MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 41351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017857	AGG	2	6	342637	342642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_017857	AGC	2	6	342674	342679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_017857	AAT	2	6	342685	342690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_017857	TCA	2	6	342707	342712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_017857	TGC	2	6	342717	342722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_017857	CTT	2	6	342738	342743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_017857	AGC	2	6	342983	342988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_017857	TGC	2	6	343029	343034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_017857	ATC	2	6	343281	343286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126234
4510	NC_017857	ATG	2	6	343417	343422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126234
4511	NC_017857	AAT	2	6	343458	343463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126235
4512	NC_017857	CAT	2	6	343486	343491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126235
4513	NC_017857	GCT	2	6	343518	343523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126235
4514	NC_017857	GGC	2	6	343665	343670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126236
4515	NC_017857	GCG	2	6	343876	343881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126236
4516	NC_017857	GGC	2	6	344033	344038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126236
4517	NC_017857	AGC	2	6	344041	344046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126236
4518	NC_017857	TGG	2	6	344095	344100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126237
4519	NC_017857	TGA	2	6	344168	344173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126237
4520	NC_017857	ATC	2	6	344195	344200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126237
4521	NC_017857	TAA	2	6	344234	344239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126237
4522	NC_017857	ACC	2	6	344296	344301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126237
4523	NC_017857	CCG	2	6	344370	344375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126237
4524	NC_017857	CAT	2	6	344619	344624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126237
4525	NC_017857	GCC	2	6	344686	344691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126237
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4528	NC_017857	GAT	2	6	345074	345079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126237
4529	NC_017857	ATT	2	6	345132	345137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_017857	GGT	2	6	345151	345156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_017857	CGT	2	6	345300	345305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126238
4532	NC_017857	CAA	2	6	345373	345378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126238
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4534	NC_017857	AGC	2	6	345401	345406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126238
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4537	NC_017857	GAT	2	6	345641	345646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126239
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4539	NC_017857	TGA	2	6	345721	345726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126239
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4543	NC_017857	TGA	2	6	345867	345872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126239
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4551	NC_017857	CAA	2	6	346530	346535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126240
4552	NC_017857	TCG	2	6	346641	346646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126240
4553	NC_017857	GGT	2	6	346666	346671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126240
4554	NC_017857	TCG	2	6	346779	346784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126240
4555	NC_017857	ATT	2	6	346924	346929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126240
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4557	NC_017857	GGT	2	6	347002	347007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126240
4558	NC_017857	GCT	2	6	347077	347082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126240
4559	NC_017857	TCA	2	6	347088	347093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126240
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4572	NC_017857	CTG	2	6	348237	348242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126241
4573	NC_017857	TGA	2	6	348368	348373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126241
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4600	NC_017857	ACC	2	6	349875	349880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126242
4601	NC_017857	AGT	2	6	349950	349955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126242
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4614	NC_017857	TGA	2	6	351034	351039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_017857	GGT	2	6	351197	351202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4617	NC_017857	ATT	2	6	351369	351374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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