MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 27908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020834	CCA	2	6	358987	358992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335606
4002	NC_020834	GCC	2	6	359240	359245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335606
4003	NC_020834	TCA	2	6	359248	359253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335606
4004	NC_020834	CCG	2	6	359311	359316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335606
4005	NC_020834	ATG	2	6	359355	359360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335606
4006	NC_020834	CAC	2	6	359369	359374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335606
4007	NC_020834	ATT	2	6	359546	359551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335606
4008	NC_020834	TGA	2	6	359614	359619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335606
4009	NC_020834	GTC	2	6	359633	359638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335606
4010	NC_020834	AAG	2	6	359640	359645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335606
4011	NC_020834	TGA	2	6	359670	359675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335606
4012	NC_020834	TCA	2	6	359698	359703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335606
4013	NC_020834	ACT	2	6	359707	359712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335606
4014	NC_020834	ATT	2	6	359906	359911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335607
4015	NC_020834	ATT	2	6	360129	360134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335607
4016	NC_020834	ATT	2	6	360285	360290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335607
4017	NC_020834	ATA	2	6	360579	360584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335607
4018	NC_020834	GAA	2	6	360646	360651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335607
4019	NC_020834	GAA	2	6	360681	360686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335607
4020	NC_020834	TGG	2	6	360733	360738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335607
4021	NC_020834	TTC	2	6	360988	360993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335608
4022	NC_020834	TGG	2	6	361022	361027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335608
4023	NC_020834	TTG	2	6	361051	361056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335608
4024	NC_020834	TCA	2	6	361220	361225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335608
4025	NC_020834	CGA	2	6	361260	361265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335608
4026	NC_020834	TCT	2	6	361349	361354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335608
4027	NC_020834	TGG	2	6	361355	361360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335608
4028	NC_020834	GCA	2	6	361364	361369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335608
4029	NC_020834	TGG	2	6	361379	361384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335608
4030	NC_020834	ACT	2	6	361387	361392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335608
4031	NC_020834	TTC	2	6	361435	361440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335608
4032	NC_020834	TTG	2	6	361516	361521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335608
4033	NC_020834	GGC	2	6	361685	361690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335608
4034	NC_020834	TCA	2	6	361763	361768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335608
4035	NC_020834	ACC	2	6	361853	361858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335608
4036	NC_020834	AGT	2	6	361870	361875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335608
4037	NC_020834	GAA	2	6	362071	362076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335608
4038	NC_020834	ATG	2	6	362606	362611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335609
4039	NC_020834	TGT	2	6	362619	362624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335609
4040	NC_020834	CAA	3	9	362637	362645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335609
4041	NC_020834	CTG	2	6	362927	362932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335610
4042	NC_020834	AAT	2	6	363304	363309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335610
4043	NC_020834	TAC	2	6	363405	363410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335610
4044	NC_020834	GCA	2	6	363412	363417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335610
4045	NC_020834	TGT	2	6	363423	363428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335610
4046	NC_020834	GGT	2	6	363580	363585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335610
4047	NC_020834	TGG	2	6	363630	363635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335610
4048	NC_020834	GAA	2	6	363655	363660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335610
4049	NC_020834	GTT	2	6	363685	363690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335610
4050	NC_020834	TTC	2	6	363777	363782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335610
4051	NC_020834	CTG	2	6	363821	363826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335610
4052	NC_020834	TGA	2	6	363870	363875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335610
4053	NC_020834	TGT	2	6	363900	363905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335610
4054	NC_020834	ATG	2	6	364052	364057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335610
4055	NC_020834	CAG	2	6	364280	364285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335610
4056	NC_020834	GCA	2	6	364351	364356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335610
4057	NC_020834	CAG	2	6	364415	364420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335610
4058	NC_020834	GCA	2	6	364534	364539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335610
4059	NC_020834	TGT	2	6	364614	364619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335610
4060	NC_020834	TGG	2	6	364770	364775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335610
4061	NC_020834	TGT	2	6	364782	364787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335610
4062	NC_020834	CAA	2	6	364862	364867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335610
4063	NC_020834	AAG	2	6	365015	365020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335610
4064	NC_020834	ACA	2	6	365076	365081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335611
4065	NC_020834	AGA	3	9	365102	365110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335611
4066	NC_020834	TGG	2	6	365174	365179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335611
4067	NC_020834	AAG	2	6	365200	365205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335611
4068	NC_020834	CAG	2	6	365206	365211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335611
4069	NC_020834	GCA	2	6	365244	365249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335611
4070	NC_020834	ATG	2	6	365389	365394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335611
4071	NC_020834	AGC	3	9	365471	365479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335611
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4073	NC_020834	TAA	2	6	365670	365675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335612
4074	NC_020834	GTA	2	6	365695	365700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335612
4075	NC_020834	GAT	2	6	365740	365745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335612
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4077	NC_020834	AAT	2	6	365893	365898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335612
4078	NC_020834	CAG	2	6	366002	366007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335612
4079	NC_020834	TGG	2	6	366021	366026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335612
4080	NC_020834	ACA	2	6	366190	366195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335612
4081	NC_020834	GCG	2	6	366218	366223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335612
4082	NC_020834	GGT	2	6	366226	366231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335612
4083	NC_020834	AGC	2	6	366246	366251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335612
4084	NC_020834	ATA	2	6	366284	366289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335612
4085	NC_020834	AAC	2	6	366292	366297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335612
4086	NC_020834	AAT	2	6	366316	366321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335612
4087	NC_020834	AGC	2	6	366345	366350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335612
4088	NC_020834	AGC	2	6	366357	366362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335612
4089	NC_020834	ACC	2	6	366364	366369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335612
4090	NC_020834	TGG	2	6	366789	366794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335612
4091	NC_020834	GAA	2	6	366925	366930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335612
4092	NC_020834	ATG	2	6	367079	367084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335612
4093	NC_020834	AAT	2	6	367087	367092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335612
4094	NC_020834	TGA	2	6	367104	367109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335612
4095	NC_020834	TGA	2	6	367119	367124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335612
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4098	NC_020834	AAG	2	6	367295	367300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335612
4099	NC_020834	GAT	2	6	367330	367335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335612
4100	NC_020834	AGC	2	6	367345	367350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335612
4101	NC_020834	TGA	2	6	367380	367385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335612
4102	NC_020834	AAT	2	6	367399	367404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335612
4103	NC_020834	TAA	2	6	367440	367445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335612
4104	NC_020834	GAT	2	6	367489	367494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335612
4105	NC_020834	CAG	2	6	367505	367510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335612
4106	NC_020834	AAT	2	6	367513	367518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335612
4107	NC_020834	GCA	2	6	367549	367554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335612
4108	NC_020834	TTA	2	6	367643	367648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335612
4109	NC_020834	AGT	2	6	367813	367818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335612
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4112	NC_020834	ACT	2	6	368008	368013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335612
4113	NC_020834	TAC	2	6	368040	368045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335612
4114	NC_020834	AAC	2	6	368098	368103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335612
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4116	NC_020834	TAA	2	6	368208	368213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335612
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4242	NC_020834	TGA	2	6	378462	378467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335621
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4476	NC_020834	CTT	2	6	399580	399585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335642
4477	NC_020834	CAG	2	6	399658	399663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335642
4478	NC_020834	AGT	2	6	399676	399681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335642
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4480	NC_020834	GTT	2	6	399861	399866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335642
4481	NC_020834	GCT	3	9	399867	399875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335642
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