MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 41351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017857	CCA	2	6	382656	382661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126276
5003	NC_017857	TGG	2	6	382765	382770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126276
5004	NC_017857	TGA	2	6	382786	382791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126276
5005	NC_017857	CCA	2	6	382847	382852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126276
5006	NC_017857	GGT	2	6	382874	382879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126276
5007	NC_017857	GGC	2	6	382906	382911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126276
5008	NC_017857	CAA	2	6	382988	382993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126276
5009	NC_017857	GGC	2	6	383018	383023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126276
5010	NC_017857	TCC	2	6	383028	383033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387126276
5011	NC_017857	GCA	2	6	383034	383039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126276
5012	NC_017857	GTG	2	6	383040	383045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126276
5013	NC_017857	ATT	2	6	383091	383096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126276
5014	NC_017857	GTG	2	6	383271	383276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126276
5015	NC_017857	ATC	2	6	383488	383493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126276
5016	NC_017857	CTT	2	6	383505	383510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126276
5017	NC_017857	GCT	2	6	383930	383935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126276
5018	NC_017857	CAT	2	6	384055	384060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126276
5019	NC_017857	GAT	2	6	384194	384199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126276
5020	NC_017857	TGC	2	6	384274	384279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126276
5021	NC_017857	GGT	2	6	384411	384416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126277
5022	NC_017857	GAT	2	6	384514	384519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126277
5023	NC_017857	TGG	2	6	384638	384643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126277
5024	NC_017857	TAA	2	6	384707	384712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126277
5025	NC_017857	TTC	2	6	384729	384734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126277
5026	NC_017857	ATT	2	6	384828	384833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126277
5027	NC_017857	GCT	2	6	384957	384962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126277
5028	NC_017857	GAT	2	6	384976	384981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126277
5029	NC_017857	GAT	2	6	385048	385053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126277
5030	NC_017857	GCT	2	6	385081	385086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126277
5031	NC_017857	AAT	2	6	385117	385122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126277
5032	NC_017857	TCG	2	6	385128	385133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126277
5033	NC_017857	GCA	2	6	385208	385213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126277
5034	NC_017857	CGC	2	6	385217	385222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126277
5035	NC_017857	CAG	2	6	385271	385276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126277
5036	NC_017857	TAG	2	6	385281	385286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126277
5037	NC_017857	ATC	2	6	385377	385382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126278
5038	NC_017857	ATT	2	6	385401	385406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126278
5039	NC_017857	TGA	2	6	385479	385484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126278
5040	NC_017857	ATT	2	6	385531	385536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126278
5041	NC_017857	GGC	2	6	385645	385650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126278
5042	NC_017857	CAG	2	6	385699	385704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126278
5043	NC_017857	GAT	2	6	385918	385923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126278
5044	NC_017857	ATT	2	6	386052	386057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017857	GTG	2	6	386316	386321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5047	NC_017857	GTA	2	6	386601	386606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017857	TGA	2	6	386648	386653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_017857	TAA	2	6	386757	386762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_017857	ACC	2	6	386787	386792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5051	NC_017857	TAT	2	6	386938	386943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_017857	GGT	2	6	386971	386976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126279
5053	NC_017857	CAC	2	6	387018	387023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126279
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5056	NC_017857	TTA	2	6	387370	387375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126280
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5059	NC_017857	GAA	2	6	387490	387495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126280
5060	NC_017857	TGA	2	6	387509	387514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017857	ATC	2	6	387558	387563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_017857	CAA	2	6	387593	387598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126281
5063	NC_017857	TAG	2	6	387801	387806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126281
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5065	NC_017857	TGC	2	6	388032	388037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126282
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5068	NC_017857	GAT	2	6	388159	388164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126282
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5071	NC_017857	TCA	2	6	388363	388368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_017857	TTA	2	6	388373	388378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017857	CTG	2	6	388434	388439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126283
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5080	NC_017857	CAA	2	6	388871	388876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126284
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5084	NC_017857	TGC	2	6	389164	389169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126285
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5090	NC_017857	ATT	2	6	389652	389657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126285
5091	NC_017857	TGG	2	6	389717	389722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126285
5092	NC_017857	ATT	2	6	389795	389800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126285
5093	NC_017857	ACC	2	6	389840	389845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126285
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5102	NC_017857	CTG	2	6	390478	390483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126285
5103	NC_017857	ACT	2	6	390570	390575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126286
5104	NC_017857	GCT	2	6	390592	390597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126286
5105	NC_017857	TGC	2	6	390609	390614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126286
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5107	NC_017857	GTT	2	6	390786	390791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126286
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5109	NC_017857	ATT	2	6	390934	390939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126287
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5111	NC_017857	TAT	2	6	391119	391124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126287
5112	NC_017857	TGC	2	6	391184	391189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_017857	TGG	2	6	391202	391207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_017857	TCA	2	6	391219	391224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126288
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