ACC	2	6	284939	284944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198497
4093	NC_015942	GGT	2	6	284951	284956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198497
4094	NC_015942	CCG	2	6	284982	284987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198497
4095	NC_015942	CTG	2	6	285040	285045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198497
4096	NC_015942	CAA	2	6	285095	285100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198497
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4098	NC_015942	CCG	2	6	285221	285226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198497
4099	NC_015942	CGG	2	6	285248	285253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198497
4100	NC_015942	CTC	2	6	285258	285263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198497
4101	NC_015942	ACA	2	6	285265	285270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198497
4102	NC_015942	GCC	2	6	285331	285336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198497
4103	NC_015942	AAC	2	6	285342	285347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198497
4104	NC_015942	GCG	2	6	285447	285452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198497
4105	NC_015942	ACC	2	6	285538	285543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198497
4106	NC_015942	CTG	2	6	285552	285557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198497
4107	NC_015942	GGA	2	6	285587	285592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198497
4108	NC_015942	GTT	2	6	285741	285746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198498
4109	NC_015942	TTG	2	6	285769	285774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198498
4110	NC_015942	ATT	2	6	285900	285905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198498
4111	NC_015942	GCG	2	6	285941	285946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198498
4112	NC_015942	GAA	2	6	285957	285962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198498
4113	NC_015942	GGC	2	6	285964	285969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198498
4114	NC_015942	GCC	2	6	286000	286005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198498
4115	NC_015942	ATC	2	6	286030	286035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198498
4116	NC_015942	ATG	2	6	286049	286054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198498
4117	NC_015942	AGA	2	6	286104	286109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198498
4118	NC_015942	GAT	2	6	286110	286115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198498
4119	NC_015942	CGC	3	9	286163	286171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198498
4120	NC_015942	CGA	2	6	286291	286296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198498
4121	NC_015942	CCT	2	6	286696	286701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198499
4122	NC_015942	CAT	2	6	286723	286728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198499
4123	NC_015942	AGC	2	6	286740	286745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198499
4124	NC_015942	GCA	2	6	286912	286917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198499
4125	NC_015942	TCC	2	6	287045	287050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198499
4126	NC_015942	GTG	2	6	287155	287160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198499
4127	NC_015942	GAT	2	6	287285	287290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198500
4128	NC_015942	CGA	2	6	287339	287344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198500
4129	NC_015942	ATG	2	6	287415	287420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198500
4130	NC_015942	TGA	2	6	287439	287444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198500
4131	NC_015942	CAC	2	6	287449	287454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198500
4132	NC_015942	ATA	2	6	287495	287500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198500
4133	NC_015942	CTT	2	6	287598	287603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198500
4134	NC_015942	TTA	2	6	287687	287692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198500
4135	NC_015942	GTC	2	6	287710	287715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198500
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4138	NC_015942	GGT	2	6	287837	287842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198500
4139	NC_015942	GGT	2	6	287857	287862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198500
4140	NC_015942	CCT	2	6	287880	287885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198500
4141	NC_015942	CTG	2	6	287888	287893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198500
4142	NC_015942	AAG	2	6	287921	287926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198500
4143	NC_015942	CCT	2	6	288042	288047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198500
4144	NC_015942	AGC	2	6	288088	288093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198500
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4147	NC_015942	CCG	2	6	288182	288187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198500
4148	NC_015942	AGG	2	6	288212	288217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198500
4149	NC_015942	CCG	2	6	288223	288228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198500
4150	NC_015942	GCC	2	6	288281	288286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198501
4151	NC_015942	TGG	2	6	288299	288304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198501
4152	NC_015942	TCA	2	6	288381	288386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198501
4153	NC_015942	CGG	2	6	288640	288645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198501
4154	NC_015942	AGG	2	6	288660	288665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198501
4155	NC_015942	GAT	2	6	288724	288729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198501
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4158	NC_015942	CCT	2	6	288976	288981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198501
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4162	NC_015942	CTG	2	6	289151	289156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198501
4163	NC_015942	ATG	2	6	289182	289187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198501
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4232	NC_015942	CGG	2	6	294379	294384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198507
4233	NC_015942	GCG	2	6	294507	294512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198507
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4356	NC_015942	CAT	2	6	305078	305083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198518
4357	NC_015942	CGG	2	6	305111	305116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198518
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4474	NC_015942	GAT	2	6	312710	312715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198527
4475	NC_015942	TGC	2	6	312716	312721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198527
4476	NC_015942	GAT	2	6	312914	312919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198528
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