MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 41351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017857	TCG	2	6	114685	114690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126015
1502	NC_017857	TTC	2	6	114786	114791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126015
1503	NC_017857	TTA	2	6	114811	114816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126015
1504	NC_017857	TCA	2	6	114823	114828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126015
1505	NC_017857	TGA	2	6	114833	114838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126015
1506	NC_017857	TGT	2	6	114973	114978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126015
1507	NC_017857	GCC	2	6	115146	115151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126016
1508	NC_017857	TTC	2	6	115211	115216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126016
1509	NC_017857	TCA	2	6	115257	115262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126016
1510	NC_017857	AAT	2	6	115266	115271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126016
1511	NC_017857	ACG	2	6	115520	115525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126016
1512	NC_017857	CAG	2	6	115571	115576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126016
1513	NC_017857	TCA	2	6	115773	115778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126016
1514	NC_017857	CGC	2	6	115829	115834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126016
1515	NC_017857	ACT	2	6	115928	115933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126017
1516	NC_017857	CAG	2	6	115945	115950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126017
1517	NC_017857	TGC	2	6	115978	115983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126017
1518	NC_017857	TAC	2	6	116101	116106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126017
1519	NC_017857	CAT	2	6	116113	116118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126017
1520	NC_017857	GCT	2	6	116138	116143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126017
1521	NC_017857	TCA	2	6	116169	116174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126017
1522	NC_017857	GCC	2	6	116183	116188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126017
1523	NC_017857	TAG	2	6	116223	116228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126017
1524	NC_017857	ACC	2	6	116300	116305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126017
1525	NC_017857	ACG	2	6	116331	116336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126017
1526	NC_017857	GAA	2	6	116386	116391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126017
1527	NC_017857	TCA	2	6	116396	116401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126017
1528	NC_017857	ATT	2	6	116476	116481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126017
1529	NC_017857	GCA	2	6	116543	116548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126017
1530	NC_017857	CAT	2	6	116590	116595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126017
1531	NC_017857	TGC	2	6	116687	116692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126017
1532	NC_017857	CAA	2	6	116733	116738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126017
1533	NC_017857	ACC	2	6	116786	116791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126017
1534	NC_017857	GCA	2	6	116891	116896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126017
1535	NC_017857	ATT	2	6	117013	117018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126017
1536	NC_017857	TGC	2	6	117086	117091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126017
1537	NC_017857	ACG	2	6	117127	117132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126017
1538	NC_017857	CTT	2	6	117261	117266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126017
1539	NC_017857	CTG	2	6	117381	117386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126017
1540	NC_017857	GCT	2	6	117547	117552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126018
1541	NC_017857	CCG	2	6	117666	117671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126018
1542	NC_017857	ATC	2	6	117770	117775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126018
1543	NC_017857	CAC	2	6	117844	117849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126018
1544	NC_017857	CGA	2	6	117981	117986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126018
1545	NC_017857	CCA	2	6	118046	118051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126018
1546	NC_017857	ATA	2	6	118091	118096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126018
1547	NC_017857	CGC	2	6	118126	118131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126018
1548	NC_017857	GTT	2	6	118246	118251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126018
1549	NC_017857	CCA	2	6	118254	118259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126018
1550	NC_017857	CAT	2	6	118411	118416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126018
1551	NC_017857	GAA	3	9	118490	118498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126018
1552	NC_017857	CCA	2	6	118689	118694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126018
1553	NC_017857	GTG	2	6	118712	118717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126018
1554	NC_017857	ATC	2	6	118741	118746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126018
1555	NC_017857	CAA	2	6	118752	118757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126018
1556	NC_017857	ATT	2	6	118840	118845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126018
1557	NC_017857	CTG	2	6	118929	118934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126018
1558	NC_017857	GCA	2	6	118974	118979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126018
1559	NC_017857	CGT	2	6	119004	119009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126018
1560	NC_017857	CAT	2	6	119025	119030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126018
1561	NC_017857	TCA	2	6	119141	119146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126018
1562	NC_017857	CAG	2	6	119193	119198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126018
1563	NC_017857	GGT	2	6	119212	119217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126018
1564	NC_017857	GTC	2	6	119221	119226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126018
1565	NC_017857	TTC	2	6	119284	119289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126018
1566	NC_017857	CTG	2	6	119424	119429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126018
1567	NC_017857	CTG	2	6	119435	119440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126018
1568	NC_017857	ATT	2	6	119575	119580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126018
1569	NC_017857	TTG	2	6	119599	119604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126018
1570	NC_017857	AGA	2	6	119661	119666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126018
1571	NC_017857	ATG	2	6	119690	119695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126018
1572	NC_017857	CCA	3	9	119696	119704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126018
1573	NC_017857	ACA	2	6	119708	119713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126018
1574	NC_017857	CGA	2	6	119753	119758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126018
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1577	NC_017857	AAC	3	9	120036	120044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126019
1578	NC_017857	TTA	2	6	120106	120111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126019
1579	NC_017857	CAG	2	6	120164	120169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126019
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1581	NC_017857	AAC	2	6	120297	120302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126019
1582	NC_017857	TCT	2	6	120460	120465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126019
1583	NC_017857	AGC	2	6	120495	120500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126019
1584	NC_017857	GGC	2	6	120685	120690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126019
1585	NC_017857	GAA	2	6	120697	120702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126019
1586	NC_017857	GCT	2	6	120706	120711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126019
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1589	NC_017857	TCA	2	6	121420	121425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126020
1590	NC_017857	TGA	2	6	121477	121482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126020
1591	NC_017857	CCA	2	6	121508	121513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126020
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1593	NC_017857	CAG	2	6	121590	121595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126020
1594	NC_017857	ATC	2	6	121603	121608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126020
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1599	NC_017857	ATG	2	6	121879	121884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126020
1600	NC_017857	ATT	2	6	121896	121901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126020
1601	NC_017857	AAG	2	6	121911	121916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126020
1602	NC_017857	TTG	2	6	121945	121950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126020
1603	NC_017857	GAC	2	6	122040	122045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126020
1604	NC_017857	AGC	2	6	122061	122066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126020
1605	NC_017857	GCT	2	6	122115	122120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126020
1606	NC_017857	TCA	2	6	122158	122163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126020
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1610	NC_017857	AAT	2	6	122345	122350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126020
1611	NC_017857	CAG	2	6	122378	122383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126021
1612	NC_017857	GAC	2	6	122456	122461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126021
1613	NC_017857	CTC	2	6	122484	122489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387126021
1614	NC_017857	CAG	2	6	122520	122525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126021
1615	NC_017857	GTA	2	6	122570	122575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126021
1616	NC_017857	CAT	3	9	122675	122683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126021
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2000	NC_017857	GGC	2	6	149835	149840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126044

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