MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 41351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017857	TGC	2	6	230924	230929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126118
3002	NC_017857	AAT	3	9	231103	231111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126118
3003	NC_017857	TCA	2	6	231204	231209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_017857	AGC	3	9	231360	231368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126119
3005	NC_017857	TCA	2	6	231379	231384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126119
3006	NC_017857	TTC	2	6	231600	231605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126119
3007	NC_017857	TCA	2	6	231688	231693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126120
3008	NC_017857	GAA	2	6	231825	231830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126120
3009	NC_017857	TCT	2	6	231883	231888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126120
3010	NC_017857	ATA	2	6	231919	231924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126120
3011	NC_017857	CAA	2	6	231992	231997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126120
3012	NC_017857	GGT	2	6	232107	232112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126120
3013	NC_017857	TTC	2	6	232218	232223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126120
3014	NC_017857	GAA	2	6	232320	232325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126120
3015	NC_017857	TCA	2	6	232342	232347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126120
3016	NC_017857	GAA	2	6	232350	232355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126120
3017	NC_017857	TGG	2	6	232401	232406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126120
3018	NC_017857	CAT	2	6	232560	232565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126120
3019	NC_017857	CAC	2	6	232589	232594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126120
3020	NC_017857	ACC	2	6	232611	232616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126120
3021	NC_017857	TCA	2	6	232687	232692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126120
3022	NC_017857	CTT	2	6	232727	232732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126120
3023	NC_017857	TCG	2	6	232750	232755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126120
3024	NC_017857	AGT	2	6	232863	232868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126120
3025	NC_017857	CAT	2	6	232952	232957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126120
3026	NC_017857	GCT	2	6	233064	233069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_017857	CAA	2	6	233107	233112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126121
3028	NC_017857	TGT	2	6	233152	233157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126121
3029	NC_017857	TCA	2	6	233172	233177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126121
3030	NC_017857	CAA	2	6	233251	233256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126121
3031	NC_017857	ATC	2	6	233297	233302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126121
3032	NC_017857	CTT	2	6	233308	233313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126121
3033	NC_017857	TGA	2	6	233343	233348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126121
3034	NC_017857	GAA	2	6	233573	233578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126121
3035	NC_017857	GCA	2	6	233650	233655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126121
3036	NC_017857	CTT	2	6	233656	233661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126121
3037	NC_017857	CCA	2	6	233682	233687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126121
3038	NC_017857	GAA	2	6	233703	233708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126121
3039	NC_017857	GTT	2	6	233728	233733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126121
3040	NC_017857	GCC	2	6	233832	233837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126121
3041	NC_017857	CCA	2	6	233872	233877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126121
3042	NC_017857	TCT	2	6	233896	233901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_017857	TCA	2	6	234029	234034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126122
3044	NC_017857	AGT	2	6	234043	234048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126122
3045	NC_017857	CAG	2	6	234094	234099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126122
3046	NC_017857	CAT	2	6	234135	234140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126122
3047	NC_017857	TCA	2	6	234266	234271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126122
3048	NC_017857	ACC	3	9	234334	234342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126122
3049	NC_017857	TGA	2	6	234351	234356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126122
3050	NC_017857	CAC	2	6	234372	234377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126122
3051	NC_017857	TGG	2	6	234480	234485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126122
3052	NC_017857	GAT	2	6	234520	234525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126122
3053	NC_017857	TGC	2	6	234604	234609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126122
3054	NC_017857	TGG	2	6	234667	234672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126122
3055	NC_017857	ACG	2	6	234673	234678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126122
3056	NC_017857	TAA	2	6	234679	234684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126122
3057	NC_017857	TCA	2	6	234725	234730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126122
3058	NC_017857	GAT	2	6	234733	234738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126122
3059	NC_017857	AGC	2	6	234811	234816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126122
3060	NC_017857	GAT	2	6	234841	234846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126122
3061	NC_017857	AGA	2	6	234898	234903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126122
3062	NC_017857	ATC	2	6	235040	235045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126122
3063	NC_017857	CAA	2	6	235185	235190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126122
3064	NC_017857	CTG	2	6	235491	235496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126122
3065	NC_017857	CAG	2	6	235621	235626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126123
3066	NC_017857	TTA	2	6	235728	235733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126123
3067	NC_017857	ATT	2	6	235813	235818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126123
3068	NC_017857	AGC	2	6	235829	235834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126123
3069	NC_017857	TCA	2	6	235898	235903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126123
3070	NC_017857	AGC	2	6	235945	235950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126123
3071	NC_017857	TCA	2	6	236123	236128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126124
3072	NC_017857	TCA	2	6	236192	236197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126124
3073	NC_017857	TCG	2	6	236282	236287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126124
3074	NC_017857	TTC	2	6	236443	236448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126124
3075	NC_017857	GGC	2	6	236465	236470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126124
3076	NC_017857	CGA	2	6	236493	236498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126124
3077	NC_017857	GAA	2	6	236674	236679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126125
3078	NC_017857	ACC	2	6	236737	236742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126125
3079	NC_017857	GCA	2	6	236762	236767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126125
3080	NC_017857	ATC	2	6	236786	236791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126125
3081	NC_017857	ATG	2	6	236887	236892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126126
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3083	NC_017857	TGG	2	6	237036	237041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126126
3084	NC_017857	AAC	2	6	237083	237088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126126
3085	NC_017857	ACC	2	6	237196	237201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126126
3086	NC_017857	GAA	2	6	237298	237303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126126
3087	NC_017857	TCA	2	6	237393	237398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126126
3088	NC_017857	ATC	2	6	237478	237483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126126
3089	NC_017857	GAA	2	6	237562	237567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126126
3090	NC_017857	CAT	2	6	237571	237576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126126
3091	NC_017857	GCT	2	6	237641	237646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126126
3092	NC_017857	ATC	2	6	237673	237678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126126
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3094	NC_017857	TTC	2	6	237772	237777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126126
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3096	NC_017857	TTA	2	6	238120	238125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_017857	GCT	2	6	238280	238285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_017857	TCA	2	6	238487	238492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126128
3099	NC_017857	AAT	2	6	238500	238505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126128
3100	NC_017857	GCT	2	6	238578	238583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126128
3101	NC_017857	TTC	2	6	238597	238602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126128
3102	NC_017857	CGA	2	6	238655	238660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126128
3103	NC_017857	GTT	2	6	238665	238670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126128
3104	NC_017857	CAT	3	9	238800	238808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126128
3105	NC_017857	TTC	2	6	238894	238899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126128
3106	NC_017857	GCG	2	6	239053	239058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126128
3107	NC_017857	CCG	2	6	239084	239089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126128
3108	NC_017857	ACA	2	6	239102	239107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126128
3109	NC_017857	TTC	2	6	239149	239154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126128
3110	NC_017857	GAT	2	6	239477	239482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126129
3111	NC_017857	ATT	2	6	239543	239548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126129
3112	NC_017857	GCA	2	6	239629	239634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126129
3113	NC_017857	ATA	2	6	239657	239662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126129
3114	NC_017857	CCA	2	6	239698	239703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126129
3115	NC_017857	CGG	2	6	239833	239838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126129
3116	NC_017857	ATG	2	6	239892	239897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126129
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3118	NC_017857	CCG	2	6	240203	240208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126130
3119	NC_017857	CAT	2	6	240267	240272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126130
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3230	NC_017857	ATA	2	6	247197	247202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126137
3231	NC_017857	CAG	2	6	247215	247220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126137
3232	NC_017857	CAT	2	6	247231	247236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126137
3233	NC_017857	CGG	2	6	247422	247427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126137
3234	NC_017857	ACG	2	6	247546	247551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126137
3235	NC_017857	GTG	2	6	247589	247594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126137
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3475	NC_017857	TGC	2	6	265543	265548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126153
3476	NC_017857	CGA	2	6	265778	265783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126153
3477	NC_017857	ATG	2	6	265869	265874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126153
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3485	NC_017857	CAG	2	6	266397	266402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126153
3486	NC_017857	ACA	2	6	266410	266415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126153
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3488	NC_017857	ATT	2	6	266804	266809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126153
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3499	NC_017857	CTG	2	6	267284	267289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126154
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