MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 41351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_017857	TGA	2	6	3109388	3109393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128898
41002	NC_017857	TCA	2	6	3109399	3109404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128898
41003	NC_017857	GAC	2	6	3109475	3109480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128898
41004	NC_017857	TGT	2	6	3109495	3109500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128898
41005	NC_017857	CAT	2	6	3109547	3109552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128898
41006	NC_017857	CCT	2	6	3110012	3110017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41007	NC_017857	AGT	2	6	3110169	3110174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41008	NC_017857	CAA	2	6	3110223	3110228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41009	NC_017857	AGC	2	6	3110348	3110353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41010	NC_017857	CAC	2	6	3110511	3110516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41011	NC_017857	TGC	2	6	3110670	3110675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128899
41012	NC_017857	ATT	2	6	3110901	3110906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387128900
41013	NC_017857	TAT	2	6	3110907	3110912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387128900
41014	NC_017857	TTG	2	6	3110965	3110970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128900
41015	NC_017857	ATT	2	6	3111183	3111188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387128900
41016	NC_017857	TTA	2	6	3111200	3111205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387128900
41017	NC_017857	CTG	2	6	3111303	3111308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128900
41018	NC_017857	TCA	2	6	3111323	3111328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128901
41019	NC_017857	ACA	2	6	3111341	3111346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128901
41020	NC_017857	TGA	2	6	3111375	3111380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128901
41021	NC_017857	TTA	2	6	3111554	3111559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387128901
41022	NC_017857	ATG	2	6	3111566	3111571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128901
41023	NC_017857	TGC	2	6	3111593	3111598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128901
41024	NC_017857	TGG	2	6	3111626	3111631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387128901
41025	NC_017857	CCA	2	6	3111641	3111646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387128901
41026	NC_017857	GGT	2	6	3111675	3111680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387128901
41027	NC_017857	ATT	2	6	3111788	3111793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387128901
41028	NC_017857	GTT	2	6	3111863	3111868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128902
41029	NC_017857	CTT	2	6	3111891	3111896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128902
41030	NC_017857	CTG	2	6	3111917	3111922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128902
41031	NC_017857	TCA	2	6	3111973	3111978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128902
41032	NC_017857	GCA	2	6	3111994	3111999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128902
41033	NC_017857	CTG	2	6	3112019	3112024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128902
41034	NC_017857	ATC	2	6	3112114	3112119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128902
41035	NC_017857	TTC	2	6	3112143	3112148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128902
41036	NC_017857	TCA	2	6	3112165	3112170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128902
41037	NC_017857	GGC	2	6	3112226	3112231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128902
41038	NC_017857	AAT	2	6	3112372	3112377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387128902
41039	NC_017857	TGT	2	6	3112444	3112449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128902
41040	NC_017857	TCA	2	6	3112753	3112758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41041	NC_017857	CAT	2	6	3112845	3112850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41042	NC_017857	CTG	2	6	3112879	3112884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41043	NC_017857	GGT	2	6	3113178	3113183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387128903
41044	NC_017857	GTA	2	6	3113209	3113214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128903
41045	NC_017857	TTA	2	6	3113220	3113225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387128903
41046	NC_017857	GAT	2	6	3113235	3113240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128903
41047	NC_017857	TTG	2	6	3113251	3113256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128903
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41050	NC_017857	GAA	2	6	3113340	3113345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387128903
41051	NC_017857	TGT	2	6	3113360	3113365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128903
41052	NC_017857	ATG	2	6	3113446	3113451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128903
41053	NC_017857	ATG	2	6	3113599	3113604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128903
41054	NC_017857	TGA	2	6	3113641	3113646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128903
41055	NC_017857	CAT	2	6	3113789	3113794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128903
41056	NC_017857	CAT	2	6	3113871	3113876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128903
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41083	NC_017857	CGC	3	9	3115657	3115665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128906
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41088	NC_017857	CAT	2	6	3116048	3116053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128907
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41101	NC_017857	GGT	2	6	3116775	3116780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387128907
41102	NC_017857	CAC	2	6	3116819	3116824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387128907
41103	NC_017857	ATG	2	6	3116899	3116904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128907
41104	NC_017857	CAG	2	6	3117012	3117017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41107	NC_017857	CTG	2	6	3117227	3117232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128908
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