MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 27908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020834	CAT	2	6	446274	446279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335689
5002	NC_020834	GGT	2	6	446304	446309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335689
5003	NC_020834	ATG	2	6	446701	446706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335690
5004	NC_020834	ACA	2	6	446715	446720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335690
5005	NC_020834	GAT	2	6	446898	446903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335690
5006	NC_020834	CAG	2	6	446951	446956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335690
5007	NC_020834	TGG	2	6	447066	447071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335690
5008	NC_020834	TGA	2	6	447099	447104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335690
5009	NC_020834	CAA	2	6	447217	447222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335690
5010	NC_020834	GGC	2	6	447262	447267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335690
5011	NC_020834	TGA	2	6	447471	447476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335690
5012	NC_020834	TGG	2	6	447485	447490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335690
5013	NC_020834	ATG	2	6	447494	447499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335690
5014	NC_020834	GAT	2	6	447811	447816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335690
5015	NC_020834	ATT	2	6	447874	447879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335690
5016	NC_020834	CAA	2	6	447889	447894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335690
5017	NC_020834	ATG	2	6	447902	447907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335690
5018	NC_020834	GAT	2	6	447925	447930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335690
5019	NC_020834	GTG	2	6	448293	448298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335691
5020	NC_020834	GCA	2	6	448349	448354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335691
5021	NC_020834	CAG	2	6	448470	448475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335691
5022	NC_020834	TTA	2	6	448570	448575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335691
5023	NC_020834	TTC	2	6	448592	448597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335691
5024	NC_020834	TCG	2	6	448598	448603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335691
5025	NC_020834	TGA	2	6	448621	448626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335691
5026	NC_020834	GAA	2	6	448631	448636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335691
5027	NC_020834	ATG	2	6	448710	448715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335691
5028	NC_020834	TGG	2	6	448788	448793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335691
5029	NC_020834	GTG	2	6	448937	448942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335691
5030	NC_020834	AGC	2	6	449193	449198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335691
5031	NC_020834	ACC	2	6	449264	449269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335691
5032	NC_020834	TAT	2	6	449278	449283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335691
5033	NC_020834	AGC	2	6	449302	449307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335691
5034	NC_020834	GGC	2	6	449398	449403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335691
5035	NC_020834	TGG	2	6	449520	449525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335691
5036	NC_020834	TTG	2	6	449568	449573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335691
5037	NC_020834	CAA	2	6	449744	449749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335692
5038	NC_020834	TTG	2	6	449805	449810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335692
5039	NC_020834	TGC	2	6	449887	449892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335692
5040	NC_020834	TGA	2	6	449986	449991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335692
5041	NC_020834	GAT	2	6	450010	450015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335692
5042	NC_020834	GCA	2	6	450029	450034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335692
5043	NC_020834	GGT	2	6	450191	450196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335692
5044	NC_020834	TAA	2	6	450298	450303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335692
5045	NC_020834	GTG	2	6	450314	450319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335692
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5049	NC_020834	GTT	2	6	450672	450677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335693
5050	NC_020834	GCG	2	6	450710	450715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335693
5051	NC_020834	GAT	2	6	450790	450795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335693
5052	NC_020834	TTA	2	6	450797	450802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335693
5053	NC_020834	GCA	2	6	450860	450865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335693
5054	NC_020834	ATG	2	6	450972	450977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335693
5055	NC_020834	AAG	2	6	451122	451127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335693
5056	NC_020834	GTG	2	6	451209	451214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335693
5057	NC_020834	GAA	2	6	451235	451240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335693
5058	NC_020834	TGG	2	6	451312	451317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335693
5059	NC_020834	TTA	2	6	451454	451459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335693
5060	NC_020834	TGT	2	6	451570	451575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335693
5061	NC_020834	TGA	2	6	451600	451605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335693
5062	NC_020834	TAT	2	6	451653	451658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335693
5063	NC_020834	TAA	2	6	451939	451944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335694
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5068	NC_020834	GGT	2	6	452350	452355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335695
5069	NC_020834	TAA	2	6	452486	452491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335695
5070	NC_020834	CGT	2	6	452617	452622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335695
5071	NC_020834	ATC	2	6	453146	453151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335696
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5083	NC_020834	ACC	2	6	453914	453919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335697
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5089	NC_020834	ATT	2	6	454477	454482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335697
5090	NC_020834	ACT	2	6	454585	454590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335697
5091	NC_020834	TAG	2	6	454599	454604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335697
5092	NC_020834	TTG	2	6	454717	454722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335697
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5102	NC_020834	TTA	2	6	456128	456133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335698
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5105	NC_020834	TTG	2	6	456735	456740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335699
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5478	NC_020834	CAT	2	6	494151	494156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335731
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