MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 27908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020834	CTG	2	6	312383	312388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335556
3502	NC_020834	TAA	2	6	312522	312527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335556
3503	NC_020834	ATG	2	6	312656	312661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335556
3504	NC_020834	GTA	2	6	312827	312832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335556
3505	NC_020834	TGC	2	6	312876	312881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335556
3506	NC_020834	GTG	2	6	312913	312918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335556
3507	NC_020834	GTT	2	6	313292	313297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335557
3508	NC_020834	CAA	2	6	313370	313375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335557
3509	NC_020834	TGG	2	6	313617	313622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335557
3510	NC_020834	TGT	2	6	313674	313679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335557
3511	NC_020834	TTG	2	6	313737	313742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335557
3512	NC_020834	AAT	2	6	313994	313999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335557
3513	NC_020834	TGA	2	6	314034	314039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335557
3514	NC_020834	CAA	2	6	314044	314049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335557
3515	NC_020834	ATT	2	6	314076	314081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335557
3516	NC_020834	ATC	2	6	314262	314267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335557
3517	NC_020834	TCA	2	6	314617	314622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335557
3518	NC_020834	ATT	2	6	314676	314681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335557
3519	NC_020834	CTG	2	6	314702	314707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335557
3520	NC_020834	TCT	2	6	314718	314723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335557
3521	NC_020834	GTG	2	6	314772	314777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335557
3522	NC_020834	CAG	2	6	315014	315019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335558
3523	NC_020834	AAG	2	6	315149	315154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335558
3524	NC_020834	CGG	2	6	315204	315209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335558
3525	NC_020834	TCA	2	6	315281	315286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335558
3526	NC_020834	AAG	2	6	315392	315397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335558
3527	NC_020834	TGG	2	6	315455	315460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335558
3528	NC_020834	CGA	2	6	315462	315467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335558
3529	NC_020834	ATT	2	6	315500	315505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335558
3530	NC_020834	TCC	2	6	315622	315627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472335558
3531	NC_020834	ATA	2	6	315683	315688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335558
3532	NC_020834	ATC	2	6	315721	315726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335558
3533	NC_020834	CTT	2	6	315914	315919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335558
3534	NC_020834	AGA	2	6	315933	315938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335558
3535	NC_020834	GAT	2	6	316546	316551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335558
3536	NC_020834	CAA	2	6	316573	316578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335558
3537	NC_020834	ATG	2	6	316751	316756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335558
3538	NC_020834	GCA	2	6	316801	316806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335558
3539	NC_020834	GAC	2	6	316915	316920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335558
3540	NC_020834	ACA	2	6	316949	316954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335558
3541	NC_020834	GCT	2	6	317097	317102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335558
3542	NC_020834	CCA	2	6	317133	317138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335558
3543	NC_020834	GAC	2	6	317194	317199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335558
3544	NC_020834	ACC	2	6	317218	317223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335558
3545	NC_020834	ATC	2	6	317245	317250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335558
3546	NC_020834	TCG	2	6	317342	317347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335558
3547	NC_020834	CGG	2	6	317379	317384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335558
3548	NC_020834	ACA	2	6	317543	317548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335558
3549	NC_020834	CAG	2	6	317565	317570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335558
3550	NC_020834	AAC	2	6	317579	317584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335558
3551	NC_020834	GAA	2	6	317607	317612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335558
3552	NC_020834	GAG	2	6	317695	317700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335558
3553	NC_020834	CAA	2	6	318456	318461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335559
3554	NC_020834	TAA	2	6	318487	318492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335559
3555	NC_020834	GCC	2	6	318592	318597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335559
3556	NC_020834	TGA	2	6	318733	318738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335559
3557	NC_020834	ATT	2	6	318832	318837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335559
3558	NC_020834	TTA	2	6	318990	318995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335560
3559	NC_020834	CCG	2	6	319024	319029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335560
3560	NC_020834	GGA	2	6	319226	319231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335560
3561	NC_020834	TCA	2	6	319248	319253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335560
3562	NC_020834	TCA	2	6	319365	319370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335560
3563	NC_020834	GTG	2	6	319655	319660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335560
3564	NC_020834	AAT	2	6	319811	319816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335560
3565	NC_020834	TCA	3	9	319870	319878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335560
3566	NC_020834	AAC	2	6	320075	320080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335561
3567	NC_020834	GTT	2	6	320297	320302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335561
3568	NC_020834	GTT	2	6	320366	320371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335561
3569	NC_020834	TTC	2	6	320379	320384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335561
3570	NC_020834	TCA	2	6	320449	320454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335561
3571	NC_020834	GGA	2	6	320605	320610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335561
3572	NC_020834	CAC	2	6	320779	320784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335562
3573	NC_020834	TTC	2	6	320905	320910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335562
3574	NC_020834	TAA	2	6	320954	320959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335563
3575	NC_020834	CTC	2	6	321174	321179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472335563
3576	NC_020834	CTG	2	6	321280	321285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335563
3577	NC_020834	TTG	2	6	321486	321491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335563
3578	NC_020834	GCG	2	6	321492	321497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335563
3579	NC_020834	CCA	2	6	321500	321505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335563
3580	NC_020834	TAT	2	6	321552	321557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335564
3581	NC_020834	ACC	2	6	321636	321641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335564
3582	NC_020834	TAT	2	6	322041	322046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335565
3583	NC_020834	TCC	2	6	322187	322192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472335565
3584	NC_020834	ATC	2	6	322247	322252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335565
3585	NC_020834	TAA	2	6	322253	322258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335565
3586	NC_020834	GAT	2	6	322453	322458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335565
3587	NC_020834	GCA	2	6	322491	322496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335565
3588	NC_020834	TTC	2	6	322607	322612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335565
3589	NC_020834	ATT	2	6	322673	322678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335565
3590	NC_020834	GTG	2	6	322748	322753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335565
3591	NC_020834	ATG	2	6	322796	322801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335565
3592	NC_020834	CTG	2	6	322852	322857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335565
3593	NC_020834	TCT	2	6	322906	322911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335566
3594	NC_020834	TGC	2	6	323156	323161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335567
3595	NC_020834	TAA	2	6	323206	323211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335567
3596	NC_020834	TGA	2	6	323337	323342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335567
3597	NC_020834	ATT	2	6	323364	323369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335567
3598	NC_020834	CAT	2	6	323511	323516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335568
3599	NC_020834	ATA	2	6	323642	323647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335568
3600	NC_020834	TCA	2	6	323678	323683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335568
3601	NC_020834	GCC	2	6	323720	323725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335568
3602	NC_020834	TTG	2	6	323791	323796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335568
3603	NC_020834	CGG	2	6	323985	323990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335568
3604	NC_020834	TTG	2	6	324023	324028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335568
3605	NC_020834	TTC	2	6	324058	324063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335568
3606	NC_020834	CAC	2	6	324093	324098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335568
3607	NC_020834	TTG	2	6	324190	324195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335568
3608	NC_020834	AGT	2	6	324377	324382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335568
3609	NC_020834	CTG	3	9	324441	324449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335568
3610	NC_020834	GGA	2	6	324719	324724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335569
3611	NC_020834	CAA	2	6	324763	324768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335569
3612	NC_020834	ATT	2	6	324785	324790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335569
3613	NC_020834	ATT	2	6	324824	324829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335569
3614	NC_020834	TGA	2	6	324935	324940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335569
3615	NC_020834	CAA	2	6	325023	325028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335569
3616	NC_020834	GAT	2	6	325043	325048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335569
3617	NC_020834	GGA	2	6	325091	325096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335569
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