MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 27908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020834	CAT	3	9	87615	87623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335328
1002	NC_020834	CCG	2	6	87694	87699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335328
1003	NC_020834	ACT	2	6	87781	87786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335328
1004	NC_020834	AAG	2	6	87898	87903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335328
1005	NC_020834	GAT	2	6	87927	87932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335328
1006	NC_020834	TCT	2	6	88056	88061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335329
1007	NC_020834	ATG	2	6	88116	88121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335329
1008	NC_020834	GCA	2	6	88185	88190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335329
1009	NC_020834	TCA	2	6	88251	88256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335329
1010	NC_020834	ATC	2	6	88260	88265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335329
1011	NC_020834	TTG	2	6	88307	88312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335329
1012	NC_020834	ACC	2	6	88316	88321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335329
1013	NC_020834	TCT	2	6	88398	88403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335329
1014	NC_020834	CAC	2	6	88760	88765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335329
1015	NC_020834	TGG	2	6	88775	88780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335329
1016	NC_020834	TTC	2	6	88910	88915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335329
1017	NC_020834	AAT	2	6	88977	88982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335329
1018	NC_020834	TGT	2	6	89076	89081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335329
1019	NC_020834	ACA	2	6	89092	89097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335329
1020	NC_020834	TTC	2	6	89156	89161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335329
1021	NC_020834	GAA	2	6	89210	89215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335329
1022	NC_020834	TCA	2	6	89374	89379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335329
1023	NC_020834	GTG	2	6	89772	89777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335330
1024	NC_020834	CAA	2	6	90062	90067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335330
1025	NC_020834	CTG	2	6	90155	90160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335330
1026	NC_020834	ATA	2	6	90321	90326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335331
1027	NC_020834	CAT	2	6	90506	90511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335331
1028	NC_020834	TAA	2	6	90566	90571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335331
1029	NC_020834	TGA	2	6	90609	90614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335331
1030	NC_020834	TAA	2	6	90686	90691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335331
1031	NC_020834	ACC	2	6	91012	91017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335332
1032	NC_020834	CTT	2	6	91056	91061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335332
1033	NC_020834	CTT	2	6	91077	91082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335332
1034	NC_020834	TGT	2	6	91174	91179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335332
1035	NC_020834	CAG	2	6	91218	91223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335332
1036	NC_020834	CTT	2	6	91236	91241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335332
1037	NC_020834	GTA	2	6	91255	91260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335332
1038	NC_020834	AGA	2	6	91284	91289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335332
1039	NC_020834	GGA	2	6	91607	91612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335332
1040	NC_020834	TAA	2	6	91633	91638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335332
1041	NC_020834	TCA	2	6	91680	91685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335332
1042	NC_020834	AAG	2	6	91729	91734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335332
1043	NC_020834	TTG	2	6	91774	91779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335332
1044	NC_020834	AAT	2	6	91811	91816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335332
1045	NC_020834	GCT	2	6	91947	91952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335332
1046	NC_020834	AAT	2	6	91967	91972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335332
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1048	NC_020834	CAA	2	6	92007	92012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335332
1049	NC_020834	GTT	3	9	92022	92030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335332
1050	NC_020834	GAT	2	6	92145	92150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335332
1051	NC_020834	TGG	2	6	92199	92204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335332
1052	NC_020834	CAC	2	6	92205	92210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335332
1053	NC_020834	TAT	2	6	92427	92432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335333
1054	NC_020834	CTT	2	6	92476	92481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335333
1055	NC_020834	ACC	3	9	92867	92875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335333
1056	NC_020834	AAC	2	6	92920	92925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335333
1057	NC_020834	TCT	2	6	92934	92939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335333
1058	NC_020834	CGC	2	6	93011	93016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335333
1059	NC_020834	TAA	2	6	93134	93139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335333
1060	NC_020834	AAC	2	6	93147	93152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335333
1061	NC_020834	GCA	2	6	93300	93305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335333
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1065	NC_020834	CAC	2	6	93398	93403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335333
1066	NC_020834	CTT	2	6	93469	93474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335333
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1070	NC_020834	CTT	2	6	93754	93759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335333
1071	NC_020834	AGC	3	9	93818	93826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335333
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1073	NC_020834	TGG	2	6	94006	94011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335333
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1081	NC_020834	CGG	2	6	95031	95036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335335
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1085	NC_020834	TGC	2	6	95470	95475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335336
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1089	NC_020834	GGT	3	9	95648	95656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335336
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1093	NC_020834	TGG	2	6	96412	96417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335336
1094	NC_020834	TAT	2	6	96495	96500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335336
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1098	NC_020834	TAA	2	6	96982	96987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335336
1099	NC_020834	TGG	2	6	97054	97059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335336
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1101	NC_020834	ATT	2	6	97159	97164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335336
1102	NC_020834	CTT	2	6	97212	97217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335336
1103	NC_020834	AAC	2	6	97233	97238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335336
1104	NC_020834	ACC	2	6	97260	97265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335336
1105	NC_020834	TTG	2	6	97269	97274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335336
1106	NC_020834	TTC	2	6	97298	97303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335336
1107	NC_020834	GAT	2	6	97394	97399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335336
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1109	NC_020834	AAT	2	6	97678	97683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335337
1110	NC_020834	TAA	2	6	97686	97691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335337
1111	NC_020834	TCT	2	6	97760	97765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335337
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1117	NC_020834	TCA	2	6	98082	98087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335338
1118	NC_020834	CAA	2	6	98420	98425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335339
1119	NC_020834	CAA	2	6	98441	98446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335339
1120	NC_020834	GAA	2	6	98522	98527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335339
1121	NC_020834	GAA	2	6	98567	98572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335339
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1123	NC_020834	GCA	2	6	98672	98677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335339
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1244	NC_020834	ATC	2	6	113085	113090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335354
1245	NC_020834	TGG	2	6	113146	113151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335354
1246	NC_020834	CGT	2	6	113322	113327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335355
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1363	NC_020834	ACC	2	6	123018	123023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335367
1364	NC_020834	CTG	2	6	123038	123043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335367
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1366	NC_020834	GGC	2	6	123597	123602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335367
1367	NC_020834	GTG	2	6	123652	123657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335367
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1463	NC_020834	AAT	2	6	131536	131541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335377
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1482	NC_020834	AGT	2	6	133345	133350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335378
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1484	NC_020834	TGG	2	6	133816	133821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335379
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