MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 41351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017857	TTA	2	6	267540	267545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126154
3502	NC_017857	GTA	2	6	267566	267571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126154
3503	NC_017857	GCA	2	6	267639	267644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126154
3504	NC_017857	ATG	2	6	267662	267667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126154
3505	NC_017857	TGA	2	6	267681	267686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126154
3506	NC_017857	ACA	2	6	267702	267707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126154
3507	NC_017857	AGA	2	6	267861	267866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126154
3508	NC_017857	GCA	2	6	267943	267948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126154
3509	NC_017857	GAT	2	6	268036	268041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126154
3510	NC_017857	GAT	2	6	268051	268056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126154
3511	NC_017857	AGC	2	6	268079	268084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126154
3512	NC_017857	TGA	2	6	268095	268100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126154
3513	NC_017857	CTG	2	6	268165	268170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126154
3514	NC_017857	GAT	2	6	268363	268368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126155
3515	NC_017857	AGC	2	6	268482	268487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126155
3516	NC_017857	TGA	2	6	268521	268526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126155
3517	NC_017857	TGG	2	6	268535	268540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126155
3518	NC_017857	ATT	2	6	268623	268628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126155
3519	NC_017857	TGG	2	6	268757	268762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126155
3520	NC_017857	CGC	2	6	268848	268853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126155
3521	NC_017857	GAT	2	6	268909	268914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126155
3522	NC_017857	CGG	2	6	268969	268974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126155
3523	NC_017857	ATT	2	6	268996	269001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126155
3524	NC_017857	ATC	2	6	269068	269073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126155
3525	NC_017857	TTA	2	6	269131	269136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126155
3526	NC_017857	GAA	2	6	269152	269157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126155
3527	NC_017857	CTG	2	6	269158	269163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126155
3528	NC_017857	GAA	3	9	269167	269175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126155
3529	NC_017857	ATG	2	6	269210	269215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126155
3530	NC_017857	TGC	2	6	269289	269294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126155
3531	NC_017857	CAA	2	6	269344	269349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126155
3532	NC_017857	TCG	2	6	269379	269384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126155
3533	NC_017857	GTG	2	6	269417	269422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126155
3534	NC_017857	CCG	2	6	269423	269428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126155
3535	NC_017857	TGG	3	9	269471	269479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126155
3536	NC_017857	TGA	2	6	269490	269495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126155
3537	NC_017857	ACC	2	6	269505	269510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126155
3538	NC_017857	AGG	2	6	269627	269632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387126155
3539	NC_017857	TCT	2	6	269663	269668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126155
3540	NC_017857	CAT	2	6	269692	269697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_017857	ACG	2	6	269765	269770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126156
3542	NC_017857	ATT	2	6	269791	269796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126156
3543	NC_017857	ATG	2	6	269815	269820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126156
3544	NC_017857	AAT	2	6	269851	269856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126156
3545	NC_017857	TGA	2	6	269967	269972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126156
3546	NC_017857	ACC	2	6	269983	269988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126156
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3551	NC_017857	ACA	2	6	270214	270219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126156
3552	NC_017857	CAT	2	6	270294	270299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126157
3553	NC_017857	GAT	2	6	270360	270365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126157
3554	NC_017857	TAG	2	6	270376	270381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126157
3555	NC_017857	AAC	2	6	270439	270444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126157
3556	NC_017857	ACT	2	6	270528	270533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126157
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3558	NC_017857	CAA	2	6	270639	270644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126157
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3561	NC_017857	TGG	2	6	270738	270743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126158
3562	NC_017857	CGG	2	6	270754	270759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126158
3563	NC_017857	TAT	2	6	270839	270844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126158
3564	NC_017857	TGA	2	6	270847	270852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126158
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3573	NC_017857	GTG	2	6	271519	271524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126159
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3589	NC_017857	GAT	2	6	273158	273163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126160
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3592	NC_017857	GTT	2	6	273392	273397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126160
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3602	NC_017857	GCA	2	6	274168	274173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126162
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3606	NC_017857	CTT	2	6	274427	274432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_017857	GTT	2	6	274474	274479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_017857	ATC	2	6	274511	274516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3610	NC_017857	CTA	2	6	274611	274616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_017857	AAC	2	6	274619	274624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_017857	TTA	2	6	274730	274735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_017857	ACA	2	6	274759	274764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_017857	CAG	2	6	275108	275113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126163
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3617	NC_017857	TAT	2	6	275348	275353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126163
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3978	NC_017857	ACT	2	6	302827	302832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126188
3979	NC_017857	TGC	2	6	302841	302846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126188
3980	NC_017857	CTG	2	6	302976	302981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126188
3981	NC_017857	TAA	2	6	303008	303013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126188
3982	NC_017857	TTG	2	6	303213	303218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126188
3983	NC_017857	CAT	2	6	303336	303341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3986	NC_017857	TGT	2	6	303579	303584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126189
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3988	NC_017857	CTT	2	6	303607	303612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126189
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3990	NC_017857	GTT	2	6	303742	303747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126189
3991	NC_017857	CAT	2	6	303892	303897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126189
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3999	NC_017857	TGC	2	6	304293	304298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126189
4000	NC_017857	GCA	2	6	304362	304367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126189

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