MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 41351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017857	CTG	2	6	420538	420543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126310
5502	NC_017857	AAT	2	6	420580	420585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126310
5503	NC_017857	CAC	2	6	420586	420591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126310
5504	NC_017857	TCA	2	6	420636	420641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126310
5505	NC_017857	CAC	2	6	420654	420659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126310
5506	NC_017857	ACT	2	6	420668	420673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126310
5507	NC_017857	TTG	2	6	420729	420734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126310
5508	NC_017857	AGC	2	6	420752	420757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126310
5509	NC_017857	GTG	2	6	420857	420862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126310
5510	NC_017857	ATC	3	9	420892	420900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126310
5511	NC_017857	CCT	2	6	420927	420932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387126310
5512	NC_017857	CAT	2	6	421098	421103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126310
5513	NC_017857	AAG	2	6	421109	421114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126310
5514	NC_017857	GGC	2	6	421115	421120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126310
5515	NC_017857	CAT	2	6	421131	421136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126310
5516	NC_017857	TGC	2	6	421201	421206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126310
5517	NC_017857	TCA	2	6	421232	421237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126310
5518	NC_017857	CAA	2	6	421287	421292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126310
5519	NC_017857	CCA	2	6	421428	421433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126310
5520	NC_017857	CAG	2	6	421458	421463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126310
5521	NC_017857	GAC	2	6	421518	421523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126310
5522	NC_017857	ACC	2	6	421562	421567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126310
5523	NC_017857	CAT	2	6	421594	421599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126310
5524	NC_017857	TGA	2	6	421710	421715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126310
5525	NC_017857	GCC	2	6	421784	421789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126310
5526	NC_017857	TAA	2	6	421818	421823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126310
5527	NC_017857	GGA	2	6	421834	421839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387126310
5528	NC_017857	TTC	2	6	421870	421875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126310
5529	NC_017857	CGT	2	6	421989	421994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_017857	ATC	2	6	422247	422252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126311
5531	NC_017857	AGG	2	6	422360	422365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387126311
5532	NC_017857	TCA	2	6	422371	422376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126311
5533	NC_017857	TGA	2	6	422381	422386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126311
5534	NC_017857	GTA	2	6	422414	422419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126311
5535	NC_017857	TCA	2	6	422425	422430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126311
5536	NC_017857	CTT	2	6	422447	422452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126311
5537	NC_017857	TTA	2	6	422524	422529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126311
5538	NC_017857	TCA	2	6	422747	422752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126311
5539	NC_017857	GCA	2	6	422809	422814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126311
5540	NC_017857	GTT	2	6	423039	423044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_017857	TTG	2	6	423100	423105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126313
5542	NC_017857	CAG	2	6	423225	423230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126313
5543	NC_017857	CAA	2	6	423336	423341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126313
5544	NC_017857	TGC	3	9	423395	423403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126313
5545	NC_017857	ATG	2	6	423598	423603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126313
5546	NC_017857	ATT	2	6	423630	423635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126313
5547	NC_017857	ATA	2	6	423685	423690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126313
5548	NC_017857	GCT	2	6	423821	423826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126313
5549	NC_017857	AAT	2	6	423861	423866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126313
5550	NC_017857	TTG	2	6	423921	423926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126313
5551	NC_017857	TCA	2	6	423993	423998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126313
5552	NC_017857	GTG	2	6	424106	424111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126313
5553	NC_017857	GAA	2	6	424142	424147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126313
5554	NC_017857	ATG	2	6	424174	424179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126313
5555	NC_017857	CAC	2	6	424261	424266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126313
5556	NC_017857	GAT	2	6	424269	424274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126313
5557	NC_017857	GTT	2	6	424289	424294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126313
5558	NC_017857	TGG	2	6	424297	424302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126313
5559	NC_017857	CAT	2	6	424484	424489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126313
5560	NC_017857	ATG	3	9	424504	424512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126313
5561	NC_017857	TGA	2	6	424624	424629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126313
5562	NC_017857	GCA	2	6	424694	424699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126313
5563	NC_017857	GAT	2	6	424839	424844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126313
5564	NC_017857	TTA	2	6	424887	424892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126313
5565	NC_017857	TGG	2	6	424955	424960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126313
5566	NC_017857	CGA	2	6	424961	424966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126313
5567	NC_017857	AGC	2	6	425011	425016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126313
5568	NC_017857	TCA	2	6	425020	425025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126313
5569	NC_017857	TGC	2	6	425137	425142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126313
5570	NC_017857	CAG	2	6	425220	425225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126313
5571	NC_017857	CAT	2	6	425238	425243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126313
5572	NC_017857	GTA	2	6	425244	425249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126313
5573	NC_017857	AAT	2	6	425327	425332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126313
5574	NC_017857	CAC	2	6	425358	425363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126313
5575	NC_017857	TTG	2	6	425376	425381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126313
5576	NC_017857	GCA	2	6	425480	425485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126313
5577	NC_017857	GCA	2	6	425520	425525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126313
5578	NC_017857	ACA	2	6	425561	425566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126313
5579	NC_017857	ATT	2	6	425661	425666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126313
5580	NC_017857	GAT	2	6	425667	425672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126313
5581	NC_017857	TGA	2	6	425705	425710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126313
5582	NC_017857	TTG	2	6	425824	425829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126313
5583	NC_017857	TGT	2	6	425908	425913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126313
5584	NC_017857	TCA	2	6	426149	426154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_017857	CAT	2	6	426188	426193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_017857	GGT	2	6	426212	426217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_017857	CAA	2	6	426302	426307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_017857	GAA	2	6	426339	426344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_017857	GCA	3	9	426547	426555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126314
5590	NC_017857	TGG	3	9	426606	426614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126314
5591	NC_017857	ATG	2	6	426667	426672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126314
5592	NC_017857	AGC	2	6	426681	426686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126314
5593	NC_017857	TAT	2	6	426793	426798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126314
5594	NC_017857	TTA	2	6	426803	426808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126314
5595	NC_017857	GAG	2	6	426845	426850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387126314
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5597	NC_017857	TAT	2	6	427209	427214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126314
5598	NC_017857	GAT	2	6	427257	427262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126314
5599	NC_017857	AGA	2	6	427296	427301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126314
5600	NC_017857	CAA	2	6	427322	427327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126314
5601	NC_017857	CGC	2	6	427395	427400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126314
5602	NC_017857	GAG	2	6	427453	427458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387126314
5603	NC_017857	TGG	2	6	427490	427495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126314
5604	NC_017857	TGG	2	6	427583	427588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126314
5605	NC_017857	ATT	3	9	427609	427617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126314
5606	NC_017857	CAT	2	6	427626	427631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126314
5607	NC_017857	TGG	2	6	427702	427707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126314
5608	NC_017857	ATT	2	6	427797	427802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126315
5609	NC_017857	GAA	2	6	427942	427947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126316
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5611	NC_017857	TGG	2	6	427988	427993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126316
5612	NC_017857	AGC	2	6	428258	428263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126316
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5614	NC_017857	GAT	2	6	428335	428340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126316
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5616	NC_017857	CAG	2	6	428388	428393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126316
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