MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 27908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020834	GCG	2	6	43955	43960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335280
502	NC_020834	TTC	2	6	44009	44014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335280
503	NC_020834	GTG	2	6	44066	44071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335280
504	NC_020834	CTT	2	6	44074	44079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335280
505	NC_020834	CGG	2	6	44151	44156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335280
506	NC_020834	TTC	2	6	44245	44250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335280
507	NC_020834	GTC	2	6	44297	44302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335280
508	NC_020834	CGC	2	6	44441	44446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335280
509	NC_020834	AGA	2	6	44489	44494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335280
510	NC_020834	ATC	2	6	44526	44531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335280
511	NC_020834	CCG	2	6	44571	44576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335280
512	NC_020834	ACC	2	6	44873	44878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335280
513	NC_020834	TGC	2	6	44939	44944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335280
514	NC_020834	CTT	2	6	45010	45015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335280
515	NC_020834	CTT	2	6	45292	45297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335280
516	NC_020834	AGT	2	6	45328	45333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335280
517	NC_020834	CAT	2	6	45565	45570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335281
518	NC_020834	TGA	2	6	45730	45735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335281
519	NC_020834	TGA	2	6	45780	45785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335281
520	NC_020834	AAT	2	6	45876	45881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335281
521	NC_020834	CAG	2	6	45976	45981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335281
522	NC_020834	TGT	2	6	46039	46044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335281
523	NC_020834	TGT	2	6	46086	46091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335281
524	NC_020834	TCT	2	6	46230	46235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335281
525	NC_020834	CTA	2	6	46246	46251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335281
526	NC_020834	CGG	2	6	46299	46304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335281
527	NC_020834	TTG	2	6	46334	46339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335281
528	NC_020834	GAG	2	6	46359	46364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335281
529	NC_020834	AAT	2	6	46403	46408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335281
530	NC_020834	TCT	2	6	46443	46448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335281
531	NC_020834	AAG	2	6	46507	46512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335281
532	NC_020834	ATC	2	6	46662	46667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335281
533	NC_020834	GTG	2	6	47342	47347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335282
534	NC_020834	TAT	2	6	47370	47375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335282
535	NC_020834	TGT	2	6	47415	47420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335282
536	NC_020834	GTT	2	6	47421	47426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335282
537	NC_020834	ATT	2	6	47448	47453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335282
538	NC_020834	ATA	2	6	47459	47464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335282
539	NC_020834	CAC	2	6	47491	47496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335282
540	NC_020834	CAG	2	6	47535	47540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335283
541	NC_020834	TTC	2	6	47612	47617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335283
542	NC_020834	CAA	2	6	47673	47678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335283
543	NC_020834	TTG	2	6	47706	47711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335283
544	NC_020834	TAT	2	6	47812	47817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335283
545	NC_020834	TTA	2	6	48231	48236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335283
546	NC_020834	ATG	2	6	48257	48262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335283
547	NC_020834	CAA	2	6	48447	48452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335284
548	NC_020834	TTA	2	6	48470	48475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335284
549	NC_020834	GCT	2	6	48482	48487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335284
550	NC_020834	TTG	2	6	48792	48797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335285
551	NC_020834	AGA	2	6	48841	48846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335285
552	NC_020834	AGA	2	6	48949	48954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335285
553	NC_020834	CAA	2	6	48978	48983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335285
554	NC_020834	CGT	2	6	48986	48991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335285
555	NC_020834	TAT	2	6	49042	49047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335285
556	NC_020834	AAG	2	6	49092	49097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335285
557	NC_020834	AAC	2	6	49175	49180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335285
558	NC_020834	ATT	2	6	49184	49189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335285
559	NC_020834	GCA	2	6	49310	49315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335286
560	NC_020834	GCC	2	6	49332	49337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335286
561	NC_020834	TCA	2	6	49374	49379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335286
562	NC_020834	GTT	2	6	49557	49562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335286
563	NC_020834	AAG	2	6	49588	49593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335286
564	NC_020834	TCA	2	6	49647	49652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335286
565	NC_020834	ATG	3	9	49690	49698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335286
566	NC_020834	GTA	2	6	49711	49716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335286
567	NC_020834	TTA	2	6	50079	50084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335287
568	NC_020834	ATC	2	6	50319	50324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335287
569	NC_020834	GTG	2	6	50394	50399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335287
570	NC_020834	AGA	2	6	50408	50413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335287
571	NC_020834	CTG	2	6	50464	50469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335287
572	NC_020834	GTG	2	6	50527	50532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335287
573	NC_020834	GAT	2	6	50553	50558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335287
574	NC_020834	TTA	2	6	50598	50603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335287
575	NC_020834	TTA	2	6	50661	50666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335287
576	NC_020834	ATC	2	6	50757	50762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335287
577	NC_020834	GGT	2	6	50904	50909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335287
578	NC_020834	AAG	2	6	50931	50936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335287
579	NC_020834	GGT	2	6	50943	50948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335287
580	NC_020834	TGA	2	6	51011	51016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335287
581	NC_020834	TTG	2	6	51060	51065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335287
582	NC_020834	AGC	3	9	51116	51124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335287
583	NC_020834	GAT	2	6	51141	51146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335287
584	NC_020834	TTA	2	6	51183	51188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335287
585	NC_020834	ATA	2	6	51335	51340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335288
586	NC_020834	GGC	2	6	51456	51461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335288
587	NC_020834	TAG	2	6	51575	51580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335288
588	NC_020834	TGG	2	6	51603	51608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335288
589	NC_020834	TGG	2	6	51689	51694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335288
590	NC_020834	TGA	2	6	51834	51839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335288
591	NC_020834	ACA	2	6	51894	51899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335288
592	NC_020834	TTA	2	6	51985	51990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335288
593	NC_020834	GCT	2	6	52063	52068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335288
594	NC_020834	TGG	2	6	52073	52078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335288
595	NC_020834	AGC	2	6	52086	52091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335288
596	NC_020834	GCA	2	6	52195	52200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335288
597	NC_020834	ATC	2	6	52251	52256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335289
598	NC_020834	ATG	2	6	52306	52311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335289
599	NC_020834	CAA	3	9	52347	52355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335289
600	NC_020834	TAT	2	6	52478	52483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335289
601	NC_020834	TGA	2	6	52505	52510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335289
602	NC_020834	GAA	3	9	52527	52535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335289
603	NC_020834	GCA	2	6	52554	52559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335289
604	NC_020834	GAA	2	6	52569	52574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335289
605	NC_020834	GGT	2	6	52644	52649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335289
606	NC_020834	GGT	2	6	52665	52670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335289
607	NC_020834	ATG	2	6	52695	52700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335289
608	NC_020834	TGA	2	6	52913	52918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335289
609	NC_020834	TAT	2	6	52930	52935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335289
610	NC_020834	TTA	2	6	52989	52994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335289
611	NC_020834	AGA	2	6	53036	53041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335289
612	NC_020834	CGG	2	6	53116	53121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335289
613	NC_020834	GGT	2	6	53174	53179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335289
614	NC_020834	CGG	2	6	53215	53220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335289
615	NC_020834	GTG	2	6	53293	53298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335289
616	NC_020834	CAT	2	6	53336	53341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335289
617	NC_020834	GAC	2	6	53373	53378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335289
618	NC_020834	TTG	2	6	53386	53391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335289
619	NC_020834	TTA	2	6	53751	53756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335290
620	NC_020834	AGA	2	6	53804	53809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335290
621	NC_020834	GGT	2	6	53826	53831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335290
622	NC_020834	GTG	2	6	53884	53889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335290
623	NC_020834	AGA	2	6	53933	53938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335290
624	NC_020834	TTA	2	6	54168	54173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335291
625	NC_020834	GTA	2	6	54248	54253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335291
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