MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 41677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013205	GGC	2	6	207473	207478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510209
3002	NC_013205	CTA	2	6	207645	207650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510210
3003	NC_013205	ACG	2	6	207668	207673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510210
3004	NC_013205	AGG	2	6	207770	207775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510210
3005	NC_013205	AGA	2	6	208193	208198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510212
3006	NC_013205	CCG	2	6	208371	208376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510212
3007	NC_013205	CCA	2	6	208446	208451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510212
3008	NC_013205	GAT	2	6	208513	208518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510212
3009	NC_013205	CAC	3	9	208531	208539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510212
3010	NC_013205	CGC	2	6	208573	208578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510212
3011	NC_013205	GAA	2	6	208600	208605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510212
3012	NC_013205	CTT	2	6	208816	208821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510213
3013	NC_013205	GCG	2	6	208837	208842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510213
3014	NC_013205	TCC	2	6	208913	208918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510213
3015	NC_013205	CGT	2	6	208974	208979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510213
3016	NC_013205	CCG	2	6	209042	209047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510213
3017	NC_013205	ATC	2	6	209107	209112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510213
3018	NC_013205	CCG	2	6	209115	209120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510213
3019	NC_013205	CGG	2	6	209126	209131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510213
3020	NC_013205	CAT	2	6	209133	209138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510213
3021	NC_013205	TCG	2	6	209210	209215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510213
3022	NC_013205	TGA	2	6	209333	209338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510213
3023	NC_013205	CGT	2	6	209340	209345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510213
3024	NC_013205	TCA	2	6	209363	209368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510213
3025	NC_013205	CCG	2	6	209462	209467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510213
3026	NC_013205	CCA	2	6	209508	209513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510213
3027	NC_013205	GCC	2	6	209596	209601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510213
3028	NC_013205	TCG	2	6	209606	209611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510213
3029	NC_013205	GCC	2	6	209677	209682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510213
3030	NC_013205	CGC	2	6	209711	209716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510213
3031	NC_013205	CGA	2	6	209772	209777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510213
3032	NC_013205	GAT	2	6	210099	210104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510213
3033	NC_013205	GAT	2	6	210162	210167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510213
3034	NC_013205	GTC	2	6	210214	210219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510213
3035	NC_013205	AGA	2	6	210251	210256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510213
3036	NC_013205	AGA	2	6	210275	210280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510213
3037	NC_013205	GAG	2	6	210295	210300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510213
3038	NC_013205	GAC	2	6	210316	210321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510213
3039	NC_013205	CAT	2	6	210327	210332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510213
3040	NC_013205	GGT	2	6	210363	210368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510213
3041	NC_013205	GCC	2	6	210468	210473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510213
3042	NC_013205	CGG	2	6	210477	210482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510213
3043	NC_013205	GCC	2	6	210557	210562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510213
3044	NC_013205	CCT	2	6	210681	210686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510213
3045	NC_013205	TGA	2	6	210695	210700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510213
3046	NC_013205	CGA	2	6	210711	210716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510213
3047	NC_013205	CAC	2	6	210777	210782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510213
3048	NC_013205	AGG	2	6	210869	210874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510213
3049	NC_013205	TCA	2	6	210875	210880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510213
3050	NC_013205	GAG	2	6	210916	210921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510213
3051	NC_013205	ACG	2	6	210992	210997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510213
3052	NC_013205	GGC	2	6	211035	211040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510213
3053	NC_013205	GAC	2	6	211129	211134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510213
3054	NC_013205	GGC	2	6	211179	211184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510213
3055	NC_013205	CCG	2	6	211217	211222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510213
3056	NC_013205	TCA	2	6	211376	211381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510214
3057	NC_013205	TCG	2	6	211448	211453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510214
3058	NC_013205	GCG	2	6	211478	211483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510214
3059	NC_013205	GAT	2	6	211584	211589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510214
3060	NC_013205	CAG	2	6	211618	211623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510214
3061	NC_013205	CTC	2	6	211639	211644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510214
3062	NC_013205	GGA	2	6	211665	211670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510214
3063	NC_013205	GCC	2	6	211674	211679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510214
3064	NC_013205	GGT	2	6	211704	211709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510214
3065	NC_013205	TCG	2	6	211742	211747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510214
3066	NC_013205	GAG	2	6	211882	211887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510214
3067	NC_013205	GGC	2	6	211960	211965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510214
3068	NC_013205	CGC	2	6	211992	211997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510214
3069	NC_013205	CGC	2	6	212039	212044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510214
3070	NC_013205	GAC	2	6	212181	212186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510215
3071	NC_013205	CAG	2	6	212292	212297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510215
3072	NC_013205	GAC	2	6	212301	212306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510215
3073	NC_013205	CTT	2	6	212327	212332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510215
3074	NC_013205	TCG	2	6	212422	212427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510215
3075	NC_013205	AGG	2	6	212497	212502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510215
3076	NC_013205	TCG	2	6	212521	212526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510215
3077	NC_013205	CGG	2	6	212531	212536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510215
3078	NC_013205	CTT	2	6	212591	212596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510215
3079	NC_013205	GCG	2	6	212622	212627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510215
3080	NC_013205	ACG	2	6	212629	212634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510215
3081	NC_013205	GCG	2	6	212711	212716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510215
3082	NC_013205	TGC	2	6	212782	212787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510215
3083	NC_013205	CGC	2	6	212819	212824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510215
3084	NC_013205	CAC	2	6	212921	212926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510215
3085	NC_013205	CAT	2	6	212954	212959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510215
3086	NC_013205	CCT	2	6	213081	213086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510216
3087	NC_013205	CGG	2	6	213175	213180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510216
3088	NC_013205	AGG	2	6	213225	213230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510216
3089	NC_013205	CAC	3	9	213269	213277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510216
3090	NC_013205	CGC	2	6	213301	213306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510216
3091	NC_013205	TCG	2	6	213309	213314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510216
3092	NC_013205	GGC	2	6	213394	213399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510216
3093	NC_013205	GCG	2	6	213450	213455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510216
3094	NC_013205	TCA	2	6	213498	213503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510216
3095	NC_013205	CTC	2	6	213590	213595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510216
3096	NC_013205	GGA	2	6	213652	213657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510216
3097	NC_013205	GGT	2	6	213703	213708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510216
3098	NC_013205	GAG	2	6	213743	213748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510216
3099	NC_013205	TGT	2	6	213771	213776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510216
3100	NC_013205	GGA	2	6	213781	213786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510216
3101	NC_013205	GCG	2	6	213837	213842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510216
3102	NC_013205	GCC	2	6	213870	213875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510216
3103	NC_013205	CGC	2	6	213974	213979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510216
3104	NC_013205	GCC	2	6	213994	213999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510216
3105	NC_013205	CGG	2	6	214020	214025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510216
3106	NC_013205	CGG	3	9	214122	214130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510216
3107	NC_013205	TCG	2	6	214137	214142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510216
3108	NC_013205	CGG	2	6	214169	214174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510216
3109	NC_013205	TGG	2	6	214217	214222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510216
3110	NC_013205	CGA	2	6	214272	214277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510216
3111	NC_013205	CGG	2	6	214297	214302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510216
3112	NC_013205	CCT	2	6	214375	214380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510216
3113	NC_013205	CAT	2	6	214414	214419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510216
3114	NC_013205	GCG	2	6	214443	214448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510216
3115	NC_013205	GCG	2	6	214686	214691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510217
3116	NC_013205	CGA	2	6	214771	214776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510217
3117	NC_013205	GTC	2	6	214778	214783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510217
3118	NC_013205	TCA	2	6	214837	214842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510217
3119	NC_013205	GGA	2	6	214847	214852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510217
3120	NC_013205	GAT	2	6	214895	214900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510217
3121	NC_013205	CGG	2	6	214902	214907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510217
3122	NC_013205	GGC	2	6	214910	214915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510217
3123	NC_013205	ACT	2	6	214978	214983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510217
3124	NC_013205	TCG	2	6	215011	215016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510217
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3132	NC_013205	GAG	2	6	215700	215705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510218
3133	NC_013205	TGC	2	6	215770	215775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510218
3134	NC_013205	CTC	2	6	215805	215810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510218
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3140	NC_013205	TCG	2	6	216043	216048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510218
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3143	NC_013205	GTC	2	6	216159	216164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510218
3144	NC_013205	GAG	2	6	216189	216194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510218
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3147	NC_013205	GCT	2	6	216314	216319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510218
3148	NC_013205	GCG	2	6	216321	216326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510218
3149	NC_013205	AAG	2	6	216330	216335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510218
3150	NC_013205	CGA	2	6	216362	216367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510218
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3235	NC_013205	GGC	2	6	221759	221764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510223
3236	NC_013205	GGA	3	9	221786	221794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510223
3237	NC_013205	CAT	2	6	221804	221809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510223
3238	NC_013205	CGC	2	6	221845	221850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510223
3239	NC_013205	CGA	2	6	221858	221863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510223
3240	NC_013205	GGC	2	6	221869	221874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510223
3241	NC_013205	GGC	2	6	221905	221910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510223
3242	NC_013205	ACG	2	6	221989	221994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510223
3243	NC_013205	TGC	2	6	222001	222006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510223
3244	NC_013205	CGT	2	6	222026	222031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510223
3245	NC_013205	CGC	2	6	222069	222074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510223
3246	NC_013205	TGC	2	6	222079	222084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510223
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3250	NC_013205	CAT	2	6	222167	222172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510223
3251	NC_013205	TCG	2	6	222268	222273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510223
3252	NC_013205	GCG	2	6	222310	222315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510223
3253	NC_013205	ACG	2	6	222397	222402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510223
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3257	NC_013205	CGC	2	6	222647	222652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510224
3258	NC_013205	CGC	2	6	222656	222661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510224
3259	NC_013205	CTT	2	6	222679	222684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510224
3260	NC_013205	GGC	2	6	222951	222956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510224
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3262	NC_013205	CGG	2	6	223033	223038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510225
3263	NC_013205	GGA	2	6	223111	223116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510225
3264	NC_013205	GCG	2	6	223160	223165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510225
3265	NC_013205	CGC	2	6	223224	223229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510225
3266	NC_013205	AAG	2	6	223440	223445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510226
3267	NC_013205	GAG	3	9	223478	223486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510226
3268	NC_013205	GCG	2	6	223510	223515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510226
3269	NC_013205	GAA	2	6	223588	223593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510226
3270	NC_013205	CAT	2	6	223618	223623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510226
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3274	NC_013205	TCG	2	6	223752	223757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510226
3275	NC_013205	GCT	2	6	223819	223824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510226
3276	NC_013205	TCG	2	6	223845	223850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510226
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3284	NC_013205	TCG	2	6	224453	224458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510227
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3292	NC_013205	CGT	2	6	225057	225062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510227
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3300	NC_013205	TCG	2	6	225359	225364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510227
3301	NC_013205	AGG	2	6	225446	225451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510227
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3349	NC_013205	TTC	2	6	234024	234029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510231
3350	NC_013205	GGC	2	6	234328	234333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510232
3351	NC_013205	CGT	2	6	234408	234413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510232
3352	NC_013205	GCG	2	6	234438	234443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510232
3353	NC_013205	GCC	2	6	234484	234489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510232
3354	NC_013205	TTG	2	6	234530	234535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510232
3355	NC_013205	TCA	2	6	234569	234574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510232
3356	NC_013205	CCA	2	6	234699	234704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510232
3357	NC_013205	TCG	2	6	234743	234748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510232
3358	NC_013205	TCC	2	6	234805	234810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510232
3359	NC_013205	GTC	2	6	234814	234819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510232
3360	NC_013205	TCG	2	6	234836	234841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510232
3361	NC_013205	TGA	2	6	234851	234856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510232
3362	NC_013205	GCG	2	6	234984	234989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510232
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3364	NC_013205	CTT	2	6	235017	235022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510232
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3366	NC_013205	CTG	2	6	235102	235107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510232
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3379	NC_013205	GCG	2	6	236053	236058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510234
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3384	NC_013205	CGT	2	6	236352	236357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510234
3385	NC_013205	GGC	2	6	236368	236373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510234
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3475	NC_013205	CGA	2	6	243216	243221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510239
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3478	NC_013205	CGG	2	6	243346	243351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510240
3479	NC_013205	TGG	2	6	243365	243370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510240
3480	NC_013205	ACC	2	6	243427	243432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510240
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3483	NC_013205	CTT	2	6	243601	243606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510240
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